Protein–RNA interactions for Protein: Q12805

EFEMP1, EGF-containing fibulin-like extracellular matrix protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 493 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFEMP1Q12805 DHRS7C-202ENST00000571134 984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
EFEMP1Q12805 RN7SL560P-201ENST00000577943 264 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
EFEMP1Q12805 AC025048.1-201ENST00000592317 542 ntTSL 4 BASIC15.68■□□□□ 0.1
EFEMP1Q12805 STXBP2-221ENST00000602355 716 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
EFEMP1Q12805 LINC01002-220ENST00000632790 449 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
EFEMP1Q12805 AC006453.2-202ENST00000635968 827 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
EFEMP1Q12805 TRPC4AP-201ENST00000252015 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
EFEMP1Q12805 ASH2L-212ENST00000545394 2808 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
EFEMP1Q12805 KCNK4-TEX40-201ENST00000539086 2733 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
EFEMP1Q12805 ADD2-208ENST00000430656 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
EFEMP1Q12805 SYNGR2-207ENST00000590201 2239 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
EFEMP1Q12805 RRBP1-204ENST00000377813 5041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
EFEMP1Q12805 TRAK1-208ENST00000484786 2008 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
EFEMP1Q12805 CRELD1-203ENST00000397170 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
EFEMP1Q12805 FGF7P3-202ENST00000640245 1707 ntTSL 4 BASIC15.68■□□□□ 0.1
EFEMP1Q12805 AC011270.2-201ENST00000624293 2550 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
EFEMP1Q12805 CNGB1-201ENST00000251102 5641 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
EFEMP1Q12805 PDE1B-201ENST00000243052 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
EFEMP1Q12805 WDTC1-202ENST00000361771 4275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
EFEMP1Q12805 KLK5-202ENST00000391809 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
EFEMP1Q12805 MIF4GD-208ENST00000579297 1419 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
EFEMP1Q12805 LRCH3-202ENST00000414675 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
EFEMP1Q12805 ESPNL-201ENST00000343063 4836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
EFEMP1Q12805 KIAA1211-203ENST00000504228 4628 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
EFEMP1Q12805 SHROOM4-201ENST00000289292 6261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
EFEMP1Q12805 MYLK3-201ENST00000394809 6911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
EFEMP1Q12805 MIR600HG-201ENST00000449175 5984 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
EFEMP1Q12805 OTUD6A-201ENST00000338352 1689 ntAPPRIS P1 BASIC15.67■□□□□ 0.1
EFEMP1Q12805 ZBTB37-203ENST00000367704 2323 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
EFEMP1Q12805 DUS2-207ENST00000565263 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
EFEMP1Q12805 TMEM170A-207ENST00000569540 2331 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
EFEMP1Q12805 PDZD3-212ENST00000531114 2996 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
EFEMP1Q12805 CLEC16A-203ENST00000409790 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
EFEMP1Q12805 ITPRIPL2-201ENST00000381440 7247 ntAPPRIS P1 BASIC15.67■□□□□ 0.1
EFEMP1Q12805 MAGEA2-209ENST00000623806 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
EFEMP1Q12805 ARHGAP39-201ENST00000276826 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
EFEMP1Q12805 ZBED1P1-201ENST00000502364 1930 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
EFEMP1Q12805 NANOS1-202ENST00000425699 4017 ntAPPRIS P2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
EFEMP1Q12805 JAKMIP1-205ENST00000410077 1835 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
EFEMP1Q12805 DDIAS-203ENST00000525361 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
EFEMP1Q12805 ANGPTL8-201ENST00000252453 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
EFEMP1Q12805 CIDEC-201ENST00000336832 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
EFEMP1Q12805 CSAG1-202ENST00000370287 875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
EFEMP1Q12805 AL157392.1-201ENST00000412388 373 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
EFEMP1Q12805 CIDEC-203ENST00000423850 1036 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
EFEMP1Q12805 C9orf116-205ENST00000429260 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
EFEMP1Q12805 AL592464.1-201ENST00000429389 429 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
EFEMP1Q12805 KLK4-202ENST00000431178 481 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
EFEMP1Q12805 VGLL4-214ENST00000451674 938 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
EFEMP1Q12805 CIDEC-206ENST00000455015 1123 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
EFEMP1Q12805 PRPS2-205ENST00000489404 763 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
EFEMP1Q12805 AC092658.1-201ENST00000505836 891 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
EFEMP1Q12805 RIT1-205ENST00000539040 919 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
EFEMP1Q12805 MAX-211ENST00000555667 574 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
EFEMP1Q12805 C2orf69P2-201ENST00000562032 1123 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
EFEMP1Q12805 AC120498.3-201ENST00000568884 542 ntTSL 4 BASIC15.67■□□□□ 0.1
EFEMP1Q12805 AP002360.2-202ENST00000572035 738 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
EFEMP1Q12805 RN7SL713P-201ENST00000582127 302 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
EFEMP1Q12805 RN7SL219P-201ENST00000582872 296 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
EFEMP1Q12805 TUBB6-210ENST00000590967 430 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
EFEMP1Q12805 ANGPTL8-203ENST00000591200 504 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
EFEMP1Q12805 AL354740.1-203ENST00000593917 424 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
EFEMP1Q12805 ZNF347-208ENST00000601804 496 ntTSL 4 BASIC15.67■□□□□ 0.1
EFEMP1Q12805 ANGPTL8-204ENST00000616433 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
EFEMP1Q12805 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
EFEMP1Q12805 EPOP-201ENST00000621654 3719 ntAPPRIS P1 BASIC15.67■□□□□ 0.1
EFEMP1Q12805 GINS3-203ENST00000426538 1728 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
EFEMP1Q12805 SF3B4-201ENST00000271628 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
EFEMP1Q12805 AC023157.3-201ENST00000619086 2088 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
EFEMP1Q12805 UGGT2-204ENST00000397618 1547 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
EFEMP1Q12805 TSC1-202ENST00000403810 1507 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
EFEMP1Q12805 OSBPL10-201ENST00000396556 6600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
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EFEMP1Q12805 NUDT16P1-202ENST00000499077 2208 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
EFEMP1Q12805 ASAH1-210ENST00000520781 2245 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
EFEMP1Q12805 EXOC6B-202ENST00000410104 5795 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
EFEMP1Q12805 CMTM3-203ENST00000460097 1797 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
EFEMP1Q12805 AC023090.2-201ENST00000625182 2110 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
EFEMP1Q12805 ARMC6-206ENST00000535612 2488 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
EFEMP1Q12805 DMTN-204ENST00000415253 2394 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
EFEMP1Q12805 KATNA1-201ENST00000335643 1564 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
EFEMP1Q12805 SNRK-204ENST00000454177 2961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
EFEMP1Q12805 TMUB2-212ENST00000589785 1918 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
EFEMP1Q12805 APBB1-217ENST00000608645 1925 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
EFEMP1Q12805 ALOX12B-201ENST00000319144 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
EFEMP1Q12805 MAMLD1-203ENST00000370401 4854 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
EFEMP1Q12805 KRT8P4-201ENST00000509735 1454 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
EFEMP1Q12805 DHODH-201ENST00000219240 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
EFEMP1Q12805 AGAP7P-201ENST00000582299 2062 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
EFEMP1Q12805 AGAP14-201ENST00000624701 2060 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
EFEMP1Q12805 KCNC2-207ENST00000548513 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
EFEMP1Q12805 NF2-205ENST00000361452 5884 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
EFEMP1Q12805 TMEM50A-201ENST00000374358 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
EFEMP1Q12805 FRMD5-209ENST00000484674 2319 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
EFEMP1Q12805 PTK6-202ENST00000542869 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
EFEMP1Q12805 TNFRSF14-AS1-201ENST00000416860 3522 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
EFEMP1Q12805 ACE3P-201ENST00000423435 1973 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
EFEMP1Q12805 SYN1-202ENST00000340666 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
EFEMP1Q12805 LINC00691-201ENST00000432505 2232 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
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