Protein–RNA interactions for Protein: P31268

HOXA7, Homeobox protein Hox-A7, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 230 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA7P31268 CRISPLD2-203ENST00000564567 1651 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
HOXA7P31268 MXD4-201ENST00000337190 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
HOXA7P31268 LEKR1-209ENST00000491763 1940 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
HOXA7P31268 GMPR2-231ENST00000620807 1910 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
HOXA7P31268 GRSF1-208ENST00000545193 2682 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
HOXA7P31268 NFYC-205ENST00000372654 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
HOXA7P31268 KCTD1-203ENST00000417602 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
HOXA7P31268 ASAH1-249ENST00000637528 2215 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
HOXA7P31268 CDKN2AIP-203ENST00000504169 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
HOXA7P31268 BACE2-203ENST00000347667 8764 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
HOXA7P31268 RGL3-201ENST00000380456 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
HOXA7P31268 COMMD4-201ENST00000267935 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
HOXA7P31268 HMGN3-201ENST00000275036 831 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
HOXA7P31268 COMMD4-202ENST00000338995 722 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
HOXA7P31268 HMGN3-202ENST00000344726 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
HOXA7P31268 MRPL43-206ENST00000370236 866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
HOXA7P31268 MRPL43-207ENST00000370241 824 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
HOXA7P31268 AK6-201ENST00000380818 1183 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
HOXA7P31268 AL591684.1-201ENST00000434533 234 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
HOXA7P31268 AC092800.1-201ENST00000449492 579 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
HOXA7P31268 AL136982.2-201ENST00000451760 234 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
HOXA7P31268 ADIG-204ENST00000537425 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
HOXA7P31268 MRPL48-210ENST00000542303 661 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
HOXA7P31268 AC138123.2-203ENST00000552451 653 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
HOXA7P31268 AF111169.4-201ENST00000556368 749 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
HOXA7P31268 COMMD4-211ENST00000564815 639 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
HOXA7P31268 SNORD3B-2-202ENST00000571722 791 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
HOXA7P31268 GEMIN7-204ENST00000591747 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
HOXA7P31268 AL133499.1-201ENST00000596207 608 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
HOXA7P31268 SPCS2P2-201ENST00000603270 608 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
HOXA7P31268 TBC1D10B-201ENST00000409939 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
HOXA7P31268 CACNA1A-253ENST00000637927 6847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
HOXA7P31268 PARN-202ENST00000420015 2360 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
HOXA7P31268 MZF1-201ENST00000215057 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
HOXA7P31268 TIGD2-202ENST00000603357 3217 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.39■□□□□ 0.37
HOXA7P31268 PRRT4-201ENST00000446477 3544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
HOXA7P31268 WASH3P-207ENST00000560956 1394 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
HOXA7P31268 AC010547.4-201ENST00000561754 1378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
HOXA7P31268 STRN-202ENST00000379213 2254 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
HOXA7P31268 EXOC7-213ENST00000467929 2260 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
HOXA7P31268 AC023024.1-201ENST00000558838 2590 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
HOXA7P31268 DNM1-208ENST00000486160 3181 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
HOXA7P31268 ADD1-205ENST00000398125 4079 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
HOXA7P31268 MIR137HG-202ENST00000424528 2639 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
HOXA7P31268 RELT-201ENST00000064780 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
HOXA7P31268 KAZN-201ENST00000361144 3838 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
HOXA7P31268 RIMS1-210ENST00000491071 5047 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
HOXA7P31268 AC009093.2-202ENST00000620513 2079 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
HOXA7P31268 TMBIM1-201ENST00000258412 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
HOXA7P31268 MAD1L1-203ENST00000402746 2355 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
HOXA7P31268 NSFL1C-201ENST00000216879 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
HOXA7P31268 MVB12B-201ENST00000361171 4819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
HOXA7P31268 AL354813.1-201ENST00000526566 2437 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
HOXA7P31268 TMEM9-204ENST00000367334 1529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
HOXA7P31268 SH2B1-201ENST00000322610 3095 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
HOXA7P31268 EPS15L1-207ENST00000594975 2489 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
HOXA7P31268 SYP-207ENST00000479808 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
HOXA7P31268 AL137783.1-201ENST00000623494 1896 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
HOXA7P31268 DGAT2L6-201ENST00000333026 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
HOXA7P31268 CTSD-211ENST00000637387 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
HOXA7P31268 BID-213ENST00000615414 2236 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
HOXA7P31268 AC068580.4-201ENST00000636615 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
HOXA7P31268 ARF5-201ENST00000000233 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
HOXA7P31268 MIR33B-201ENST00000385104 96 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
HOXA7P31268 MPV17-204ENST00000399052 749 ntTSL 4 BASIC17.38■□□□□ 0.37
HOXA7P31268 AC007274.2-201ENST00000421675 662 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
HOXA7P31268 CMC1-204ENST00000423894 549 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
HOXA7P31268 AC006335.1-201ENST00000445200 547 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
HOXA7P31268 FTLP1-201ENST00000449155 526 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
HOXA7P31268 KLK11-204ENST00000453757 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
HOXA7P31268 PARP8-206ENST00000503665 572 ntTSL 4 BASIC17.38■□□□□ 0.37
HOXA7P31268 AC008443.1-201ENST00000511331 1000 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
HOXA7P31268 FAM86B1-218ENST00000534520 808 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
HOXA7P31268 AP006333.2-201ENST00000544948 732 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
HOXA7P31268 CROCCP3-204ENST00000590118 574 ntTSL 4 BASIC17.38■□□□□ 0.37
HOXA7P31268 AC008825.2-201ENST00000603374 718 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
HOXA7P31268 PRR5-203ENST00000403581 2279 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
HOXA7P31268 ASAH1-221ENST00000636128 1608 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
HOXA7P31268 TRIM13-204ENST00000420995 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
HOXA7P31268 AP003680.1-201ENST00000598970 3660 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
HOXA7P31268 DUSP11-201ENST00000272444 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
HOXA7P31268 KIF22-208ENST00000569382 2020 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
HOXA7P31268 AKT1-214ENST00000555528 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
HOXA7P31268 DUSP18-201ENST00000334679 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
HOXA7P31268 SERTM1-201ENST00000315190 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
HOXA7P31268 ING1-203ENST00000375774 2870 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
HOXA7P31268 HOXA3-202ENST00000396352 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
HOXA7P31268 RREB1-204ENST00000379938 8778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
HOXA7P31268 PELP1-208ENST00000572293 5272 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
HOXA7P31268 GHDC-201ENST00000301671 2650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
HOXA7P31268 STT3B-201ENST00000295770 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
HOXA7P31268 ZNF385A-201ENST00000338010 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
HOXA7P31268 ALG9-201ENST00000398006 2345 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
HOXA7P31268 MROH4P-201ENST00000431302 1578 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
HOXA7P31268 KATNA1-203ENST00000367411 1984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
HOXA7P31268 PTPN20-206ENST00000395722 1995 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
HOXA7P31268 SLC27A6-201ENST00000262462 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
HOXA7P31268 SLCO6A1-207ENST00000513675 1611 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
HOXA7P31268 ZNF134-201ENST00000396161 4914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
HOXA7P31268 AL157791.1-201ENST00000553667 1699 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.1 ms