Protein–RNA interactions for Protein: Q0D2K3

RIPPLY1, Protein ripply1, humanhuman

Predictions only

Length 151 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIPPLY1Q0D2K3 RAB34-223ENST00000636154 730 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
RIPPLY1Q0D2K3 AF228730.6-201ENST00000641497 218 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
RIPPLY1Q0D2K3 AC084121.3-201ENST00000641716 218 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
RIPPLY1Q0D2K3 STAB1-201ENST00000321725 7928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
RIPPLY1Q0D2K3 FXYD6-201ENST00000260282 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
RIPPLY1Q0D2K3 INSIG1-201ENST00000340368 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
RIPPLY1Q0D2K3 CCNDBP1-201ENST00000300213 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
RIPPLY1Q0D2K3 NLRP13-201ENST00000342929 3132 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
RIPPLY1Q0D2K3 PRRT3-202ENST00000411976 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
RIPPLY1Q0D2K3 STRN3-201ENST00000355683 3970 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
RIPPLY1Q0D2K3 ACOT9-201ENST00000336430 1675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
RIPPLY1Q0D2K3 HADH-202ENST00000403312 1752 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
RIPPLY1Q0D2K3 MBD1-217ENST00000588937 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
RIPPLY1Q0D2K3 BPIFB2-201ENST00000170150 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
RIPPLY1Q0D2K3 PDPK1-202ENST00000342085 7241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
RIPPLY1Q0D2K3 SCYL1-205ENST00000524944 2715 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
RIPPLY1Q0D2K3 POM121-205ENST00000627934 5480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.27
RIPPLY1Q0D2K3 TPO-201ENST00000329066 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
RIPPLY1Q0D2K3 MIRLET7BHG-201ENST00000360737 4560 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
RIPPLY1Q0D2K3 TJAP1-207ENST00000436109 2572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
RIPPLY1Q0D2K3 C6orf120-201ENST00000332290 2667 ntAPPRIS P1 BASIC13.39□□□□□ -0.27
RIPPLY1Q0D2K3 SLC52A3-205ENST00000632431 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
RIPPLY1Q0D2K3 UQCC1-204ENST00000374384 2201 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
RIPPLY1Q0D2K3 FAM110C-201ENST00000327669 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
RIPPLY1Q0D2K3 LDLR-202ENST00000455727 2333 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
RIPPLY1Q0D2K3 HBP1-212ENST00000485846 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
RIPPLY1Q0D2K3 C21orf58-204ENST00000397682 2941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
RIPPLY1Q0D2K3 UGDH-201ENST00000316423 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
RIPPLY1Q0D2K3 MAD2L1-201ENST00000296509 5468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
RIPPLY1Q0D2K3 CCL25-201ENST00000253451 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
RIPPLY1Q0D2K3 NMU-201ENST00000264218 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
RIPPLY1Q0D2K3 AL139400.1-201ENST00000366220 510 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
RIPPLY1Q0D2K3 RETN-202ENST00000381324 249 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
RIPPLY1Q0D2K3 PRORY-201ENST00000382764 878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
RIPPLY1Q0D2K3 AKIP1-204ENST00000396648 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
RIPPLY1Q0D2K3 TOMM22P5-201ENST00000416399 439 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
RIPPLY1Q0D2K3 AC107890.1-201ENST00000422478 521 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
RIPPLY1Q0D2K3 C1orf210-201ENST00000423420 629 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
RIPPLY1Q0D2K3 OST4-203ENST00000456793 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
RIPPLY1Q0D2K3 KRT18P43-201ENST00000469825 1281 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
RIPPLY1Q0D2K3 FAM72B-205ENST00000471903 676 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
RIPPLY1Q0D2K3 LY6E-204ENST00000519546 971 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
RIPPLY1Q0D2K3 AC124067.2-201ENST00000521989 510 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
RIPPLY1Q0D2K3 AC091053.1-201ENST00000529883 744 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
RIPPLY1Q0D2K3 TMEM120B-206ENST00000540377 962 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
RIPPLY1Q0D2K3 AL512361.1-201ENST00000554200 418 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
RIPPLY1Q0D2K3 AC140878.1-201ENST00000565277 250 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
RIPPLY1Q0D2K3 AC087645.2-202ENST00000586583 643 ntTSL 4 BASIC13.39□□□□□ -0.27
RIPPLY1Q0D2K3 AC015911.4-201ENST00000588022 1070 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
RIPPLY1Q0D2K3 TBCB-211ENST00000589996 724 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
RIPPLY1Q0D2K3 AC016168.1-201ENST00000591422 722 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
RIPPLY1Q0D2K3 AL136531.2-202ENST00000617804 573 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.39□□□□□ -0.27
RIPPLY1Q0D2K3 AL691403.2-201ENST00000618460 490 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
RIPPLY1Q0D2K3 CBY1-211ENST00000619293 1118 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
RIPPLY1Q0D2K3 AC007326.5-201ENST00000640084 1382 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
RIPPLY1Q0D2K3 CYP2AB1P-202ENST00000454440 1456 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
RIPPLY1Q0D2K3 AC138969.3-201ENST00000546612 1459 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
RIPPLY1Q0D2K3 AC138932.2-201ENST00000548268 1459 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
RIPPLY1Q0D2K3 AC126755.4-201ENST00000549796 1459 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
RIPPLY1Q0D2K3 G6PD-203ENST00000393564 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
RIPPLY1Q0D2K3 SATB2-201ENST00000260926 5318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
RIPPLY1Q0D2K3 MUTYH-206ENST00000372115 1888 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
RIPPLY1Q0D2K3 PRDM10-202ENST00000358825 6322 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
RIPPLY1Q0D2K3 PRDM10-203ENST00000360871 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
RIPPLY1Q0D2K3 PTGES3L-AARSD1-204ENST00000421990 2150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
RIPPLY1Q0D2K3 TSPAN12-201ENST00000222747 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
RIPPLY1Q0D2K3 PITPNM1-216ENST00000534749 4189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
RIPPLY1Q0D2K3 TRIM25-201ENST00000316881 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
RIPPLY1Q0D2K3 SERTAD2-201ENST00000313349 5549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
RIPPLY1Q0D2K3 CFLAR-206ENST00000395148 4415 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
RIPPLY1Q0D2K3 STK3-201ENST00000419617 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
RIPPLY1Q0D2K3 MAP3K12-205ENST00000547488 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
RIPPLY1Q0D2K3 MINDY4-201ENST00000265299 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
RIPPLY1Q0D2K3 RPL15-201ENST00000307839 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
RIPPLY1Q0D2K3 AMT-221ENST00000538581 2038 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
RIPPLY1Q0D2K3 IL9R-201ENST00000244174 1944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
RIPPLY1Q0D2K3 B4GALT3-201ENST00000319769 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
RIPPLY1Q0D2K3 TP73-207ENST00000378290 1831 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
RIPPLY1Q0D2K3 NSUN5P1-206ENST00000457988 1836 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
RIPPLY1Q0D2K3 NME7-201ENST00000367811 1642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
RIPPLY1Q0D2K3 TRIM62-204ENST00000543586 1638 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
RIPPLY1Q0D2K3 SOCS5-202ENST00000394861 4058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
RIPPLY1Q0D2K3 AL583722.1-201ENST00000540171 1307 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
RIPPLY1Q0D2K3 RAD51C-215ENST00000583539 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
RIPPLY1Q0D2K3 AFAP1-204ENST00000420658 7768 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
RIPPLY1Q0D2K3 C10orf71-201ENST00000374144 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
RIPPLY1Q0D2K3 DLGAP1-204ENST00000400149 5203 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
RIPPLY1Q0D2K3 TJP3-207ENST00000589378 3068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
RIPPLY1Q0D2K3 SEPT6-201ENST00000343984 2693 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
RIPPLY1Q0D2K3 FBLN2-203ENST00000404922 4318 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
RIPPLY1Q0D2K3 AC027601.5-201ENST00000624065 2482 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
RIPPLY1Q0D2K3 AC092535.1-201ENST00000417557 2165 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
RIPPLY1Q0D2K3 ZNF79-201ENST00000342483 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
RIPPLY1Q0D2K3 SLC13A5-203ENST00000433363 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
RIPPLY1Q0D2K3 C1orf228-219ENST00000535358 1685 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
RIPPLY1Q0D2K3 GRM5-AS1-201ENST00000526448 4821 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
RIPPLY1Q0D2K3 BLK-201ENST00000259089 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
RIPPLY1Q0D2K3 TANGO2-205ENST00000401886 1559 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
RIPPLY1Q0D2K3 NUP54-217ENST00000514987 1563 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
RIPPLY1Q0D2K3 DMTN-209ENST00000517600 1569 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.8 ms