Protein–RNA interactions for Protein: P43121

MCAM, Cell surface glycoprotein MUC18, humanhuman

Predictions only

Length 646 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCAMP43121 CRHR1-208ENST00000577353 1206 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
MCAMP43121 CLEC11A-202ENST00000599973 1026 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
MCAMP43121 AC007663.3-201ENST00000609632 465 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
MCAMP43121 AL358473.2-201ENST00000610411 556 ntTSL 4 BASIC18.07■□□□□ 0.48
MCAMP43121 STPG3-204ENST00000611378 1015 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
MCAMP43121 KLF3-AS1-207ENST00000620339 558 ntTSL 4 BASIC18.07■□□□□ 0.48
MCAMP43121 AC022748.3-201ENST00000621828 275 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
MCAMP43121 SLC52A3-201ENST00000217254 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
MCAMP43121 DUS4L-201ENST00000265720 2220 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
MCAMP43121 FMNL1-206ENST00000587489 2487 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
MCAMP43121 KIAA0319L-201ENST00000325722 4789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
MCAMP43121 SEPT12-201ENST00000268231 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
MCAMP43121 TM4SF4-201ENST00000305354 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
MCAMP43121 PPFIA3-201ENST00000334186 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
MCAMP43121 SLC39A1-201ENST00000310483 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
MCAMP43121 DLX4-202ENST00000411890 1404 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
MCAMP43121 SLC8B1-201ENST00000202831 2975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
MCAMP43121 CTNND2-214ENST00000511377 4336 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
MCAMP43121 AKT1-214ENST00000555528 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
MCAMP43121 CASP2-201ENST00000310447 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
MCAMP43121 IQCE-217ENST00000623361 6775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
MCAMP43121 FAM189A2-201ENST00000257515 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
MCAMP43121 GTSF1-201ENST00000305879 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
MCAMP43121 EIF4EBP3-201ENST00000310331 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
MCAMP43121 CTHRC1-201ENST00000330295 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
MCAMP43121 KRTAP21-2-201ENST00000333892 440 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
MCAMP43121 PRDX5-203ENST00000352435 596 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
MCAMP43121 AGER-203ENST00000375065 665 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
MCAMP43121 CLIC1-206ENST00000375779 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
MCAMP43121 NCR3-204ENST00000376073 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
MCAMP43121 CD8B-204ENST00000393759 1096 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
MCAMP43121 HNRNPA1P32-201ENST00000396326 963 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
MCAMP43121 ATP5J-205ENST00000400094 589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
MCAMP43121 KRT8P13-201ENST00000463294 1010 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
MCAMP43121 AP001258.2-201ENST00000529891 490 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
MCAMP43121 CD63-214ENST00000552692 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
MCAMP43121 ACYP1-206ENST00000555694 565 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
MCAMP43121 TUBB8-202ENST00000562809 820 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
MCAMP43121 DUX4L46-201ENST00000566845 751 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
MCAMP43121 SRPX-206ENST00000544439 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
MCAMP43121 EPS8L2-201ENST00000318562 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
MCAMP43121 MAGEA2B-202ENST00000370293 1714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
MCAMP43121 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
MCAMP43121 AL589740.1-203ENST00000433637 1984 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
MCAMP43121 ABTB1-202ENST00000453791 1961 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
MCAMP43121 MBTD1-201ENST00000376381 1420 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
MCAMP43121 ACHE-202ENST00000302913 2956 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
MCAMP43121 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
MCAMP43121 RNF25-201ENST00000295704 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
MCAMP43121 SIGLEC6-202ENST00000346477 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
MCAMP43121 HVCN1-202ENST00000356742 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
MCAMP43121 ZFP3-201ENST00000318833 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
MCAMP43121 NUP88-207ENST00000573584 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
MCAMP43121 ZNF711-201ENST00000276123 2887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
MCAMP43121 TCP10-202ENST00000397829 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
MCAMP43121 INTS11-204ENST00000421495 1868 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
MCAMP43121 MARS-233ENST00000628866 2583 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
MCAMP43121 ELF2-204ENST00000394235 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
MCAMP43121 CPSF7-205ENST00000439958 3524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
MCAMP43121 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
MCAMP43121 TNFSF13-202ENST00000349228 2036 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
MCAMP43121 BRD2-201ENST00000374825 4894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
MCAMP43121 UBTF-204ENST00000436088 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
MCAMP43121 CALCR-203ENST00000394441 1774 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
MCAMP43121 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
MCAMP43121 NBPF15-202ENST00000488031 4535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
MCAMP43121 CSH1-201ENST00000316193 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
MCAMP43121 AK6-201ENST00000380818 1183 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
MCAMP43121 NRSN2-201ENST00000382285 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
MCAMP43121 PPP1R14B-202ENST00000392210 600 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
MCAMP43121 AC126915.1-201ENST00000522847 1038 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
MCAMP43121 AC145343.1-201ENST00000579629 650 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
MCAMP43121 PRCD-210ENST00000592014 462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
MCAMP43121 AC132192.2-201ENST00000596206 1147 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
MCAMP43121 AL451050.2-201ENST00000606967 682 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
MCAMP43121 AC010642.2-201ENST00000634676 2413 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
MCAMP43121 ASB3-202ENST00000394717 1734 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
MCAMP43121 GPM6A-210ENST00000506894 2614 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
MCAMP43121 AC018529.2-202ENST00000611482 3087 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
MCAMP43121 MKS1-202ENST00000393119 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
MCAMP43121 DPP6-205ENST00000427557 2388 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
MCAMP43121 CLDN22-201ENST00000323319 2581 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
MCAMP43121 NFATC2-206ENST00000609943 5690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
MCAMP43121 ATF7-205ENST00000548446 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
MCAMP43121 DAPK1-202ENST00000408954 5892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
MCAMP43121 SLC25A32-201ENST00000297578 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
MCAMP43121 OSCP1-204ENST00000433045 1381 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
MCAMP43121 MAGED4B-207ENST00000485287 2618 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
MCAMP43121 SLC2A11-203ENST00000345044 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
MCAMP43121 CALD1-222ENST00000495522 2199 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
MCAMP43121 SCYL1-208ENST00000527009 2586 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
MCAMP43121 AC092384.2-204ENST00000565053 2566 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
MCAMP43121 MCF2L-232ENST00000535094 3752 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
MCAMP43121 GSDMA-203ENST00000635792 1546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
MCAMP43121 BMP4-206ENST00000559087 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
MCAMP43121 SLC13A5-208ENST00000573648 1723 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
MCAMP43121 SH3KBP1-201ENST00000379697 1944 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
MCAMP43121 GATA3-201ENST00000346208 2654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
MCAMP43121 AC018442.1-201ENST00000421439 2061 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
MCAMP43121 WASHC2C-204ENST00000374362 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.2 ms