Protein–RNA interactions for Protein: P36383

GJC1, Gap junction gamma-1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 396 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJC1P36383 PPARGC1B-203ENST00000394320 4803 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GJC1P36383 AQP6-204ENST00000615425 2245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GJC1P36383 RTN3-205ENST00000356000 2645 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GJC1P36383 AKAP7-204ENST00000431975 2954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GJC1P36383 SPPL2B-207ENST00000610743 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GJC1P36383 ZKSCAN7-202ENST00000341840 1757 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GJC1P36383 PCDHA7-201ENST00000356878 2922 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GJC1P36383 COL22A1-201ENST00000303045 6346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GJC1P36383 GHRLOS-201ENST00000439539 1708 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GJC1P36383 RNASE1-202ENST00000397967 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GJC1P36383 LMX1B-204ENST00000561065 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GJC1P36383 IGHA1-202ENST00000641837 1310 ntAPPRIS P5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GJC1P36383 TOM1L2-205ENST00000478943 2098 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GJC1P36383 KDR-201ENST00000263923 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GJC1P36383 CYP4F11-203ENST00000402119 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GJC1P36383 FBXO3-203ENST00000526785 5798 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GJC1P36383 NOX3-201ENST00000159060 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GJC1P36383 CHRNA7-217ENST00000636603 2012 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GJC1P36383 COX6A1-201ENST00000229379 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GJC1P36383 FTH1-201ENST00000273550 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GJC1P36383 CABP5-201ENST00000293255 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GJC1P36383 FAM166B-201ENST00000399742 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GJC1P36383 LRP5L-201ENST00000402785 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GJC1P36383 CYSRT1-201ENST00000409414 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GJC1P36383 SYS1-203ENST00000414310 795 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GJC1P36383 AL161638.1-201ENST00000420354 481 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GJC1P36383 BASP1P1-201ENST00000430708 665 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
GJC1P36383 AL845321.1-202ENST00000432011 786 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GJC1P36383 U52111.1-201ENST00000434284 914 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GJC1P36383 TMPRSS11CP-201ENST00000453277 683 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
GJC1P36383 AL606760.1-201ENST00000458151 1181 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GJC1P36383 FTH1-202ENST00000526640 786 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GJC1P36383 RNF24-204ENST00000545616 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GJC1P36383 AC138304.1-201ENST00000563841 424 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GJC1P36383 AC010491.1-203ENST00000564167 638 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GJC1P36383 GRIA3-205ENST00000611689 936 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GJC1P36383 AL121832.1-201ENST00000615180 677 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GJC1P36383 SELENOH-206ENST00000622257 1291 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GJC1P36383 LINC00592-202ENST00000640420 768 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GJC1P36383 CLPTM1-202ENST00000541297 2732 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GJC1P36383 FAM45BP-202ENST00000592932 1624 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
GJC1P36383 NFIC-206ENST00000589123 8068 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GJC1P36383 SUGP2-215ENST00000601879 5546 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GJC1P36383 KIRREL1-204ENST00000368173 7519 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GJC1P36383 ITGAM-202ENST00000544665 4718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GJC1P36383 C21orf58-204ENST00000397682 2941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GJC1P36383 ARHGAP45-201ENST00000313093 4273 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GJC1P36383 PPFIBP1-216ENST00000545334 2805 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GJC1P36383 BTBD7P1-201ENST00000447253 1453 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
GJC1P36383 UVSSA-208ENST00000511563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GJC1P36383 ZNF331-217ENST00000512387 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GJC1P36383 RRM1-214ENST00000534285 2075 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GJC1P36383 ITPK1-207ENST00000555495 3035 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GJC1P36383 AMHR2-202ENST00000379791 1437 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
GJC1P36383 DRC7-201ENST00000336825 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
GJC1P36383 FUK-202ENST00000378912 3925 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
GJC1P36383 LINC01184-204ENST00000501702 2977 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
GJC1P36383 WDR61-201ENST00000267973 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
GJC1P36383 PGC-202ENST00000373025 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
GJC1P36383 SEPT9-244ENST00000592420 2588 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
GJC1P36383 B3GNT7-201ENST00000287590 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
GJC1P36383 KIF1BP-214ENST00000638119 2537 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
GJC1P36383 GAS2L3-201ENST00000266754 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
GJC1P36383 KIAA1217-203ENST00000376452 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
GJC1P36383 ABCB8-201ENST00000297504 2487 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
GJC1P36383 KNSTRN-202ENST00000416151 1899 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
GJC1P36383 TUBBP5-201ENST00000290377 1563 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
GJC1P36383 LATS1-207ENST00000543571 7517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
GJC1P36383 GMNN-201ENST00000230056 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
GJC1P36383 C1orf43-203ENST00000368516 872 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
GJC1P36383 AC106897.1-201ENST00000512874 394 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
GJC1P36383 TPRX2P-201ENST00000535362 881 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
GJC1P36383 CARHSP1-203ENST00000561530 729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
GJC1P36383 AC036164.1-201ENST00000570544 333 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
GJC1P36383 RNA5-8SN1-201ENST00000610460 153 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
GJC1P36383 GPALPP1-207ENST00000611650 899 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
GJC1P36383 RNA5-8SN5-202ENST00000612463 153 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
GJC1P36383 RNA5-8SN4-201ENST00000613359 153 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
GJC1P36383 RNA5-8SN5-201ENST00000619471 153 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
GJC1P36383 ERC1-219ENST00000546231 4390 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
GJC1P36383 IDH2-201ENST00000330062 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
GJC1P36383 ZNF30-202ENST00000439785 2651 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
GJC1P36383 TM4SF19-AS1-203ENST00000452051 1829 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
GJC1P36383 DNAJA1-201ENST00000330899 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
GJC1P36383 OR2V1-205ENST00000642036 2609 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.15
GJC1P36383 AC140479.7-201ENST00000636301 2332 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
GJC1P36383 SUPT20H-212ENST00000475892 2836 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
GJC1P36383 KRT9-202ENST00000588431 1493 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
GJC1P36383 PIK3IP1-201ENST00000215912 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
GJC1P36383 FARS2-202ENST00000324331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
GJC1P36383 CCP110-203ENST00000396212 5549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
GJC1P36383 TSEN2-205ENST00000444864 2697 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
GJC1P36383 GORASP2-201ENST00000234160 3173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GJC1P36383 LPAR5-201ENST00000329858 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GJC1P36383 ABCA7-202ENST00000433129 6704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GJC1P36383 CAND2-201ENST00000295989 4429 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GJC1P36383 IKZF1-205ENST00000357364 5925 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GJC1P36383 TRIM13-201ENST00000356017 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GJC1P36383 RSPRY1-202ENST00000537866 3586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GJC1P36383 ZBED1-201ENST00000381218 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.2 ms