Protein–RNA interactions for Protein: Q13263

TRIM28, Transcription intermediary factor 1-beta, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 835 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM28Q13263 ANKMY2-201ENST00000306999 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TRIM28Q13263 DCLK2-201ENST00000296550 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TRIM28Q13263 C19orf57-201ENST00000346736 2489 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TRIM28Q13263 MVK-214ENST00000629016 1591 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TRIM28Q13263 KRT8P21-201ENST00000430398 1491 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
TRIM28Q13263 PPP1R26-202ENST00000401470 4769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TRIM28Q13263 F11R-206ENST00000621309 4770 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TRIM28Q13263 TLL1-206ENST00000513213 1829 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TRIM28Q13263 MBD1-209ENST00000398495 2178 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TRIM28Q13263 NIT1-203ENST00000368009 1362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TRIM28Q13263 AL136172.1-201ENST00000598590 1394 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
TRIM28Q13263 ZNF79-201ENST00000342483 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TRIM28Q13263 DPCD-202ENST00000370151 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TRIM28Q13263 GAD1-203ENST00000375272 1252 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TRIM28Q13263 UQCRQ-203ENST00000378670 839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TRIM28Q13263 KRTAP2-4-201ENST00000394015 764 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TRIM28Q13263 LBH-202ENST00000401506 485 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TRIM28Q13263 KRT18P36-201ENST00000411618 1276 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
TRIM28Q13263 AC007274.2-201ENST00000421675 662 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
TRIM28Q13263 PTPA-217ENST00000434095 870 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TRIM28Q13263 AC008443.1-201ENST00000511331 1000 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TRIM28Q13263 HOXA10-AS-202ENST00000519935 1161 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TRIM28Q13263 HDAC2-AS2-213ENST00000520891 603 ntTSL 4 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TRIM28Q13263 AP002387.1-201ENST00000529369 680 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TRIM28Q13263 AC003686.1-201ENST00000550956 1034 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
TRIM28Q13263 RBM8B-201ENST00000555532 525 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
TRIM28Q13263 TBC1D16-203ENST00000570373 961 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TRIM28Q13263 FAM236A-201ENST00000593662 453 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TRIM28Q13263 FAM236B-201ENST00000596535 465 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TRIM28Q13263 DDX5-235ENST00000630471 473 ntTSL 4 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TRIM28Q13263 AC006453.1-201ENST00000636037 1257 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
TRIM28Q13263 AC128714.1-201ENST00000637035 887 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
TRIM28Q13263 ACSL1-202ENST00000454703 3636 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TRIM28Q13263 BX005266.2-201ENST00000450704 1549 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TRIM28Q13263 CDH15-201ENST00000289746 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TRIM28Q13263 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TRIM28Q13263 SGCE-204ENST00000428696 1409 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TRIM28Q13263 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TRIM28Q13263 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TRIM28Q13263 SUSD4-202ENST00000343846 3480 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TRIM28Q13263 DIABLO-201ENST00000267169 1316 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TRIM28Q13263 TMEM106A-202ENST00000541594 1330 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TRIM28Q13263 DYRK1A-203ENST00000398956 1590 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TRIM28Q13263 C12orf76-209ENST00000615315 1580 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TRIM28Q13263 ARVCF-204ENST00000406522 2682 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TRIM28Q13263 TNIP1-202ENST00000389378 2935 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TRIM28Q13263 GRAMD1A-211ENST00000599564 2825 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TRIM28Q13263 FAS-202ENST00000352159 1722 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TRIM28Q13263 TMEM25-206ENST00000442938 2228 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TRIM28Q13263 AC100803.3-201ENST00000606664 2961 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TRIM28Q13263 TCP10-201ENST00000366827 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TRIM28Q13263 GLB1L2-201ENST00000339772 3152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TRIM28Q13263 SMPDL3B-201ENST00000373888 1548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TRIM28Q13263 FCRLB-201ENST00000336830 1193 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TRIM28Q13263 FCRLB-202ENST00000367944 1172 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TRIM28Q13263 FCRLB-203ENST00000367945 1131 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TRIM28Q13263 AC131097.3-203ENST00000420272 1193 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TRIM28Q13263 TMEM243-202ENST00000423734 601 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TRIM28Q13263 AP1B1P1-201ENST00000432373 827 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TRIM28Q13263 DLGAP4-AS1-202ENST00000433238 593 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TRIM28Q13263 AC005234.1-201ENST00000457851 434 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TRIM28Q13263 NAT9-212ENST00000581136 1011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TRIM28Q13263 RN7SL190P-201ENST00000582519 257 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
TRIM28Q13263 AC011825.3-201ENST00000583184 565 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TRIM28Q13263 HIST1H4A-201ENST00000617569 312 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TRIM28Q13263 SLC22A7-202ENST00000372585 2555 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TRIM28Q13263 OSBP2-209ENST00000438716 2747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TRIM28Q13263 HDAC11-214ENST00000446613 2875 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TRIM28Q13263 CENPT-202ENST00000440851 2200 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TRIM28Q13263 PRAG1-202ENST00000622241 4639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TRIM28Q13263 SYN1-202ENST00000340666 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TRIM28Q13263 DLK1-201ENST00000331224 1324 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TRIM28Q13263 UBXN11-207ENST00000374223 1312 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TRIM28Q13263 ZCCHC17-204ENST00000546109 1705 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TRIM28Q13263 R3HDM2P2-201ENST00000401880 2116 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
TRIM28Q13263 SLC51A-201ENST00000296327 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
TRIM28Q13263 FAM109A-203ENST00000547838 2846 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TRIM28Q13263 PIGT-246ENST00000639499 2021 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TRIM28Q13263 NRXN1-209ENST00000405581 5078 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TRIM28Q13263 ULK4-203ENST00000420927 1904 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TRIM28Q13263 RNF32-202ENST00000317955 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TRIM28Q13263 NLGN2-201ENST00000302926 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TRIM28Q13263 PDE8B-204ENST00000342343 2677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TRIM28Q13263 VIPR1-217ENST00000543411 2681 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TRIM28Q13263 TMEM189-203ENST00000371656 1973 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TRIM28Q13263 RHOXF1-201ENST00000217999 769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TRIM28Q13263 COL5A1-AS1-201ENST00000371813 336 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TRIM28Q13263 CAMKMT-203ENST00000403853 1114 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TRIM28Q13263 CD8A-204ENST00000409781 597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TRIM28Q13263 APOL3-207ENST00000424878 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TRIM28Q13263 HLA-DPB2-205ENST00000435074 1188 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
TRIM28Q13263 AC073150.1-201ENST00000450406 1084 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
TRIM28Q13263 BX324167.1-201ENST00000451118 805 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TRIM28Q13263 AC135178.1-201ENST00000458568 537 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TRIM28Q13263 BCAR3-210ENST00000539242 2114 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TRIM28Q13263 NAA40-206ENST00000542163 1035 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TRIM28Q13263 PSORS1C1-206ENST00000547221 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TRIM28Q13263 ACP7-202ENST00000594229 1149 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TRIM28Q13263 AC008743.1-201ENST00000596350 813 ntTSL 4 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TRIM28Q13263 ZNF772-207ENST00000601768 482 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
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