Protein–RNA interactions for Protein: Q08397

LOXL1, Lysyl oxidase homolog 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 574 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LOXL1Q08397 AL157791.1-201ENST00000553667 1699 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
LOXL1Q08397 SLC7A4-201ENST00000382932 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
LOXL1Q08397 ZNF302-207ENST00000505365 2955 ntTSL 2 BASIC12.48□□□□□ -0.41
LOXL1Q08397 ZNF134-201ENST00000396161 4914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
LOXL1Q08397 FGFR1OP2-201ENST00000229395 2924 ntTSL 2 BASIC12.48□□□□□ -0.41
LOXL1Q08397 EWSR1-201ENST00000331029 2267 ntTSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
LOXL1Q08397 HEY1-201ENST00000337919 2296 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
LOXL1Q08397 ITSN1-209ENST00000399352 5408 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
LOXL1Q08397 N4BP1-201ENST00000262384 7106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
LOXL1Q08397 GABRB3-215ENST00000622697 5876 ntTSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
LOXL1Q08397 TSPAN5-201ENST00000305798 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
LOXL1Q08397 ADAM15-208ENST00000447332 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.47□□□□□ -0.41
LOXL1Q08397 NDRG2-207ENST00000397847 2084 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
LOXL1Q08397 SCML4-201ENST00000369020 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
LOXL1Q08397 PLEKHB2-207ENST00000438882 1460 ntTSL 2 BASIC12.47□□□□□ -0.41
LOXL1Q08397 ACE-202ENST00000290866 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
LOXL1Q08397 P3H1-202ENST00000296388 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
LOXL1Q08397 PDXK-202ENST00000327574 2583 ntTSL 2 BASIC12.47□□□□□ -0.41
LOXL1Q08397 AC010931.2-202ENST00000514871 2566 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
LOXL1Q08397 CDK18-201ENST00000360066 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
LOXL1Q08397 SF3A2-201ENST00000221494 1963 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
LOXL1Q08397 WIZ-206ENST00000599686 3644 ntTSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
LOXL1Q08397 RAD23B-201ENST00000358015 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
LOXL1Q08397 ARHGEF10-201ENST00000349830 5590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
LOXL1Q08397 CXorf40B-202ENST00000370404 1316 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.47□□□□□ -0.41
LOXL1Q08397 ABCB7-201ENST00000253577 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
LOXL1Q08397 RASGRP2-201ENST00000354024 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
LOXL1Q08397 ZNF212-201ENST00000335870 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
LOXL1Q08397 DZIP1-203ENST00000361396 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
LOXL1Q08397 NAGK-201ENST00000244204 1154 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
LOXL1Q08397 SMAD6-201ENST00000288840 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
LOXL1Q08397 MRPL43-206ENST00000370236 866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.47□□□□□ -0.41
LOXL1Q08397 MRPL43-207ENST00000370241 824 ntTSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
LOXL1Q08397 TSPO-203ENST00000396265 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
LOXL1Q08397 ARL16-201ENST00000397498 1227 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
LOXL1Q08397 MPV17-204ENST00000399052 749 ntTSL 4 BASIC12.47□□□□□ -0.41
LOXL1Q08397 ACTG1P2-201ENST00000415776 1125 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
LOXL1Q08397 ACTG1P11-201ENST00000425411 1125 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
LOXL1Q08397 VAMP8-203ENST00000432071 664 ntTSL 3 BASIC12.47□□□□□ -0.41
LOXL1Q08397 AL136361.1-201ENST00000435429 506 ntTSL 3 BASIC12.47□□□□□ -0.41
LOXL1Q08397 AL353637.1-201ENST00000451571 732 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
LOXL1Q08397 PGAP2-224ENST00000490830 810 ntTSL 3 BASIC12.47□□□□□ -0.41
LOXL1Q08397 AC018680.1-202ENST00000500324 525 ntTSL 3 BASIC12.47□□□□□ -0.41
LOXL1Q08397 HHIP-AS1-201ENST00000503066 897 ntTSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
LOXL1Q08397 AC026434.2-201ENST00000506094 1078 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
LOXL1Q08397 AC100818.1-201ENST00000524167 563 ntTSL 4 BASIC12.47□□□□□ -0.41
LOXL1Q08397 MRPL51-202ENST00000537701 601 ntTSL 2 BASIC12.47□□□□□ -0.41
LOXL1Q08397 AP003065.1-201ENST00000540912 562 ntTSL 4 BASIC12.47□□□□□ -0.41
LOXL1Q08397 CD63-214ENST00000552692 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
LOXL1Q08397 AC106738.2-201ENST00000559802 557 ntTSL 4 BASIC12.47□□□□□ -0.41
LOXL1Q08397 RANGRF-205ENST00000580434 749 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
LOXL1Q08397 C1QTNF1-AS1-202ENST00000581579 865 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
LOXL1Q08397 CENPX-208ENST00000584347 799 ntTSL 2 BASIC12.47□□□□□ -0.41
LOXL1Q08397 AC008763.2-203ENST00000595866 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
LOXL1Q08397 AC009955.4-201ENST00000597192 544 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
LOXL1Q08397 AP000229.1-202ENST00000609365 559 ntTSL 4 BASIC12.47□□□□□ -0.41
LOXL1Q08397 AC090164.2-201ENST00000611487 516 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
LOXL1Q08397 AC068790.8-201ENST00000618862 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.47□□□□□ -0.41
LOXL1Q08397 ARL16-214ENST00000621051 1181 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
LOXL1Q08397 LINC01669-205ENST00000624561 713 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
LOXL1Q08397 PTGES3L-AARSD1-201ENST00000360221 1790 ntTSL 2 BASIC12.47□□□□□ -0.41
LOXL1Q08397 PXN-201ENST00000228307 3785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
LOXL1Q08397 EIF2S2-201ENST00000374980 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
LOXL1Q08397 ZNF398-203ENST00000483892 2121 ntTSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
LOXL1Q08397 DHX36-201ENST00000308361 3487 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
LOXL1Q08397 ARMC5-203ENST00000457010 4844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
LOXL1Q08397 ANXA11-203ENST00000422982 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
LOXL1Q08397 BRD3-201ENST00000303407 5652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
LOXL1Q08397 NFATC3-222ENST00000575270 3824 ntTSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
LOXL1Q08397 ARHGAP11B-210ENST00000622744 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
LOXL1Q08397 SLC38A5-213ENST00000620913 1993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
LOXL1Q08397 EPOP-201ENST00000621654 3719 ntAPPRIS P1 BASIC12.47□□□□□ -0.41
LOXL1Q08397 PDGFRL-203ENST00000541323 1905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.47□□□□□ -0.41
LOXL1Q08397 SLIT3-201ENST00000332966 4895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
LOXL1Q08397 PROZ-202ENST00000375547 1488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
LOXL1Q08397 PCSK4-201ENST00000300954 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
LOXL1Q08397 SLC29A1-205ENST00000371740 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
LOXL1Q08397 ZNF19-208ENST00000565637 2612 ntTSL 2 BASIC12.46□□□□□ -0.41
LOXL1Q08397 ITFG1-201ENST00000320640 3400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
LOXL1Q08397 PAPLN-202ENST00000340738 5834 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.41
LOXL1Q08397 HMGA1-202ENST00000347617 1773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
LOXL1Q08397 FBN1-205ENST00000560355 4109 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
LOXL1Q08397 RGS6-210ENST00000553530 5685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
LOXL1Q08397 ABHD16A-201ENST00000395952 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
LOXL1Q08397 TNKS1BP1-207ENST00000532437 5952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
LOXL1Q08397 FASTKD5-201ENST00000380266 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
LOXL1Q08397 ANKMY1-207ENST00000403283 2874 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
LOXL1Q08397 UBE2V2-205ENST00000521346 1322 ntTSL 3 BASIC12.46□□□□□ -0.41
LOXL1Q08397 AL360270.3-201ENST00000609118 1348 ntBASIC12.46□□□□□ -0.41
LOXL1Q08397 MBD4-204ENST00000503197 2099 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
LOXL1Q08397 SPDYE6-201ENST00000563237 1691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.41
LOXL1Q08397 DMTN-202ENST00000358242 2772 ntTSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.41
LOXL1Q08397 BLK-205ENST00000529894 2017 ntTSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.41
LOXL1Q08397 AC008969.1-201ENST00000550135 6438 ntTSL 2 BASIC12.46□□□□□ -0.41
LOXL1Q08397 TMEM40-201ENST00000264728 984 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.46□□□□□ -0.41
LOXL1Q08397 GSTT2B-201ENST00000290765 1099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
LOXL1Q08397 AC091046.1-201ENST00000331871 207 ntBASIC12.46□□□□□ -0.41
LOXL1Q08397 PSMB5-202ENST00000361611 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
LOXL1Q08397 BEX2-201ENST00000372674 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.46□□□□□ -0.41
LOXL1Q08397 FGF14-202ENST00000376143 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.5 ms