Protein–RNA interactions for Protein: P28749

RBL1, Retinoblastoma-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,068 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBL1P28749 TMEM40-204ENST00000435218 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RBL1P28749 MPI-203ENST00000535694 1523 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RBL1P28749 PHF14-215ENST00000634607 3407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RBL1P28749 SLC1A5-201ENST00000412532 1750 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RBL1P28749 AGER-206ENST00000375070 1463 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RBL1P28749 AGER-208ENST00000438221 1493 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RBL1P28749 POLD3-208ENST00000532497 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RBL1P28749 VILL-202ENST00000383759 2787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RBL1P28749 PODN-202ENST00000371500 3287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RBL1P28749 GSK3B-201ENST00000264235 7711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RBL1P28749 FGD5-AS1-202ENST00000424349 3792 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RBL1P28749 KATNBL1-201ENST00000256544 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RBL1P28749 PHF3-209ENST00000509330 2969 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RBL1P28749 TRMT1-201ENST00000221504 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RBL1P28749 CASC3-201ENST00000264645 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RBL1P28749 MSI2-202ENST00000322684 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RBL1P28749 DDC-202ENST00000380984 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RBL1P28749 ZNF7-203ENST00000525266 1874 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RBL1P28749 UBA1-201ENST00000335972 3559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RBL1P28749 PRKD2-202ENST00000433867 3321 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RBL1P28749 TMCO3-202ENST00000434316 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RBL1P28749 CASP2-207ENST00000619992 4006 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RBL1P28749 PUDP-203ENST00000424830 1334 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RBL1P28749 ZDHHC11-209ENST00000511539 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RBL1P28749 MAGED4B-202ENST00000360134 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RBL1P28749 SHISA6-204ENST00000441885 7575 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RBL1P28749 API5-203ENST00000455725 2257 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RBL1P28749 GPRC5C-202ENST00000392627 2988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RBL1P28749 MAMLD1-203ENST00000370401 4854 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RBL1P28749 SUMO3-203ENST00000397898 1779 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RBL1P28749 AC023632.2-201ENST00000523011 1789 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RBL1P28749 COMP-201ENST00000222271 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RBL1P28749 PHLDA1-203ENST00000619060 5913 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RBL1P28749 MX1-218ENST00000619682 1980 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RBL1P28749 LRRN1-201ENST00000319331 3823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RBL1P28749 ACTA1-201ENST00000366683 1122 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RBL1P28749 KRTAP1-4-201ENST00000377747 408 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RBL1P28749 BAX-206ENST00000415969 540 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RBL1P28749 SOCS2P1-201ENST00000417727 557 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
RBL1P28749 MYCLP2-201ENST00000449268 967 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
RBL1P28749 TMEM161B-AS1-202ENST00000501715 1101 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RBL1P28749 RPS15-202ENST00000585665 467 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RBL1P28749 LINC02560-201ENST00000596379 459 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
RBL1P28749 AC011497.1-201ENST00000596781 561 ntTSL 4 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RBL1P28749 ZNF83-215ENST00000600714 810 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RBL1P28749 TMEM261P1-201ENST00000604899 340 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
RBL1P28749 KISS1-202ENST00000625357 435 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RBL1P28749 TACR3-201ENST00000304883 5190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RBL1P28749 TPM1-206ENST00000358278 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RBL1P28749 GLIS2-201ENST00000262366 4469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RBL1P28749 E2F6-201ENST00000307236 3317 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RBL1P28749 SNX14-202ENST00000346348 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RBL1P28749 CATSPER2P1-203ENST00000429276 1466 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RBL1P28749 TDRD5-204ENST00000444136 3946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RBL1P28749 MAPT-204ENST00000344290 6816 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RBL1P28749 CCT4-201ENST00000394440 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RBL1P28749 DMTN-205ENST00000432128 2508 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RBL1P28749 ZC3HAV1-204ENST00000471652 3182 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RBL1P28749 MRPL11-201ENST00000310999 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RBL1P28749 ABCB8-212ENST00000477719 1625 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RBL1P28749 NEU3-206ENST00000532963 1643 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RBL1P28749 VCAN-211ENST00000513984 1825 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RBL1P28749 ADAM22-204ENST00000398204 9334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RBL1P28749 LANCL2-201ENST00000254770 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RBL1P28749 SLC26A11-201ENST00000361193 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RBL1P28749 FAM122A-201ENST00000394264 4575 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RBL1P28749 GLUL-203ENST00000339526 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RBL1P28749 RIOX2-202ENST00000360258 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RBL1P28749 PUDP-202ENST00000412827 1376 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RBL1P28749 AL391825.1-201ENST00000457671 1364 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
RBL1P28749 FAM103A1-201ENST00000304191 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RBL1P28749 CIAPIN1-213ENST00000569370 1559 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RBL1P28749 ELMSAN1-201ENST00000286523 8091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RBL1P28749 SPRY4-202ENST00000434127 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RBL1P28749 ARHGAP4-203ENST00000370028 3372 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RBL1P28749 MBOAT2-201ENST00000305997 7751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RBL1P28749 PPP1R13L-202ENST00000418234 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RBL1P28749 SLC22A15-202ENST00000369503 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RBL1P28749 DUOXA1-216ENST00000613425 1867 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RBL1P28749 TMPRSS4-214ENST00000523251 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RBL1P28749 RNASEH2B-202ENST00000422660 4830 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RBL1P28749 ENDOV-201ENST00000323854 1226 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RBL1P28749 TNFRSF12A-202ENST00000341627 881 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RBL1P28749 SDHB-201ENST00000375499 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RBL1P28749 XAGE1A-203ENST00000375602 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RBL1P28749 XAGE1B-203ENST00000375616 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RBL1P28749 MAP9-202ENST00000379248 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RBL1P28749 LSM5-207ENST00000410044 687 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RBL1P28749 AL589986.1-201ENST00000429230 789 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RBL1P28749 AC016735.2-201ENST00000438736 569 ntTSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RBL1P28749 TIMM8B-201ENST00000504148 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RBL1P28749 AC136475.2-201ENST00000526612 392 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RBL1P28749 API5-211ENST00000534695 560 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RBL1P28749 IL32-234ENST00000552936 713 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RBL1P28749 AC026471.2-201ENST00000569782 655 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RBL1P28749 SMIM22-202ENST00000586440 549 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RBL1P28749 AC133539.2-201ENST00000604757 467 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
RBL1P28749 CDKN2AIP-201ENST00000302350 2646 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RBL1P28749 PLEKHN1-203ENST00000379410 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RBL1P28749 FBLN2-203ENST00000404922 4318 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.6 ms