Protein–RNA interactions for Protein: Q00994

BEX3, Protein BEX3, humanhuman

Predictions only

Length 111 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BEX3Q00994 DKK4-201ENST00000220812 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
BEX3Q00994 SPDYE4-201ENST00000328794 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
BEX3Q00994 COX8C-201ENST00000342144 533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
BEX3Q00994 AC239868.1-201ENST00000369385 493 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
BEX3Q00994 AC078875.1-201ENST00000431907 724 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
BEX3Q00994 AC093151.3-202ENST00000445073 709 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
BEX3Q00994 PFN2-206ENST00000461930 606 ntTSL 4 BASIC16.58■□□□□ 0.24
BEX3Q00994 SZRD1-203ENST00000471507 892 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
BEX3Q00994 PRKRA-211ENST00000487082 1211 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
BEX3Q00994 AL132639.2-202ENST00000553520 467 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
BEX3Q00994 AC133919.1-201ENST00000562203 416 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
BEX3Q00994 AC008133.1-201ENST00000584688 557 ntTSL 4 BASIC16.58■□□□□ 0.24
BEX3Q00994 AL109837.1-201ENST00000603272 613 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
BEX3Q00994 HIST2H2BB-202ENST00000609585 563 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
BEX3Q00994 AC011491.1-203ENST00000637688 543 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
BEX3Q00994 CYP4B1-215ENST00000640628 969 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
BEX3Q00994 KCNT1-214ENST00000631073 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
BEX3Q00994 BNIP1-201ENST00000231668 1339 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
BEX3Q00994 TOB1-AS1-201ENST00000416263 1351 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
BEX3Q00994 CANX-201ENST00000247461 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
BEX3Q00994 MIF4GD-208ENST00000579297 1419 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
BEX3Q00994 UCN2-201ENST00000273610 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
BEX3Q00994 FOSB-213ENST00000615753 1468 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
BEX3Q00994 POLL-204ENST00000370168 1536 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
BEX3Q00994 MAGEB2-201ENST00000378988 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
BEX3Q00994 LRRC6-205ENST00000519595 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
BEX3Q00994 SALL4P5-201ENST00000419001 1760 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
BEX3Q00994 NRSN2-210ENST00000621012 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
BEX3Q00994 CDC42BPG-201ENST00000342711 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
BEX3Q00994 LETM2-205ENST00000519476 2240 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
BEX3Q00994 DEPDC5-203ENST00000400242 2395 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
BEX3Q00994 SPHK2-202ENST00000340932 2492 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
BEX3Q00994 ITGA9-201ENST00000264741 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
BEX3Q00994 INPP5K-204ENST00000421807 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
BEX3Q00994 KIFC3-206ENST00000541240 3047 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
BEX3Q00994 RASGRF1-202ENST00000419573 6294 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
BEX3Q00994 KHNYN-202ENST00000553935 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
BEX3Q00994 DNM1-201ENST00000341179 3254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
BEX3Q00994 HSP90B1-201ENST00000299767 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
BEX3Q00994 MMEL1-201ENST00000378412 2849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
BEX3Q00994 LRRN4-201ENST00000378858 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
BEX3Q00994 DDX5-201ENST00000225792 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
BEX3Q00994 TRPV4-204ENST00000536838 2514 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
BEX3Q00994 RBPJL-201ENST00000343694 2489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
BEX3Q00994 GIT2-220ENST00000553118 2424 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
BEX3Q00994 IGSF8-202ENST00000368086 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
BEX3Q00994 REXO1L2P-201ENST00000425429 2069 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
BEX3Q00994 CERS3-202ENST00000394113 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
BEX3Q00994 STAT6-225ENST00000640254 2037 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
BEX3Q00994 MAX-204ENST00000358402 1973 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
BEX3Q00994 PDE9A-208ENST00000398225 1963 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
BEX3Q00994 CCDC90B-213ENST00000529611 1986 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
BEX3Q00994 FH-201ENST00000366560 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
BEX3Q00994 ADCYAP1R1-204ENST00000409489 1761 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
BEX3Q00994 INHBA-203ENST00000442711 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
BEX3Q00994 TMEM40-204ENST00000435218 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
BEX3Q00994 CFAP36-201ENST00000339012 1373 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
BEX3Q00994 NIT1-203ENST00000368009 1362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
BEX3Q00994 CAP2P1-201ENST00000557743 1390 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
BEX3Q00994 RDH10-201ENST00000240285 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
BEX3Q00994 MYL12B-201ENST00000237500 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
BEX3Q00994 CAPZB-201ENST00000264202 858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
BEX3Q00994 AL627231.1-201ENST00000394467 1125 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
BEX3Q00994 AL606491.1-201ENST00000412797 483 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
BEX3Q00994 AL391361.3-201ENST00000420601 379 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
BEX3Q00994 MNX1-AS2-201ENST00000429228 374 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
BEX3Q00994 LINC01806-201ENST00000436506 765 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
BEX3Q00994 AC098935.1-201ENST00000446057 611 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
BEX3Q00994 AC105389.3-201ENST00000508038 907 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
BEX3Q00994 AC008406.1-201ENST00000509530 541 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
BEX3Q00994 POU5F1P2-201ENST00000521750 823 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
BEX3Q00994 TMEM218-205ENST00000527271 706 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
BEX3Q00994 HS3ST3A1-202ENST00000578576 750 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
BEX3Q00994 ACP7-202ENST00000594229 1149 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
BEX3Q00994 AL157813.1-201ENST00000612996 587 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
BEX3Q00994 RN7SL736P-201ENST00000613111 269 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
BEX3Q00994 AC027601.3-201ENST00000622907 509 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
BEX3Q00994 SCP2-217ENST00000640998 1101 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
BEX3Q00994 ARHGEF10-201ENST00000349830 5590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
BEX3Q00994 YY1AP1-211ENST00000368340 2927 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
BEX3Q00994 GLG1-202ENST00000422840 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
BEX3Q00994 CCNY-202ENST00000339497 4630 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
BEX3Q00994 CACFD1-207ENST00000542192 2754 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
BEX3Q00994 SUPT20H-201ENST00000350612 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
BEX3Q00994 C2CD3-213ENST00000539061 2722 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
BEX3Q00994 FOXP3-202ENST00000376199 2274 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
BEX3Q00994 AC013726.1-201ENST00000563747 2285 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
BEX3Q00994 LRRC58-201ENST00000295628 7903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
BEX3Q00994 GAS7-203ENST00000432992 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
BEX3Q00994 C10orf10-201ENST00000298295 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
BEX3Q00994 FAM86B1-216ENST00000533852 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
BEX3Q00994 MAPK7-204ENST00000395604 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
BEX3Q00994 SLC1A5-201ENST00000412532 1750 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
BEX3Q00994 GINS3-203ENST00000426538 1728 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
BEX3Q00994 AC006063.2-201ENST00000640161 1696 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
BEX3Q00994 CHIA-204ENST00000369740 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
BEX3Q00994 C2orf50-201ENST00000381585 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
BEX3Q00994 DPP6-202ENST00000377770 3710 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
BEX3Q00994 EPN1-203ENST00000411543 2621 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
BEX3Q00994 MLEC-201ENST00000228506 6626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54 ms