Protein–RNA interactions for Protein: Q0D2K0

NIPAL4, Magnesium transporter NIPA4, humanhuman

Predictions only

Length 466 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NIPAL4Q0D2K0 PTP4A1P2-201ENST00000546033 454 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
NIPAL4Q0D2K0 LINC01595-201ENST00000555406 639 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NIPAL4Q0D2K0 AC016727.1-204ENST00000578974 420 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NIPAL4Q0D2K0 AC073389.2-202ENST00000607450 441 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NIPAL4Q0D2K0 AL160035.1-201ENST00000637583 576 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NIPAL4Q0D2K0 AC097359.2-201ENST00000604992 2389 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
NIPAL4Q0D2K0 ZBED1-201ENST00000381218 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NIPAL4Q0D2K0 AURKC-203ENST00000448930 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NIPAL4Q0D2K0 SLC26A11-202ENST00000411502 2872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NIPAL4Q0D2K0 ADAMTS13-201ENST00000355699 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NIPAL4Q0D2K0 AC055811.4-201ENST00000624039 1754 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
NIPAL4Q0D2K0 F2-201ENST00000311907 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NIPAL4Q0D2K0 C5orf66-206ENST00000624272 2479 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NIPAL4Q0D2K0 HEY1-202ENST00000354724 2293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NIPAL4Q0D2K0 PAF1-201ENST00000221265 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NIPAL4Q0D2K0 LINC01010-201ENST00000431422 2069 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NIPAL4Q0D2K0 AP001267.2-201ENST00000532619 2086 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
NIPAL4Q0D2K0 ZNF365-205ENST00000395254 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NIPAL4Q0D2K0 RNF122-201ENST00000256257 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NIPAL4Q0D2K0 BCL10-201ENST00000370580 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NIPAL4Q0D2K0 SULT2B1-202ENST00000323090 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NIPAL4Q0D2K0 SH3BP4-203ENST00000409212 5231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NIPAL4Q0D2K0 MIF4GD-208ENST00000579297 1419 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NIPAL4Q0D2K0 AC139749.1-202ENST00000617529 3139 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
NIPAL4Q0D2K0 PLEKHG3-202ENST00000394691 4397 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NIPAL4Q0D2K0 OPCML-IT1-201ENST00000533859 2936 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NIPAL4Q0D2K0 GRB2-201ENST00000316615 3181 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NIPAL4Q0D2K0 SELPLG-201ENST00000228463 1704 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NIPAL4Q0D2K0 HPGD-202ENST00000296522 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NIPAL4Q0D2K0 EGLN1-201ENST00000366641 7097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NIPAL4Q0D2K0 HSD17B6-201ENST00000322165 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NIPAL4Q0D2K0 LRRC59-203ENST00000576448 1531 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
NIPAL4Q0D2K0 LST1-202ENST00000303757 604 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NIPAL4Q0D2K0 VHLL-201ENST00000339922 676 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NIPAL4Q0D2K0 NGDN-202ENST00000408901 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NIPAL4Q0D2K0 AL513303.2-201ENST00000413339 536 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NIPAL4Q0D2K0 GIMAP3P-201ENST00000495150 836 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
NIPAL4Q0D2K0 USP32P1-208ENST00000506594 1164 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
NIPAL4Q0D2K0 AC106760.1-201ENST00000508690 800 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
NIPAL4Q0D2K0 KRT18P25-201ENST00000508931 1278 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
NIPAL4Q0D2K0 AC005225.4-201ENST00000557330 545 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
NIPAL4Q0D2K0 SPATA8-AS1-201ENST00000558722 465 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NIPAL4Q0D2K0 AIPL1-204ENST00000570466 1196 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NIPAL4Q0D2K0 AC138474.1-201ENST00000586630 523 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NIPAL4Q0D2K0 AC068473.4-201ENST00000587527 585 ntTSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NIPAL4Q0D2K0 AC008735.3-201ENST00000596646 500 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
NIPAL4Q0D2K0 AC004466.1-201ENST00000599515 1080 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
NIPAL4Q0D2K0 SMIM22-211ENST00000615889 1047 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NIPAL4Q0D2K0 AC145423.3-201ENST00000615987 467 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
NIPAL4Q0D2K0 ETNPPL-201ENST00000296486 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NIPAL4Q0D2K0 HGNC:18790-202ENST00000421177 4172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NIPAL4Q0D2K0 TFAP2B-202ENST00000393655 5773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NIPAL4Q0D2K0 PAQR8-202ENST00000442253 4738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NIPAL4Q0D2K0 FCHSD2-204ENST00000409418 3154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NIPAL4Q0D2K0 BMP1-203ENST00000354870 3989 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NIPAL4Q0D2K0 FES-203ENST00000394302 2133 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NIPAL4Q0D2K0 SV2A-201ENST00000369145 2903 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NIPAL4Q0D2K0 PDP1-201ENST00000297598 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NIPAL4Q0D2K0 PAX8-AS1-204ENST00000436293 2687 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NIPAL4Q0D2K0 HENMT1-202ENST00000370032 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NIPAL4Q0D2K0 MLLT10-203ENST00000377072 5126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NIPAL4Q0D2K0 FADS2-201ENST00000257261 2964 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NIPAL4Q0D2K0 SCAF11-204ENST00000395454 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NIPAL4Q0D2K0 RGPD8-201ENST00000302558 5576 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NIPAL4Q0D2K0 LPAR1-203ENST00000374431 3637 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NIPAL4Q0D2K0 MFRP-201ENST00000360167 1663 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NIPAL4Q0D2K0 TMPRSS4-214ENST00000523251 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NIPAL4Q0D2K0 GGT1-202ENST00000400380 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NIPAL4Q0D2K0 TBP-206ENST00000540980 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
NIPAL4Q0D2K0 MAGED4B-207ENST00000485287 2618 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NIPAL4Q0D2K0 FBN2-205ENST00000508989 4987 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
NIPAL4Q0D2K0 PKIG-204ENST00000372889 1489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
NIPAL4Q0D2K0 ANKLE2-210ENST00000542657 2446 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
NIPAL4Q0D2K0 TSPAN14-210ENST00000616406 2436 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
NIPAL4Q0D2K0 SSFA2-205ENST00000431877 5150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NIPAL4Q0D2K0 COMP-201ENST00000222271 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NIPAL4Q0D2K0 TRMT1-201ENST00000221504 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NIPAL4Q0D2K0 ZPBP2-202ENST00000377940 2177 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NIPAL4Q0D2K0 H6PD-201ENST00000377403 9146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NIPAL4Q0D2K0 C1QB-201ENST00000314933 1044 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NIPAL4Q0D2K0 PRKN-201ENST00000338468 1276 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NIPAL4Q0D2K0 KIAA0907-201ENST00000368319 1155 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NIPAL4Q0D2K0 LENEP-202ENST00000392487 555 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
NIPAL4Q0D2K0 AC007319.1-202ENST00000412276 829 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
NIPAL4Q0D2K0 AL133456.1-201ENST00000415655 577 ntTSL 4 BASIC15.34■□□□□ 0.05
NIPAL4Q0D2K0 AL589986.1-201ENST00000429230 789 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
NIPAL4Q0D2K0 PNKD-204ENST00000436005 978 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
NIPAL4Q0D2K0 TTTY23B-201ENST00000442790 549 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
NIPAL4Q0D2K0 AC128709.1-201ENST00000445908 600 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
NIPAL4Q0D2K0 AC084864.1-201ENST00000496217 305 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
NIPAL4Q0D2K0 LCN10-206ENST00000527229 615 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NIPAL4Q0D2K0 SLC25A47P1-201ENST00000531577 414 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
NIPAL4Q0D2K0 RPS15-202ENST00000585665 467 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
NIPAL4Q0D2K0 ADAM15-204ENST00000359280 2874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NIPAL4Q0D2K0 SCYL1-208ENST00000527009 2586 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
NIPAL4Q0D2K0 RB1CC1-201ENST00000025008 6635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NIPAL4Q0D2K0 PDE4C-207ENST00000594617 4655 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NIPAL4Q0D2K0 SLC44A2-201ENST00000335757 3671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NIPAL4Q0D2K0 SLC39A6-202ENST00000440549 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NIPAL4Q0D2K0 CCNE1-203ENST00000444983 1680 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.3 ms