Protein–RNA interactions for Protein: Q12923

PTPN13, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 13, humanhuman

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Length 2,485 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN13Q12923 AC226150.1-201ENST00000544259 466 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
PTPN13Q12923 AC092756.1-201ENST00000560248 448 ntTSL 3 BASIC12.89□□□□□ -0.35
PTPN13Q12923 NRN1L-202ENST00000576147 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
PTPN13Q12923 TMEM98-205ENST00000578289 806 ntTSL 3 BASIC12.89□□□□□ -0.35
PTPN13Q12923 PRKACA-208ENST00000589994 1127 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
PTPN13Q12923 AC242426.4-201ENST00000606856 573 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
PTPN13Q12923 AP000769.1-203ENST00000637245 208 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
PTPN13Q12923 PSEN2-203ENST00000422240 1947 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
PTPN13Q12923 MPDU1-201ENST00000250124 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
PTPN13Q12923 KLK3-216ENST00000617027 1341 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
PTPN13Q12923 ME2-201ENST00000321341 9415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
PTPN13Q12923 PXN-201ENST00000228307 3785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
PTPN13Q12923 SLC25A3-216ENST00000551917 1359 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
PTPN13Q12923 FTX-216ENST00000638985 1367 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
PTPN13Q12923 SEPT8-212ENST00000458488 1726 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
PTPN13Q12923 ZAP70-201ENST00000264972 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
PTPN13Q12923 KLC1-212ENST00000553286 3135 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
PTPN13Q12923 FSTL3-206ENST00000592947 2144 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
PTPN13Q12923 KRT32-201ENST00000225899 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
PTPN13Q12923 TGFB1I1-214ENST00000567607 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
PTPN13Q12923 ZFP36-203ENST00000597629 1786 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
PTPN13Q12923 BCCIP-203ENST00000368759 1433 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
PTPN13Q12923 GCKR-201ENST00000264717 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
PTPN13Q12923 C5orf24-204ENST00000504727 2923 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
PTPN13Q12923 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
PTPN13Q12923 HPN-201ENST00000262626 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
PTPN13Q12923 CRHR2-202ENST00000348438 1600 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
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PTPN13Q12923 TRPV4-207ENST00000541794 2475 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
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PTPN13Q12923 HIST1H2BF-201ENST00000356530 1196 ntAPPRIS P1 BASIC12.89□□□□□ -0.35
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PTPN13Q12923 AC103923.1-201ENST00000453229 1228 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
PTPN13Q12923 AC004893.2-203ENST00000482799 796 ntTSL 3 BASIC12.89□□□□□ -0.35
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PTPN13Q12923 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
PTPN13Q12923 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
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PTPN13Q12923 C2orf70-201ENST00000329615 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
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PTPN13Q12923 TRBV4-2-201ENST00000390392 455 ntAPPRIS P1 BASIC12.88□□□□□ -0.35
PTPN13Q12923 ACYP2-204ENST00000422521 1115 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
PTPN13Q12923 SOD2-205ENST00000444946 917 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
PTPN13Q12923 PPIA-208ENST00000489459 907 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
PTPN13Q12923 CDC23-208ENST00000505120 455 ntTSL 3 BASIC12.88□□□□□ -0.35
PTPN13Q12923 LINC00824-204ENST00000520766 597 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
PTPN13Q12923 AL157871.1-201ENST00000555428 429 ntTSL 3 BASIC12.88□□□□□ -0.35
PTPN13Q12923 GLIS2-AS1-201ENST00000576080 340 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
PTPN13Q12923 PPIA-210ENST00000620047 827 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
PTPN13Q12923 C1orf232-202ENST00000635463 466 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
PTPN13Q12923 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
PTPN13Q12923 EPHA2-201ENST00000358432 3964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
PTPN13Q12923 ANXA8L1-202ENST00000611655 1398 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
PTPN13Q12923 IL12A-201ENST00000305579 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
PTPN13Q12923 GNG4-201ENST00000366597 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
PTPN13Q12923 MSI2-206ENST00000579180 1635 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
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