Protein–RNA interactions for Protein: Q02809

PLOD1, Procollagen-lysine,2-oxoglutarate 5-dioxygenase 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 727 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLOD1Q02809 RAB2A-201ENST00000262646 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PLOD1Q02809 GHSR-202ENST00000427970 912 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
PLOD1Q02809 HMGB2-203ENST00000446922 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PLOD1Q02809 AC004066.1-201ENST00000502488 802 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
PLOD1Q02809 IL32-215ENST00000529550 772 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PLOD1Q02809 SDR39U1-212ENST00000555365 976 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PLOD1Q02809 AL132639.3-201ENST00000556537 530 ntTSL 4 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PLOD1Q02809 CUEDC1-207ENST00000577840 875 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PLOD1Q02809 KXD1-204ENST00000595073 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PLOD1Q02809 AC011466.1-201ENST00000595201 566 ntTSL 4 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PLOD1Q02809 IFI27-206ENST00000612813 725 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PLOD1Q02809 AL662799.1-202ENST00000614205 422 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
PLOD1Q02809 IFI27-213ENST00000620066 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PLOD1Q02809 ZNF655-225ENST00000626122 705 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PLOD1Q02809 DBI-211ENST00000627093 554 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PLOD1Q02809 AL358472.5-202ENST00000641448 1267 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
PLOD1Q02809 FSIP1-201ENST00000350221 2805 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PLOD1Q02809 UPF3B-202ENST00000345865 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PLOD1Q02809 ORMDL3-204ENST00000579695 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PLOD1Q02809 TBCE-202ENST00000406207 2012 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PLOD1Q02809 VPS36-207ENST00000611132 4607 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PLOD1Q02809 DPEP1-202ENST00000393092 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PLOD1Q02809 TNIP1-219ENST00000524280 1716 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PLOD1Q02809 KCNMA1-202ENST00000286628 6233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PLOD1Q02809 TMEM222-211ENST00000611517 1613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PLOD1Q02809 LYSMD4-204ENST00000409796 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PLOD1Q02809 ETV7-201ENST00000339796 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PLOD1Q02809 THAP10-201ENST00000249861 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PLOD1Q02809 CYB5R2-204ENST00000524790 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PLOD1Q02809 KCNMA1-262ENST00000639489 4302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PLOD1Q02809 TEX13C-201ENST00000632600 5095 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PLOD1Q02809 FOXH1-201ENST00000377317 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PLOD1Q02809 SP140L-204ENST00000444636 1781 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PLOD1Q02809 DDX56-201ENST00000258772 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PLOD1Q02809 ABCA7-203ENST00000435683 6211 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PLOD1Q02809 PNPLA3-203ENST00000423180 2222 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PLOD1Q02809 MCRIP1-207ENST00000574190 2775 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PLOD1Q02809 HECW1-203ENST00000453890 5169 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PLOD1Q02809 NEK5-204ENST00000617045 2127 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PLOD1Q02809 THOC5-203ENST00000397872 2676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PLOD1Q02809 INTS4P2-202ENST00000614726 2019 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
PLOD1Q02809 TTC7A-202ENST00000394850 4306 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PLOD1Q02809 DRC3-202ENST00000399182 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PLOD1Q02809 IFRD1-205ENST00000429071 1938 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PLOD1Q02809 KRT8P44-201ENST00000441609 1350 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
PLOD1Q02809 KLF11-205ENST00000535335 4033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PLOD1Q02809 HSDL2-202ENST00000398805 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PLOD1Q02809 MIOX-201ENST00000216075 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PLOD1Q02809 AIP-201ENST00000279146 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PLOD1Q02809 LCN15-201ENST00000316144 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PLOD1Q02809 CXorf40A-201ENST00000359293 974 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PLOD1Q02809 MRPL55-215ENST00000366742 630 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PLOD1Q02809 AC098614.1-201ENST00000368528 745 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
PLOD1Q02809 TCEAL3-202ENST00000372627 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PLOD1Q02809 MFAP2-201ENST00000375534 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PLOD1Q02809 PDGFB-202ENST00000381551 1125 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PLOD1Q02809 AL645937.2-201ENST00000396808 931 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
PLOD1Q02809 AC104457.1-201ENST00000401024 814 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
PLOD1Q02809 NUS1P3-201ENST00000423502 862 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
PLOD1Q02809 ARHGEF26-AS1-201ENST00000467912 628 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PLOD1Q02809 TMEM176B-206ENST00000492607 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PLOD1Q02809 AC009686.1-201ENST00000522494 364 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PLOD1Q02809 ENPP7P5-201ENST00000541031 1031 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
PLOD1Q02809 C14orf178-204ENST00000557011 474 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PLOD1Q02809 GZMH-203ENST00000557220 520 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PLOD1Q02809 CHCHD2P3-201ENST00000603038 451 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
PLOD1Q02809 AC133539.2-201ENST00000604757 467 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
PLOD1Q02809 LINC01663-201ENST00000614596 535 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PLOD1Q02809 AC007431.3-201ENST00000623221 587 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
PLOD1Q02809 DNAJC27-201ENST00000264711 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PLOD1Q02809 MSI1-201ENST00000257552 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PLOD1Q02809 ARVCF-203ENST00000406259 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PLOD1Q02809 AMT-232ENST00000636199 1546 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PLOD1Q02809 UBQLN1-202ENST00000376395 4118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PLOD1Q02809 DEF8-210ENST00000563594 4450 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PLOD1Q02809 CYP4F3-203ENST00000586182 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PLOD1Q02809 BPIFB2-201ENST00000170150 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PLOD1Q02809 GAS2L3-201ENST00000266754 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PLOD1Q02809 INSIG1-201ENST00000340368 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PLOD1Q02809 MGMT-201ENST00000306010 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PLOD1Q02809 GTF3C5-204ENST00000372108 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PLOD1Q02809 ALDH1B1-201ENST00000377698 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PLOD1Q02809 STRN-202ENST00000379213 2254 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PLOD1Q02809 STIP1-207ENST00000538945 1900 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PLOD1Q02809 NUDT4-201ENST00000337179 9753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PLOD1Q02809 GTF2I-212ENST00000573035 4548 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PLOD1Q02809 PDE1B-207ENST00000550620 2150 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PLOD1Q02809 CHRNA7-201ENST00000306901 6181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PLOD1Q02809 WDR1-203ENST00000382452 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PLOD1Q02809 KTN1-AS1-201ENST00000335142 1465 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PLOD1Q02809 FBP1-203ENST00000415431 1487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PLOD1Q02809 RABIF-201ENST00000367262 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PLOD1Q02809 CELP-203ENST00000624767 2414 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PLOD1Q02809 EPHA2-201ENST00000358432 3964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PLOD1Q02809 UNC5B-202ENST00000373192 6451 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PLOD1Q02809 ITSN2-203ENST00000406921 4563 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PLOD1Q02809 SPATS2L-209ENST00000409988 2698 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PLOD1Q02809 DMAP1-203ENST00000372289 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PLOD1Q02809 FRMD5-209ENST00000484674 2319 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PLOD1Q02809 LINC01782-201ENST00000591212 2908 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.6 ms