Protein–RNA interactions for Protein: P98173

FAM3A, Protein FAM3A, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM3AP98173 PIK3IP1-201ENST00000215912 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
FAM3AP98173 SNX14-202ENST00000346348 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
FAM3AP98173 FARP1-214ENST00000595437 4926 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
FAM3AP98173 ARHGAP23P1-201ENST00000562773 1937 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
FAM3AP98173 ZNF84-215ENST00000543758 3501 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
FAM3AP98173 NXF1-213ENST00000532297 2795 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
FAM3AP98173 MAGEA2-209ENST00000623806 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
FAM3AP98173 ERCC1-201ENST00000013807 1278 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
FAM3AP98173 ETFB-201ENST00000309244 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
FAM3AP98173 HNRNPH1-201ENST00000329433 2114 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
FAM3AP98173 MRPL55-215ENST00000366742 630 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
FAM3AP98173 SLC18B1-202ENST00000367918 472 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
FAM3AP98173 GABARAPL1-202ENST00000421801 855 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
FAM3AP98173 DHDDS-206ENST00000427245 868 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
FAM3AP98173 MNX1-AS2-201ENST00000429228 374 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
FAM3AP98173 AL442647.2-201ENST00000429864 857 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
FAM3AP98173 HLA-K-203ENST00000430151 1046 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
FAM3AP98173 LINC01812-201ENST00000457448 725 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
FAM3AP98173 PRKAG2-AS1-202ENST00000467458 1064 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
FAM3AP98173 LINC01336-202ENST00000506086 479 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
FAM3AP98173 PDP1-203ENST00000517764 2140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
FAM3AP98173 AP002008.1-201ENST00000530283 1155 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
FAM3AP98173 AC138466.1-201ENST00000535242 391 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
FAM3AP98173 AC007569.1-201ENST00000550306 600 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
FAM3AP98173 AC120045.2-201ENST00000567334 178 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
FAM3AP98173 AC011466.1-201ENST00000595201 566 ntTSL 4 BASIC13.14□□□□□ -0.31
FAM3AP98173 ATP11B-201ENST00000323116 7325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
FAM3AP98173 NPHP4-201ENST00000378156 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
FAM3AP98173 SEC13-201ENST00000337354 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
FAM3AP98173 GSTO2-203ENST00000450629 1391 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
FAM3AP98173 VASH1-203ENST00000554237 1462 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
FAM3AP98173 SNUPN-206ENST00000564675 1682 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
FAM3AP98173 MEGF11-203ENST00000409699 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
FAM3AP98173 TGFB1I1-201ENST00000361773 1773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
FAM3AP98173 NAP1L1-202ENST00000393263 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
FAM3AP98173 ZNF777-201ENST00000247930 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
FAM3AP98173 CTNNBL1-209ENST00000621317 1990 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
FAM3AP98173 SNPH-202ENST00000381873 4995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
FAM3AP98173 DENND4C-209ENST00000602925 6831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
FAM3AP98173 SEC16A-202ENST00000290037 8982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
FAM3AP98173 SLC32A1-201ENST00000217420 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
FAM3AP98173 ALDH1B1-201ENST00000377698 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
FAM3AP98173 CLCN1-201ENST00000343257 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
FAM3AP98173 ACOT7-210ENST00000608083 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
FAM3AP98173 RDM1-224ENST00000619262 1535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
FAM3AP98173 B4GALNT3-201ENST00000266383 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
FAM3AP98173 SEPT8-212ENST00000458488 1726 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
FAM3AP98173 KIAA1468-201ENST00000256858 5579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
FAM3AP98173 CYB5D2-201ENST00000301391 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
FAM3AP98173 COX10-AS1-202ENST00000449363 1944 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
FAM3AP98173 TBCE-202ENST00000406207 2012 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
FAM3AP98173 ICA1-207ENST00000406470 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
FAM3AP98173 COPS7B-224ENST00000620578 2500 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
FAM3AP98173 F8-201ENST00000330287 2620 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
FAM3AP98173 AICDA-201ENST00000229335 2819 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
FAM3AP98173 MED16-203ENST00000325464 2922 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
FAM3AP98173 CYB561-219ENST00000584031 3200 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
FAM3AP98173 TNS2-201ENST00000314250 5010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
FAM3AP98173 FKBP9-201ENST00000242209 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
FAM3AP98173 VSIG10L-201ENST00000335624 3397 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
FAM3AP98173 TBC1D2-203ENST00000375064 3174 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
FAM3AP98173 AC018529.2-202ENST00000611482 3087 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
FAM3AP98173 LIMK2-204ENST00000406516 2657 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
FAM3AP98173 AC009053.1-204ENST00000429810 2355 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
FAM3AP98173 TLX1NB-202ENST00000445873 1862 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
FAM3AP98173 DUOXA1-216ENST00000613425 1867 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
FAM3AP98173 USP37-202ENST00000338465 1771 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
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FAM3AP98173 MEIOC-201ENST00000409122 4604 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
FAM3AP98173 AC007541.1-201ENST00000570282 1469 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
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FAM3AP98173 MRPL16-201ENST00000300151 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
FAM3AP98173 PRKN-203ENST00000366894 1157 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
FAM3AP98173 AP1S3-204ENST00000409375 552 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
FAM3AP98173 NUS1P3-201ENST00000423502 862 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
FAM3AP98173 AC073133.1-201ENST00000426187 432 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
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FAM3AP98173 TMEM161B-AS1-202ENST00000501715 1101 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
FAM3AP98173 AC090735.1-201ENST00000523881 488 ntTSL 4 BASIC13.13□□□□□ -0.31
FAM3AP98173 AC123567.1-201ENST00000548294 1261 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
FAM3AP98173 AC015712.4-202ENST00000558641 1007 ntTSL 4 BASIC13.13□□□□□ -0.31
FAM3AP98173 AC138028.3-201ENST00000561699 213 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
FAM3AP98173 NUBP2-208ENST00000565987 1049 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
FAM3AP98173 LINC01663-201ENST00000614596 535 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
FAM3AP98173 AC007431.3-201ENST00000623221 587 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
FAM3AP98173 BX539320.1-201ENST00000623759 877 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
FAM3AP98173 MXD1-206ENST00000540449 5580 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
FAM3AP98173 ANKLE1-201ENST00000394458 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
FAM3AP98173 KIFC3-207ENST00000543930 3018 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
FAM3AP98173 PDIA4-201ENST00000286091 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
FAM3AP98173 IRAK1-203ENST00000369980 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
FAM3AP98173 LILRP2-201ENST00000413439 2127 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
FAM3AP98173 LINC00841-201ENST00000451929 2126 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
FAM3AP98173 F2-201ENST00000311907 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
FAM3AP98173 AL669831.1-201ENST00000506640 6432 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
FAM3AP98173 POMK-203ENST00000614426 1527 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.13□□□□□ -0.31
FAM3AP98173 TLL1-201ENST00000061240 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
FAM3AP98173 ZDHHC11-209ENST00000511539 1303 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
FAM3AP98173 RSPH3-201ENST00000252655 2175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
FAM3AP98173 FAM110C-201ENST00000327669 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
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