Protein–RNA interactions for Protein: Q03188

CENPC, Centromere protein C, humanhuman

Predictions only

Length 943 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPCQ03188 NQO2-202ENST00000380430 1098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CENPCQ03188 TMEM247-204ENST00000434431 680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CENPCQ03188 INE1-201ENST00000456273 945 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
CENPCQ03188 AC012531.3-201ENST00000513209 777 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CENPCQ03188 AC022616.1-201ENST00000518688 554 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
CENPCQ03188 CLNS1A-210ENST00000528364 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CENPCQ03188 CCKBR-204ENST00000531712 463 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CENPCQ03188 POLE2-203ENST00000553805 496 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CENPCQ03188 CLUHP6-201ENST00000580789 941 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
CENPCQ03188 AP005019.2-201ENST00000615104 511 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
CENPCQ03188 BCS1L-203ENST00000392110 1525 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CENPCQ03188 ENDOU-203ENST00000545824 1513 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CENPCQ03188 SLC1A5-201ENST00000412532 1750 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CENPCQ03188 ARHGEF3-212ENST00000495373 2024 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CENPCQ03188 MCM3AP-AS1-203ENST00000421927 2280 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CENPCQ03188 HNRNPDL-208ENST00000621267 4139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CENPCQ03188 NAA60-229ENST00000575076 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CENPCQ03188 IL12RB2-206ENST00000544434 3782 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CENPCQ03188 NFYA-202ENST00000353205 1660 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CENPCQ03188 MFRP-201ENST00000360167 1663 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CENPCQ03188 ABHD16A-202ENST00000440843 1906 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CENPCQ03188 SAFB-202ENST00000454510 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CENPCQ03188 C16orf52-202ENST00000542527 4360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CENPCQ03188 SRRT-217ENST00000618411 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CENPCQ03188 MYO15B-237ENST00000642007 4893 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
CENPCQ03188 C22orf34-201ENST00000343999 2816 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CENPCQ03188 CCDC110-209ENST00000510617 2592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CENPCQ03188 SCYL1-208ENST00000527009 2586 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CENPCQ03188 APBB1-219ENST00000608704 2095 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CENPCQ03188 TRIM50-202ENST00000453152 1599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CENPCQ03188 CYB5R2-204ENST00000524790 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CENPCQ03188 ALK-201ENST00000389048 6220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CENPCQ03188 AL928970.1-201ENST00000422679 2923 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CENPCQ03188 RABL2A-206ENST00000409842 1979 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CENPCQ03188 CSGALNACT1-211ENST00000522854 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CENPCQ03188 TOMM5-201ENST00000321301 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CENPCQ03188 LCE3A-201ENST00000335674 270 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CENPCQ03188 MAGEA12-203ENST00000393900 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CENPCQ03188 ACTBP8-201ENST00000403258 1108 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
CENPCQ03188 AC005034.1-201ENST00000426657 489 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
CENPCQ03188 SPATA3-204ENST00000433428 856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CENPCQ03188 EIF3FP3-201ENST00000434851 1086 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
CENPCQ03188 CR589904.1-201ENST00000437830 732 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CENPCQ03188 AC139149.1-202ENST00000442532 783 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CENPCQ03188 RN7SL752P-201ENST00000463779 287 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
CENPCQ03188 AC012640.1-201ENST00000509915 688 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CENPCQ03188 PAM16-204ENST00000571941 674 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CENPCQ03188 SMIM24-203ENST00000587847 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CENPCQ03188 ELOF1-206ENST00000590700 585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CENPCQ03188 IL32-235ENST00000613483 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CENPCQ03188 AL035252.4-201ENST00000624174 288 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
CENPCQ03188 AL358472.5-202ENST00000641448 1267 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
CENPCQ03188 FBXO15-201ENST00000419743 1708 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CENPCQ03188 CATSPER2P1-203ENST00000429276 1466 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CENPCQ03188 UHMK1-202ENST00000489294 8478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CENPCQ03188 TMEM209-202ENST00000462753 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CENPCQ03188 AL139082.1-201ENST00000613982 3433 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CENPCQ03188 KAT5-216ENST00000534650 1875 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CENPCQ03188 NEU3-206ENST00000532963 1643 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CENPCQ03188 MAPK7-203ENST00000395602 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CENPCQ03188 FAM103A1-201ENST00000304191 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CENPCQ03188 MUM1-201ENST00000415183 2837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CENPCQ03188 SYT13-201ENST00000020926 5144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CENPCQ03188 SUGP2-202ENST00000337018 3640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CENPCQ03188 MSH5-203ENST00000375750 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CENPCQ03188 TNS2-201ENST00000314250 5010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CENPCQ03188 CKMT2-201ENST00000254035 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CENPCQ03188 OXA1L-201ENST00000285848 1719 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CENPCQ03188 HMBOX1-210ENST00000523613 1730 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CENPCQ03188 CCT4-201ENST00000394440 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CENPCQ03188 ARC-201ENST00000356613 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CENPCQ03188 FGD1-201ENST00000375135 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CENPCQ03188 BTBD11-204ENST00000420571 3478 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CENPCQ03188 TSEN2-205ENST00000444864 2697 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CENPCQ03188 AC126755.1-201ENST00000525846 6405 ntBASIC16■□□□□ 0.15
CENPCQ03188 MSI2-202ENST00000322684 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CENPCQ03188 CCNE1-203ENST00000444983 1680 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CENPCQ03188 TMEM230-201ENST00000202834 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CENPCQ03188 BUD31-201ENST00000222969 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CENPCQ03188 FOXR1-201ENST00000317011 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CENPCQ03188 UBE2G2-201ENST00000330942 721 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
CENPCQ03188 ACKR1-201ENST00000368121 1240 ntBASIC16■□□□□ 0.15
CENPCQ03188 AC098614.1-201ENST00000368528 745 ntBASIC16■□□□□ 0.15
CENPCQ03188 SZT2-AS1-201ENST00000396885 699 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
CENPCQ03188 CC2D2B-203ENST00000423344 1241 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CENPCQ03188 NME2P1-201ENST00000426182 414 ntBASIC16■□□□□ 0.15
CENPCQ03188 LINC01784-201ENST00000438401 378 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CENPCQ03188 AL162726.2-201ENST00000438986 1017 ntBASIC16■□□□□ 0.15
CENPCQ03188 AC097717.1-202ENST00000457577 740 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
CENPCQ03188 GIMAP3P-201ENST00000495150 836 ntBASIC16■□□□□ 0.15
CENPCQ03188 C5orf66-202ENST00000507641 547 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
CENPCQ03188 PLEKHA7-214ENST00000532079 565 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CENPCQ03188 AC006064.3-201ENST00000537921 477 ntTSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
CENPCQ03188 TRAPPC6A-204ENST00000588062 695 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CENPCQ03188 APOBEC3H-206ENST00000613677 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CENPCQ03188 METTL26-214ENST00000614890 801 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
CENPCQ03188 AC006449.3-201ENST00000620144 563 ntTSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
CENPCQ03188 IGHV3-72-202ENST00000621503 303 ntBASIC16■□□□□ 0.15
CENPCQ03188 ITGB4-206ENST00000579662 5554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CENPCQ03188 C15orf52-206ENST00000559313 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.6 ms