Protein–RNA interactions for Protein: P56817

BACE1, Beta-secretase 1, humanhuman

Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BACE1P56817 BNIP1-201ENST00000231668 1339 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
BACE1P56817 SUZ12-204ENST00000580398 3977 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
BACE1P56817 NFATC4-222ENST00000555590 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
BACE1P56817 UGT3A1-204ENST00000507113 1650 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
BACE1P56817 TRIM46-211ENST00000611379 3082 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
BACE1P56817 BAIAP2-201ENST00000321280 1939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
BACE1P56817 FAM131B-206ENST00000443739 4382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
BACE1P56817 AC013726.1-201ENST00000563747 2285 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
BACE1P56817 IQCA1L-203ENST00000615129 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
BACE1P56817 GCK-203ENST00000395796 2539 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
BACE1P56817 AC019205.2-202ENST00000441363 2403 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
BACE1P56817 MAP1LC3B-201ENST00000268607 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
BACE1P56817 TMBIM7P-203ENST00000641617 1718 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
BACE1P56817 DNM1-201ENST00000341179 3254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
BACE1P56817 GSN-206ENST00000394353 2311 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
BACE1P56817 GRIN2C-202ENST00000347612 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
BACE1P56817 YY1AP1-211ENST00000368340 2927 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
BACE1P56817 CFAP36-201ENST00000339012 1373 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
BACE1P56817 AGER-201ENST00000375055 1369 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
BACE1P56817 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
BACE1P56817 HIST1H1B-201ENST00000331442 681 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
BACE1P56817 TSPO2-201ENST00000373158 718 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
BACE1P56817 GSG1L-201ENST00000380897 1173 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
BACE1P56817 CALCA-203ENST00000396372 581 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
BACE1P56817 AL606491.1-201ENST00000412797 483 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
BACE1P56817 RPL17P11-201ENST00000417593 544 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
BACE1P56817 AC135178.1-201ENST00000458568 537 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
BACE1P56817 NEU3-205ENST00000531619 582 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
BACE1P56817 IQSEC3P1-201ENST00000538799 536 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
BACE1P56817 AC125603.3-201ENST00000550742 486 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
BACE1P56817 STUB1-204ENST00000564370 875 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
BACE1P56817 AC026803.1-201ENST00000569130 274 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
BACE1P56817 COX10-AS1-206ENST00000602743 576 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
BACE1P56817 BX005266.2-201ENST00000450704 1549 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
BACE1P56817 FH-201ENST00000366560 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
BACE1P56817 ZFP3-201ENST00000318833 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
BACE1P56817 SSH1-201ENST00000326470 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
BACE1P56817 ENDOV-213ENST00000520367 2680 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
BACE1P56817 C19orf68-203ENST00000614654 3588 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
BACE1P56817 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
BACE1P56817 SLC2A5-201ENST00000377414 2344 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
BACE1P56817 STK26-204ENST00000481105 1835 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
BACE1P56817 UBE2V2-205ENST00000521346 1322 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
BACE1P56817 PSMD14-201ENST00000409682 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
BACE1P56817 AC026688.2-201ENST00000518984 1734 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
BACE1P56817 FGF7P3-202ENST00000640245 1707 ntTSL 4 BASIC17.18■□□□□ 0.34
BACE1P56817 RAN-210ENST00000541630 1475 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
BACE1P56817 TMEM30A-201ENST00000230461 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
BACE1P56817 LYPLA1-214ENST00000618741 2526 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
BACE1P56817 SSR4P1-203ENST00000599569 2260 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
BACE1P56817 MELTF-201ENST00000296350 3963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
BACE1P56817 UBL7-201ENST00000361351 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
BACE1P56817 ALAS2-202ENST00000335854 1795 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
BACE1P56817 AC023024.1-201ENST00000558838 2590 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
BACE1P56817 ASGR1-201ENST00000269299 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
BACE1P56817 ENDOU-203ENST00000545824 1513 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
BACE1P56817 ILF2-205ENST00000615950 1906 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
BACE1P56817 SCAF1-201ENST00000360565 4306 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
BACE1P56817 WAPL-202ENST00000298767 6333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
BACE1P56817 RPAIN-201ENST00000327154 815 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
BACE1P56817 FBXO44-203ENST00000376760 822 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
BACE1P56817 LINC01388-201ENST00000416242 416 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
BACE1P56817 HCFC1-AS1-201ENST00000438219 350 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
BACE1P56817 NOC2LP1-201ENST00000450578 752 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
BACE1P56817 UBE3B-206ENST00000536398 1120 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
BACE1P56817 TGIF1-218ENST00000551402 1089 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
BACE1P56817 RN7SL555P-201ENST00000584742 339 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
BACE1P56817 DYRK1B-208ENST00000601972 772 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
BACE1P56817 Metazoa_SRP.65-201ENST00000615602 264 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
BACE1P56817 AC133540.1-201ENST00000620845 1019 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
BACE1P56817 CYP1B1-AS1-221ENST00000627172 995 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
BACE1P56817 SLC37A4-217ENST00000545985 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
BACE1P56817 NSMF-205ENST00000371474 3571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
BACE1P56817 NSMF-208ENST00000437259 3577 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
BACE1P56817 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
BACE1P56817 IQSEC2-202ENST00000396435 6015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
BACE1P56817 HIGD1A-202ENST00000418900 1322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
BACE1P56817 ZNF846-201ENST00000397902 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
BACE1P56817 GPN3-201ENST00000228827 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
BACE1P56817 HGNC:24955-201ENST00000303177 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
BACE1P56817 ANKRD33-201ENST00000301190 1935 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
BACE1P56817 MAP2K7-201ENST00000397979 3361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
BACE1P56817 NFE2L3-201ENST00000056233 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
BACE1P56817 RALGDS-205ENST00000393160 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
BACE1P56817 CNKSR1-214ENST00000531191 2673 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
BACE1P56817 LHFPL3-201ENST00000401970 1378 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
BACE1P56817 FOXP1-218ENST00000498215 2400 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
BACE1P56817 KCND3-202ENST00000315987 2716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
BACE1P56817 AC141586.1-201ENST00000399702 2748 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
BACE1P56817 RPS9-201ENST00000302907 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
BACE1P56817 TNNT2-206ENST00000367320 1007 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
BACE1P56817 AL627231.1-201ENST00000394467 1125 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
BACE1P56817 LBH-202ENST00000401506 485 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
BACE1P56817 RPL3-202ENST00000401609 1289 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
BACE1P56817 CNOT8-202ENST00000403027 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
BACE1P56817 COPS7B-205ENST00000409295 1009 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
BACE1P56817 AC012360.1-201ENST00000433219 674 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
BACE1P56817 RUFY2-205ENST00000454950 2613 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
BACE1P56817 FRMD5-209ENST00000484674 2319 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
BACE1P56817 AC105389.3-201ENST00000508038 907 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 77.8 ms