Protein–RNA interactions for Protein: P37268

FDFT1, Squalene synthase, humanhuman

Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FDFT1P37268 AKAP2-203ENST00000434623 4400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
FDFT1P37268 BCKDHA-201ENST00000269980 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
FDFT1P37268 AC023090.2-201ENST00000625182 2110 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
FDFT1P37268 PDIA4-201ENST00000286091 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
FDFT1P37268 ELF2-202ENST00000379549 3005 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
FDFT1P37268 RALGDS-201ENST00000372047 3598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
FDFT1P37268 STK17B-201ENST00000263955 5287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
FDFT1P37268 ECSIT-201ENST00000252440 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
FDFT1P37268 TMEM40-204ENST00000435218 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
FDFT1P37268 RDM1-224ENST00000619262 1535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
FDFT1P37268 ENDOD1-201ENST00000278505 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
FDFT1P37268 CMTM6-201ENST00000205636 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
FDFT1P37268 YME1L1-202ENST00000375972 2517 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
FDFT1P37268 UBE2D4-201ENST00000222402 3974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
FDFT1P37268 CTRB1-201ENST00000361017 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
FDFT1P37268 C10orf62-201ENST00000370640 1208 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
FDFT1P37268 IDH3B-202ENST00000380851 1230 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
FDFT1P37268 CCL25-203ENST00000390669 924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
FDFT1P37268 METTL26-204ENST00000397665 558 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
FDFT1P37268 GNAQP1-201ENST00000444815 1067 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
FDFT1P37268 RNA5SP421-201ENST00000516864 134 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
FDFT1P37268 RFPL4AP1-201ENST00000530883 850 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
FDFT1P37268 GABARAP-205ENST00000573928 476 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
FDFT1P37268 RPS15-202ENST00000585665 467 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
FDFT1P37268 AC005785.1-202ENST00000597164 237 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
FDFT1P37268 AC092070.4-201ENST00000599803 507 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
FDFT1P37268 DUSP13-214ENST00000607131 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
FDFT1P37268 ALDH3B1-203ENST00000612297 1231 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
FDFT1P37268 LINC01663-201ENST00000614596 535 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
FDFT1P37268 ARC-201ENST00000356613 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
FDFT1P37268 BX640514.1-201ENST00000583223 1918 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
FDFT1P37268 ARHGEF26-AS1-204ENST00000491862 2598 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
FDFT1P37268 KMT2E-201ENST00000257745 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
FDFT1P37268 LINC00924-202ENST00000556053 2682 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
FDFT1P37268 STRN3-201ENST00000355683 3970 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
FDFT1P37268 ENAH-203ENST00000366843 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
FDFT1P37268 SOCS5-202ENST00000394861 4058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
FDFT1P37268 FAM103A1-201ENST00000304191 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
FDFT1P37268 GLG1-203ENST00000447066 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
FDFT1P37268 CYB561D1-201ENST00000310611 5009 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
FDFT1P37268 B4GALT3-213ENST00000622395 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
FDFT1P37268 ARFGAP1-203ENST00000370283 3281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
FDFT1P37268 FAM84A-201ENST00000295092 6355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
FDFT1P37268 AP004608.1-203ENST00000528482 3679 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
FDFT1P37268 TFAP2A-213ENST00000482890 2071 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
FDFT1P37268 MEF2D-201ENST00000348159 5965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
FDFT1P37268 LANCL2-201ENST00000254770 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
FDFT1P37268 IL12A-201ENST00000305579 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
FDFT1P37268 CD300C-201ENST00000330793 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
FDFT1P37268 LTA-214ENST00000454783 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
FDFT1P37268 ENDOU-203ENST00000545824 1513 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
FDFT1P37268 TDRKH-204ENST00000368825 2651 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
FDFT1P37268 PAK2-201ENST00000327134 6139 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
FDFT1P37268 NCOR2-203ENST00000404621 8520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
FDFT1P37268 FERMT1-201ENST00000217289 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
FDFT1P37268 C1orf43-206ENST00000368521 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
FDFT1P37268 SRSF2-203ENST00000392485 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
FDFT1P37268 SLC52A3-202ENST00000381944 3060 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
FDFT1P37268 KIF22-208ENST00000569382 2020 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
FDFT1P37268 AKT1S1-205ENST00000391833 3640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
FDFT1P37268 SATB2-205ENST00000443023 6194 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
FDFT1P37268 PNKD-201ENST00000248451 758 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
FDFT1P37268 CABP5-201ENST00000293255 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
FDFT1P37268 ETFB-201ENST00000309244 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
FDFT1P37268 EIF5A-201ENST00000336452 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
FDFT1P37268 OPA1-204ENST00000361828 6381 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
FDFT1P37268 ING1-204ENST00000375775 1074 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
FDFT1P37268 AL139094.1-201ENST00000405549 1188 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
FDFT1P37268 FLG-AS1-204ENST00000420707 906 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
FDFT1P37268 HNRNPA1P40-201ENST00000426371 1278 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
FDFT1P37268 AL442647.2-201ENST00000429864 857 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
FDFT1P37268 OST4-202ENST00000447619 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
FDFT1P37268 TMPRSS11CP-201ENST00000453277 683 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
FDFT1P37268 KRBOX4-206ENST00000478600 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
FDFT1P37268 KRBOX4-207ENST00000487081 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
FDFT1P37268 FADS2-205ENST00000517839 469 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
FDFT1P37268 AURKB-214ENST00000585124 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
FDFT1P37268 TPGS2-215ENST00000590842 1239 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
FDFT1P37268 PDCD6-212ENST00000614778 1050 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
FDFT1P37268 NDUFS7-218ENST00000618074 688 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
FDFT1P37268 PCDHGC4-204ENST00000618371 812 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
FDFT1P37268 NOP16-209ENST00000618911 1087 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
FDFT1P37268 NDUFS7-219ENST00000620479 754 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
FDFT1P37268 WDR45-230ENST00000634559 1192 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
FDFT1P37268 SLC7A15P-201ENST00000424028 1363 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
FDFT1P37268 SH3PXD2B-203ENST00000519643 1394 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
FDFT1P37268 PSD2-201ENST00000274710 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
FDFT1P37268 CIAPIN1-213ENST00000569370 1559 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
FDFT1P37268 KAT5-216ENST00000534650 1875 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
FDFT1P37268 TPM3-208ENST00000341485 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
FDFT1P37268 ERN2-202ENST00000457008 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
FDFT1P37268 ATP2B3-202ENST00000349466 4280 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
FDFT1P37268 AMPD3-203ENST00000396554 3806 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
FDFT1P37268 ZNF74-209ENST00000611540 3714 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
FDFT1P37268 C22orf34-201ENST00000343999 2816 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
FDFT1P37268 TMCO3-207ENST00000474393 2843 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
FDFT1P37268 GLIPR1L2-204ENST00000550916 2609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
FDFT1P37268 ZMYND15-201ENST00000269289 2448 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
FDFT1P37268 PITPNM3-201ENST00000262483 7086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
FDFT1P37268 C1orf159-202ENST00000379320 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.5 ms