Protein–RNA interactions for Protein: Q13434

MKRN4P, Putative E3 ubiquitin-protein ligase makorin-4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 485 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MKRN4PQ13434 MTND4P25-201ENST00000441039 533 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
MKRN4PQ13434 MTCO2P6-201ENST00000463134 685 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
MKRN4PQ13434 SNHG12-210ENST00000483436 682 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
MKRN4PQ13434 AC106791.1-201ENST00000514616 827 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
MKRN4PQ13434 AC022826.1-201ENST00000519383 805 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
MKRN4PQ13434 MTCO1P4-201ENST00000520516 1409 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
MKRN4PQ13434 AC009686.1-201ENST00000522494 364 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
MKRN4PQ13434 PCMTD1-207ENST00000522514 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
MKRN4PQ13434 CTSB-219ENST00000530640 1389 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
MKRN4PQ13434 AC008750.2-202ENST00000532688 729 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
MKRN4PQ13434 GNAL-204ENST00000535121 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
MKRN4PQ13434 KDM6A-211ENST00000536777 5633 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
MKRN4PQ13434 SPATA21-205ENST00000540400 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
MKRN4PQ13434 AC124283.3-201ENST00000570869 594 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
MKRN4PQ13434 SHBG-212ENST00000575314 1146 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
MKRN4PQ13434 PPP1R1B-205ENST00000579000 1466 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
MKRN4PQ13434 AC003991.1-203ENST00000591739 719 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
MKRN4PQ13434 AC011497.1-201ENST00000596781 561 ntTSL 4 BASIC17.34■□□□□ 0.37
MKRN4PQ13434 AC005785.1-202ENST00000597164 237 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
MKRN4PQ13434 AC097504.2-201ENST00000608088 454 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
MKRN4PQ13434 TMEM222-211ENST00000611517 1613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
MKRN4PQ13434 MIR6787-201ENST00000616675 61 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
MKRN4PQ13434 GABRB3-215ENST00000622697 5876 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
MKRN4PQ13434 CU634019.7-201ENST00000624153 1185 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
MKRN4PQ13434 C8orf89-202ENST00000624510 658 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
MKRN4PQ13434 FP236241.2-201ENST00000624906 1185 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
MKRN4PQ13434 SOCS7-201ENST00000612932 7857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
MKRN4PQ13434 NUS1-201ENST00000368494 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
MKRN4PQ13434 ELFN1-202ENST00000561626 3742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
MKRN4PQ13434 SYNRG-222ENST00000614941 3406 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
MKRN4PQ13434 ARHGEF10-201ENST00000349830 5590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
MKRN4PQ13434 PIPOX-201ENST00000323372 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
MKRN4PQ13434 AC012485.3-201ENST00000637634 2424 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
MKRN4PQ13434 SLC5A6-203ENST00000408041 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
MKRN4PQ13434 TSEN2-207ENST00000454502 1909 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
MKRN4PQ13434 BMP2K-201ENST00000335016 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
MKRN4PQ13434 RBFOX2-201ENST00000262829 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
MKRN4PQ13434 ARHGEF40-201ENST00000298694 5919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
MKRN4PQ13434 RAB38-201ENST00000243662 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
MKRN4PQ13434 SLK-202ENST00000369755 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
MKRN4PQ13434 MIOX-201ENST00000216075 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
MKRN4PQ13434 NCR1-201ENST00000291890 1155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
MKRN4PQ13434 UBE2G2-201ENST00000330942 721 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
MKRN4PQ13434 NCR1-202ENST00000338835 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
MKRN4PQ13434 NCR1-203ENST00000350790 739 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
MKRN4PQ13434 GSTO1-201ENST00000369710 900 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
MKRN4PQ13434 KRTAP10-2-201ENST00000391621 1149 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.36
MKRN4PQ13434 MDP1-202ENST00000396833 582 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
MKRN4PQ13434 RSL24D1P1-201ENST00000404972 493 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
MKRN4PQ13434 PEX13-203ENST00000414712 1014 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
MKRN4PQ13434 CPB2-AS1-201ENST00000415033 747 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
MKRN4PQ13434 LINC01945-201ENST00000419784 840 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
MKRN4PQ13434 Z82214.2-201ENST00000420269 531 ntTSL 4 BASIC17.33■□□□□ 0.36
MKRN4PQ13434 USB1-202ENST00000423271 1217 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
MKRN4PQ13434 METTL21A-209ENST00000448823 869 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
MKRN4PQ13434 CYCSP53-201ENST00000455540 265 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
MKRN4PQ13434 KLC4-205ENST00000458460 1251 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
MKRN4PQ13434 MEF2C-AS1-206ENST00000511100 828 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
MKRN4PQ13434 RNA5SP412-201ENST00000516234 123 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
MKRN4PQ13434 AC018541.1-202ENST00000518687 584 ntTSL 4 BASIC17.33■□□□□ 0.36
MKRN4PQ13434 AC131254.2-201ENST00000521908 550 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
MKRN4PQ13434 ACRV1-202ENST00000527795 782 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
MKRN4PQ13434 FAM8A2P-201ENST00000528813 1142 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
MKRN4PQ13434 ZFAND6-208ENST00000558688 780 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
MKRN4PQ13434 ZNF83-215ENST00000600714 810 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
MKRN4PQ13434 AL133406.3-201ENST00000606817 541 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
MKRN4PQ13434 AF230666.1-202ENST00000608375 870 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
MKRN4PQ13434 ZNF365-211ENST00000614806 877 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
MKRN4PQ13434 APOBEC3A-205ENST00000618553 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
MKRN4PQ13434 CCDC136-212ENST00000487361 2268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
MKRN4PQ13434 RUNX2-204ENST00000371438 5698 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
MKRN4PQ13434 SLC34A2-202ENST00000503434 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
MKRN4PQ13434 AL445931.1-201ENST00000412181 2112 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
MKRN4PQ13434 HAUS3-204ENST00000506763 3166 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
MKRN4PQ13434 SURF4-202ENST00000371989 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
MKRN4PQ13434 DRG2-201ENST00000225729 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
MKRN4PQ13434 PPP2R5D-202ENST00000394110 2894 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
MKRN4PQ13434 CDK11B-204ENST00000407249 2677 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
MKRN4PQ13434 UCHL5-206ENST00000367455 5327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
MKRN4PQ13434 AL136379.1-201ENST00000623471 2642 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
MKRN4PQ13434 ALOX12-AS1-201ENST00000399540 1730 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
MKRN4PQ13434 ZXDC-202ENST00000389709 3405 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
MKRN4PQ13434 SCAF8-201ENST00000367178 5057 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
MKRN4PQ13434 MUTYH-211ENST00000456914 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
MKRN4PQ13434 MAPT-205ENST00000351559 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
MKRN4PQ13434 LGR6-205ENST00000439764 2487 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
MKRN4PQ13434 PRAL-201ENST00000624952 3286 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
MKRN4PQ13434 EIF2B4-205ENST00000445933 1608 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
MKRN4PQ13434 GIT2-220ENST00000553118 2424 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
MKRN4PQ13434 PAQR6-214ENST00000613336 1599 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
MKRN4PQ13434 DACT3-203ENST00000410105 3085 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
MKRN4PQ13434 FBP1-203ENST00000415431 1487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
MKRN4PQ13434 SIX6-201ENST00000327720 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
MKRN4PQ13434 DHPS-201ENST00000210060 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
MKRN4PQ13434 HTR1B-201ENST00000369947 2021 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
MKRN4PQ13434 TUBGCP2-204ENST00000417178 4029 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
MKRN4PQ13434 AC144831.1-201ENST00000573312 2656 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
MKRN4PQ13434 TMED1-201ENST00000214869 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
MKRN4PQ13434 PRAG1-202ENST00000622241 4639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
MKRN4PQ13434 SCPEP1-201ENST00000262288 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
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