Protein–RNA interactions for Protein: P29033

GJB2, Gap junction beta-2 protein, humanhuman

Predictions only

Length 226 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJB2P29033 AC055811.4-201ENST00000624039 1754 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
GJB2P29033 FOXRED2-201ENST00000216187 3933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
GJB2P29033 FAM107A-206ENST00000474531 2271 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
GJB2P29033 RGR-201ENST00000358110 1349 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
GJB2P29033 SAMD4A-208ENST00000555192 1337 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
GJB2P29033 SERINC2-206ENST00000536859 2072 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
GJB2P29033 WDR61-201ENST00000267973 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
GJB2P29033 GOLGA6L2-201ENST00000312015 1379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
GJB2P29033 FOXD4L5-201ENST00000377420 3109 ntAPPRIS P1 BASIC17.65■□□□□ 0.42
GJB2P29033 SYAP1-201ENST00000380155 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
GJB2P29033 IRAK4-212ENST00000551736 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
GJB2P29033 ITGB4-206ENST00000579662 5554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
GJB2P29033 ADAM23-202ENST00000374415 2714 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.42
GJB2P29033 CAMLG-201ENST00000297156 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
GJB2P29033 DRC3-216ENST00000584166 1953 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
GJB2P29033 LINC01285-201ENST00000412422 2289 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
GJB2P29033 TMEM230-201ENST00000202834 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
GJB2P29033 MLXIPL-205ENST00000429400 3173 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
GJB2P29033 ERLIN2-205ENST00000518586 2623 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
GJB2P29033 MANBAL-204ENST00000397151 1503 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
GJB2P29033 MANBAL-205ENST00000397152 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
GJB2P29033 ENDOU-203ENST00000545824 1513 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
GJB2P29033 RDM1-224ENST00000619262 1535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
GJB2P29033 DSE-202ENST00000359564 4037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
GJB2P29033 ZBTB7C-204ENST00000586438 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
GJB2P29033 LPO-210ENST00000582328 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
GJB2P29033 B9D2-201ENST00000243578 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
GJB2P29033 AHNAK-201ENST00000257247 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
GJB2P29033 SPDYE19P-201ENST00000338590 713 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
GJB2P29033 NTMT1-201ENST00000372480 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
GJB2P29033 ZDHHC12-201ENST00000372663 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
GJB2P29033 FAM166B-201ENST00000399742 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
GJB2P29033 CYSRT1-201ENST00000409414 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
GJB2P29033 TMEM176B-202ENST00000429904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
GJB2P29033 METTL21A-209ENST00000448823 869 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
GJB2P29033 TMPRSS11CP-201ENST00000453277 683 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
GJB2P29033 AC106897.1-201ENST00000512874 394 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
GJB2P29033 AC009163.1-201ENST00000530512 573 ntTSL 4 BASIC17.64■□□□□ 0.41
GJB2P29033 AC233702.7-201ENST00000536958 924 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
GJB2P29033 SECTM1-202ENST00000580437 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
GJB2P29033 NMNAT3-201ENST00000296202 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
GJB2P29033 BAG4-201ENST00000287322 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
GJB2P29033 ZNF79-202ENST00000543471 2194 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
GJB2P29033 ZNF79-203ENST00000612342 2192 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
GJB2P29033 NIPA1-201ENST00000337435 6567 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
GJB2P29033 FKBPL-201ENST00000375156 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
GJB2P29033 AC006262.1-203ENST00000598170 1634 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
GJB2P29033 MROH1-201ENST00000326134 5183 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
GJB2P29033 KCNN2-201ENST00000264773 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
GJB2P29033 UBAP1-202ENST00000359544 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
GJB2P29033 PTPN20-206ENST00000395722 1995 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
GJB2P29033 NR4A1-213ENST00000550082 2029 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
GJB2P29033 PCSK5-205ENST00000545128 9538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
GJB2P29033 FKBP6-204ENST00000431982 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
GJB2P29033 SPIDR-201ENST00000297423 3988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
GJB2P29033 CLN3-229ENST00000567963 1452 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
GJB2P29033 CICP4-201ENST00000447359 2812 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
GJB2P29033 ZNF256-201ENST00000282308 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
GJB2P29033 BTN1A1-201ENST00000244513 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
GJB2P29033 CKMT2-201ENST00000254035 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
GJB2P29033 TMTC1-207ENST00000552618 3915 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
GJB2P29033 CCHCR1-201ENST00000376266 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
GJB2P29033 TTC28-AS1-219ENST00000454741 5064 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
GJB2P29033 TSPAN18-207ENST00000520358 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
GJB2P29033 COX6A1-201ENST00000229379 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
GJB2P29033 UNC5A-201ENST00000329542 3812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
GJB2P29033 C1orf43-203ENST00000368516 872 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
GJB2P29033 LRP5L-201ENST00000402785 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
GJB2P29033 MIPEPP3-202ENST00000424756 347 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
GJB2P29033 MOGAT3-203ENST00000440203 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
GJB2P29033 GNAQP1-201ENST00000444815 1067 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
GJB2P29033 AL627443.1-201ENST00000456477 1035 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
GJB2P29033 HSPB7-207ENST00000487046 844 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
GJB2P29033 AC022447.6-201ENST00000515522 438 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
GJB2P29033 AC009686.1-201ENST00000522494 364 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
GJB2P29033 BRI3BPP1-201ENST00000594224 787 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
GJB2P29033 AC106028.4-201ENST00000614509 607 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
GJB2P29033 HIST1H2BO-201ENST00000616182 381 ntAPPRIS P1 BASIC17.63■□□□□ 0.41
GJB2P29033 NDUFS7-218ENST00000618074 688 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
GJB2P29033 PCDHGC4-204ENST00000618371 812 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
GJB2P29033 NDUFS7-219ENST00000620479 754 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
GJB2P29033 SELENOH-206ENST00000622257 1291 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
GJB2P29033 GSG1L-203ENST00000447459 4916 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
GJB2P29033 NXF1-213ENST00000532297 2795 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
GJB2P29033 CCNF-202ENST00000397066 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
GJB2P29033 OSBPL7-211ENST00000613735 2836 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
GJB2P29033 DAB2IP-201ENST00000259371 5469 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
GJB2P29033 SLC11A2-204ENST00000541174 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
GJB2P29033 AMACR-203ENST00000382072 2919 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
GJB2P29033 JRK-210ENST00000614134 8932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
GJB2P29033 SLC35C1-201ENST00000314134 4171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
GJB2P29033 PGBD5-201ENST00000391860 10961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
GJB2P29033 ZFR2-201ENST00000262961 4756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
GJB2P29033 CHPF2-204ENST00000495645 2709 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
GJB2P29033 FES-202ENST00000394300 2302 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
GJB2P29033 PAK4-208ENST00000599386 5735 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
GJB2P29033 MCRS1-211ENST00000550165 1936 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
GJB2P29033 IGSF1-204ENST00000370903 4594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
GJB2P29033 HDAC2-206ENST00000519108 2000 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
GJB2P29033 RHD-206ENST00000423810 1637 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.9 ms