Protein–RNA interactions for Protein: Q13326

SGCG, Gamma-sarcoglycan, humanhuman

Predictions only

Length 291 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCGQ13326 NME6-203ENST00000415644 849 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
SGCGQ13326 PRKG1-AS1-201ENST00000420193 971 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
SGCGQ13326 LINC01840-201ENST00000421870 571 ntTSL 4 BASIC14.99□□□□□ -0.01
SGCGQ13326 AL451065.1-201ENST00000428958 238 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
SGCGQ13326 AL589986.1-201ENST00000429230 789 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
SGCGQ13326 RGS5-214ENST00000429865 754 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
SGCGQ13326 AC006033.1-201ENST00000440505 426 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
SGCGQ13326 NCK2-206ENST00000522586 490 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
SGCGQ13326 CD74-212ENST00000524315 584 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
SGCGQ13326 ACYP1-206ENST00000555694 565 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
SGCGQ13326 AC129510.1-201ENST00000579979 555 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
SGCGQ13326 IFT20-214ENST00000585089 1071 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
SGCGQ13326 PRCD-210ENST00000592014 462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
SGCGQ13326 LINC02028-216ENST00000609015 732 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
SGCGQ13326 DIO1-215ENST00000610607 796 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
SGCGQ13326 ABCG5-202ENST00000405322 2896 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
SGCGQ13326 CBX3-203ENST00000409747 1717 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
SGCGQ13326 TUBB4A-201ENST00000264071 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
SGCGQ13326 NPC1L1-203ENST00000423141 2554 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
SGCGQ13326 ARFGAP2-202ENST00000426335 2937 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
SGCGQ13326 PUDP-202ENST00000412827 1376 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
SGCGQ13326 LILRP1-201ENST00000444199 1370 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
SGCGQ13326 LSP1-204ENST00000406638 2640 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
SGCGQ13326 ARFIP1-204ENST00000429148 1599 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
SGCGQ13326 NLRX1-202ENST00000409109 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
SGCGQ13326 ZMYND10-202ENST00000360165 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
SGCGQ13326 APBA1-201ENST00000265381 6534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
SGCGQ13326 MYZAP-202ENST00000380565 2181 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
SGCGQ13326 PICALM-204ENST00000526033 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
SGCGQ13326 SRGAP2B-207ENST00000641863 2367 ntAPPRIS P5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
SGCGQ13326 PGA5-201ENST00000312403 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
SGCGQ13326 UGGT2-204ENST00000397618 1547 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
SGCGQ13326 NAF1-201ENST00000274054 1907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
SGCGQ13326 PIMREG-205ENST00000572447 1948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
SGCGQ13326 ADAM15-208ENST00000447332 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
SGCGQ13326 ZNF331-217ENST00000512387 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
SGCGQ13326 ZNF764-201ENST00000252797 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
SGCGQ13326 MICAL3-206ENST00000441493 9445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
SGCGQ13326 FBLN1-202ENST00000327858 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
SGCGQ13326 SLC43A2-202ENST00000412517 1658 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
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SGCGQ13326 C1orf123-201ENST00000294360 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
SGCGQ13326 GTSF1-201ENST00000305879 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
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SGCGQ13326 AC099548.2-209ENST00000480264 625 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
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SGCGQ13326 THAP4-206ENST00000612200 969 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
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SGCGQ13326 AC131160.1-201ENST00000639401 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
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SGCGQ13326 YPEL1-201ENST00000339468 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
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SGCGQ13326 DBN1-202ENST00000309007 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
SGCGQ13326 ALOX15-205ENST00000574640 2422 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
SGCGQ13326 GNB2-202ENST00000393924 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
SGCGQ13326 ROBO3-201ENST00000397801 4569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
SGCGQ13326 LINC00658-202ENST00000420529 1542 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
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SGCGQ13326 RGS6-218ENST00000556437 1689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
SGCGQ13326 NOTO-201ENST00000398468 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
SGCGQ13326 DCAF11-217ENST00000559115 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
SGCGQ13326 STXBP6-201ENST00000323944 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
SGCGQ13326 CRLS1-203ENST00000452938 3859 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
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SGCGQ13326 NEU2-201ENST00000233840 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
SGCGQ13326 MRPL34-201ENST00000252602 968 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
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SGCGQ13326 ZNF746-201ENST00000340622 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
SGCGQ13326 LAMTOR4-201ENST00000341942 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
SGCGQ13326 KRTAP10-13P-201ENST00000412914 571 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
SGCGQ13326 LIMS4-201ENST00000413601 1215 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
SGCGQ13326 GPAA1P2-201ENST00000417923 928 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
SGCGQ13326 LINC00472-203ENST00000426635 2958 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
SGCGQ13326 PTPA-218ENST00000435132 618 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
SGCGQ13326 AL355994.3-201ENST00000437156 466 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
SGCGQ13326 C14orf178-202ENST00000439131 632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
SGCGQ13326 RPL35A-205ENST00000448864 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
SGCGQ13326 MAATS1-203ENST00000463700 939 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
SGCGQ13326 APOA2-204ENST00000464492 530 ntTSL 3 BASIC14.97□□□□□ -0.01
SGCGQ13326 ATP6V0CP2-201ENST00000469409 207 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
SGCGQ13326 AC138123.2-203ENST00000552451 653 ntTSL 3 BASIC14.97□□□□□ -0.01
SGCGQ13326 AP000845.1-201ENST00000581677 2131 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
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