Protein–RNA interactions for Protein: Q12983

BNIP3, BCL2/adenovirus E1B 19 kDa protein-interacting protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 259 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BNIP3Q12983 ELP6-201ENST00000296149 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
BNIP3Q12983 ERP29-203ENST00000546477 1698 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
BNIP3Q12983 SMARCD2-202ENST00000323347 1935 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
BNIP3Q12983 RHOC-201ENST00000285735 2199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
BNIP3Q12983 PCDHGB1-202ENST00000611598 2592 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
BNIP3Q12983 CRY2-201ENST00000417225 2053 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
BNIP3Q12983 SLC39A9-209ENST00000556605 2065 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
BNIP3Q12983 AC007292.2-201ENST00000593524 1812 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
BNIP3Q12983 HPSE-206ENST00000512196 1571 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
BNIP3Q12983 NUP58-201ENST00000381718 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
BNIP3Q12983 FYCO1-205ENST00000535325 8578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
BNIP3Q12983 TRAF3-202ENST00000351691 2239 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
BNIP3Q12983 TRIP10-210ENST00000600428 2249 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
BNIP3Q12983 MAX-204ENST00000358402 1973 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
BNIP3Q12983 FBXO44-204ENST00000376762 1734 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
BNIP3Q12983 ASF1A-201ENST00000229595 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
BNIP3Q12983 SHANK2-204ENST00000409530 2123 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
BNIP3Q12983 MSH5-203ENST00000375750 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
BNIP3Q12983 TGIF2-202ENST00000373874 3432 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
BNIP3Q12983 AMPD3-203ENST00000396554 3806 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
BNIP3Q12983 KCNT1-207ENST00000487664 3845 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
BNIP3Q12983 AADAT-201ENST00000337664 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
BNIP3Q12983 KIAA1683-209ENST00000612316 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
BNIP3Q12983 MFSD5-202ENST00000534842 2038 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
BNIP3Q12983 TAF15-205ENST00000603777 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
BNIP3Q12983 TEAD4-203ENST00000397122 1396 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
BNIP3Q12983 GLIDR-204ENST00000638724 1765 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
BNIP3Q12983 ACIN1-203ENST00000357481 2563 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
BNIP3Q12983 SYBU-219ENST00000528647 2995 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
BNIP3Q12983 PRR19-201ENST00000341747 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
BNIP3Q12983 PPP1R16A-201ENST00000292539 2722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
BNIP3Q12983 ATXN10-202ENST00000381061 3135 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
BNIP3Q12983 MAP4-202ENST00000360240 5142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
BNIP3Q12983 SLC11A2-204ENST00000541174 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
BNIP3Q12983 NDRG2-209ENST00000397853 2079 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
BNIP3Q12983 CD79A-201ENST00000221972 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
BNIP3Q12983 EIF4EBP3-201ENST00000310331 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
BNIP3Q12983 CSHL1-203ENST00000346606 659 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
BNIP3Q12983 GNG5-201ENST00000370641 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
BNIP3Q12983 AC007952.1-202ENST00000399083 1173 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
BNIP3Q12983 C17orf51-202ENST00000412778 877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
BNIP3Q12983 KRT8P13-201ENST00000463294 1010 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
BNIP3Q12983 AAMDC-206ENST00000526415 579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
BNIP3Q12983 AC068473.4-201ENST00000587527 585 ntTSL 4 BASIC15.14■□□□□ 0.01
BNIP3Q12983 TBCB-211ENST00000589996 724 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
BNIP3Q12983 KLK3-211ENST00000597483 810 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
BNIP3Q12983 PRKN-211ENST00000615065 261 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
BNIP3Q12983 AL160412.1-202ENST00000616819 663 ntTSL 4 BASIC15.14■□□□□ 0.01
BNIP3Q12983 ETV2-208ENST00000621247 941 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
BNIP3Q12983 AC106017.2-201ENST00000631194 1173 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
BNIP3Q12983 MMRN2-201ENST00000372027 4375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
BNIP3Q12983 SBF1-201ENST00000348911 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
BNIP3Q12983 SNAP47-203ENST00000366760 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
BNIP3Q12983 CLDND1-222ENST00000510545 2124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
BNIP3Q12983 LZTS1-201ENST00000265801 5459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
BNIP3Q12983 DNM1-201ENST00000341179 3254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
BNIP3Q12983 UBR5-207ENST00000520539 10297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
BNIP3Q12983 SLC4A7-210ENST00000440156 4120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
BNIP3Q12983 GNS-201ENST00000258145 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
BNIP3Q12983 NTMT1-204ENST00000372486 1487 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
BNIP3Q12983 AC079781.5-202ENST00000641784 3743 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
BNIP3Q12983 LINC00667-206ENST00000582363 2935 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
BNIP3Q12983 SLC35C2-204ENST00000372230 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
BNIP3Q12983 UBAP1-202ENST00000359544 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
BNIP3Q12983 PSMC3-209ENST00000530912 1390 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
BNIP3Q12983 SAFB-205ENST00000588852 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
BNIP3Q12983 MYOZ1-201ENST00000359322 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
BNIP3Q12983 C8orf49-201ENST00000525043 1968 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
BNIP3Q12983 CPEB1-211ENST00000615198 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
BNIP3Q12983 MAP3K12-201ENST00000267079 4319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
BNIP3Q12983 RAP1GAP2-209ENST00000637138 3175 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
BNIP3Q12983 TMTC1-206ENST00000551659 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
BNIP3Q12983 C1orf123-201ENST00000294360 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
BNIP3Q12983 ZNRD1-201ENST00000332435 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
BNIP3Q12983 WDR20-203ENST00000335263 2616 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
BNIP3Q12983 SLC44A2-201ENST00000335757 3671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
BNIP3Q12983 GABRA5-202ENST00000355395 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
BNIP3Q12983 NDUFA3-203ENST00000391763 338 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
BNIP3Q12983 RBAK-RBAKDN-201ENST00000396904 766 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC15.13■□□□□ 0.01
BNIP3Q12983 RBAK-RBAKDN-202ENST00000407184 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
BNIP3Q12983 BTBD6P1-201ENST00000412176 1267 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
BNIP3Q12983 ARFGAP2-202ENST00000426335 2937 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
BNIP3Q12983 NSUN5P1-204ENST00000428392 1562 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
BNIP3Q12983 DGCR5-204ENST00000440005 1299 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
BNIP3Q12983 LRRC74B-201ENST00000442047 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
BNIP3Q12983 APOPT1-207ENST00000477116 906 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
BNIP3Q12983 FHIT-208ENST00000492590 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
BNIP3Q12983 BTNL8-205ENST00000505126 1294 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
BNIP3Q12983 RNA5SP486-201ENST00000515961 83 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
BNIP3Q12983 FAM92B-201ENST00000539556 1898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
BNIP3Q12983 DIO3OS-203ENST00000554441 1068 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
BNIP3Q12983 AC090825.1-203ENST00000558188 582 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
BNIP3Q12983 AL022328.3-201ENST00000607943 679 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
BNIP3Q12983 SRD5A3-201ENST00000264228 4190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
BNIP3Q12983 ATRNL1-201ENST00000355044 8479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
BNIP3Q12983 SGCZ-201ENST00000382080 2234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
BNIP3Q12983 KCTD3-201ENST00000259154 3931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
BNIP3Q12983 MCL1-202ENST00000369026 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
BNIP3Q12983 RPS6KL1-210ENST00000555647 3309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
BNIP3Q12983 TMED1-201ENST00000214869 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
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