Protein–RNA interactions for Protein: P25788

PSMA3, Proteasome subunit alpha type-3, humanhuman

Predictions only

Length 255 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMA3P25788 MX1-210ENST00000455164 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PSMA3P25788 CAMK2B-206ENST00000353625 1624 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PSMA3P25788 F8-201ENST00000330287 2620 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PSMA3P25788 PDE8B-202ENST00000333194 2572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PSMA3P25788 AC010931.2-202ENST00000514871 2566 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PSMA3P25788 PLEKHB2-207ENST00000438882 1460 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
PSMA3P25788 AC003102.2-201ENST00000589195 1469 ntBASIC15.03■□□□□ -0
PSMA3P25788 PPP3CB-201ENST00000342558 2418 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
PSMA3P25788 GCM2-201ENST00000379491 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PSMA3P25788 ADD1-204ENST00000398123 2361 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PSMA3P25788 ESRRB-207ENST00000556177 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PSMA3P25788 PPP1R27-202ENST00000570394 1443 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
PSMA3P25788 TBCEL-205ENST00000529397 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PSMA3P25788 ZNF451-201ENST00000357489 4998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PSMA3P25788 AC134312.5-201ENST00000568031 1313 ntBASIC15.03■□□□□ -0
PSMA3P25788 PRKN-201ENST00000338468 1276 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PSMA3P25788 CALY-203ENST00000368558 825 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
PSMA3P25788 PFDN6-202ENST00000374607 598 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
PSMA3P25788 PFDN6-203ENST00000374610 521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
PSMA3P25788 CPLX2-202ENST00000393745 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PSMA3P25788 POM121L8P-201ENST00000417732 1281 ntBASIC15.03■□□□□ -0
PSMA3P25788 AC104135.1-201ENST00000418001 763 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
PSMA3P25788 AC099754.1-201ENST00000435884 454 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
PSMA3P25788 POM121L9P-203ENST00000441984 1285 ntBASIC15.03■□□□□ -0
PSMA3P25788 AC128709.1-201ENST00000445908 600 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
PSMA3P25788 LINC00824-206ENST00000523173 920 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
PSMA3P25788 AP001889.1-201ENST00000525414 633 ntBASIC15.03■□□□□ -0
PSMA3P25788 FUZ-207ENST00000526575 482 ntTSL 4 BASIC15.03■□□□□ -0
PSMA3P25788 AC068587.3-201ENST00000526613 355 ntBASIC15.03■□□□□ -0
PSMA3P25788 BCAR3-210ENST00000539242 2114 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PSMA3P25788 POLE2-203ENST00000553805 496 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
PSMA3P25788 LINC01595-201ENST00000555406 639 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
PSMA3P25788 ZNF710-AS1-201ENST00000558334 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PSMA3P25788 GNRHR2-203ENST00000581100 1187 ntBASIC15.03■□□□□ -0
PSMA3P25788 EGLN2-209ENST00000594140 991 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
PSMA3P25788 AC004466.1-201ENST00000599515 1080 ntBASIC15.03■□□□□ -0
PSMA3P25788 AC145423.3-201ENST00000615987 467 ntBASIC15.03■□□□□ -0
PSMA3P25788 SRP9-204ENST00000619790 377 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
PSMA3P25788 SMARCD1-202ENST00000394963 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PSMA3P25788 MASTL-203ENST00000375946 3623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PSMA3P25788 EXOG-201ENST00000287675 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PSMA3P25788 ZNF586-202ENST00000396150 1977 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PSMA3P25788 AL589740.1-203ENST00000433637 1984 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
PSMA3P25788 SEMA4F-210ENST00000611975 6007 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
PSMA3P25788 PRKD2-201ENST00000291281 3070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PSMA3P25788 CYP4F3-203ENST00000586182 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
PSMA3P25788 INHBA-203ENST00000442711 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PSMA3P25788 FBXO5-202ENST00000367241 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
PSMA3P25788 LRRC59-203ENST00000576448 1531 ntBASIC15.02■□□□□ -0
PSMA3P25788 TRIM3-215ENST00000639856 2137 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
PSMA3P25788 TNFRSF10A-201ENST00000221132 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
PSMA3P25788 SOX30-202ENST00000311371 2716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
PSMA3P25788 CYTH2-214ENST00000641098 2721 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.02■□□□□ -0
PSMA3P25788 SLC25A2-201ENST00000239451 1417 ntAPPRIS P1 BASIC15.02■□□□□ -0
PSMA3P25788 E2F3-201ENST00000346618 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
PSMA3P25788 TMPO-203ENST00000343315 2465 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
PSMA3P25788 TMEM51-204ENST00000428417 1942 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
PSMA3P25788 FADS2-201ENST00000257261 2964 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
PSMA3P25788 AC123912.2-201ENST00000594927 2409 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
PSMA3P25788 CD93-201ENST00000246006 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
PSMA3P25788 GOLGA8R-201ENST00000327271 1896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
PSMA3P25788 CAMKK2-201ENST00000324774 5598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
PSMA3P25788 VCAN-211ENST00000513984 1825 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
PSMA3P25788 DGKI-201ENST00000288490 3895 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
PSMA3P25788 SS18L2-201ENST00000011691 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
PSMA3P25788 APOA1-204ENST00000375323 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
PSMA3P25788 HOPX-203ENST00000381255 1164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
PSMA3P25788 AC005229.1-201ENST00000392885 409 ntBASIC15.02■□□□□ -0
PSMA3P25788 IFI27L1-201ENST00000393115 674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
PSMA3P25788 WDR45-208ENST00000396681 1146 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
PSMA3P25788 NGDN-202ENST00000408901 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
PSMA3P25788 C17orf51-202ENST00000412778 877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
PSMA3P25788 LRRC74B-201ENST00000442047 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
PSMA3P25788 SNHG11-212ENST00000449351 954 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
PSMA3P25788 AC007389.4-201ENST00000454674 793 ntBASIC15.02■□□□□ -0
PSMA3P25788 AC093904.1-201ENST00000474561 455 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
PSMA3P25788 USP32P1-208ENST00000506594 1164 ntBASIC15.02■□□□□ -0
PSMA3P25788 AP005018.1-201ENST00000525475 301 ntBASIC15.02■□□□□ -0
PSMA3P25788 HOPX-210ENST00000553379 1001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
PSMA3P25788 HOPX-212ENST00000555760 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
PSMA3P25788 HOPX-213ENST00000556376 1064 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
PSMA3P25788 AC012645.3-203ENST00000567153 520 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
PSMA3P25788 CCL5-202ENST00000605140 1244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
PSMA3P25788 AC005391.1-201ENST00000613285 341 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
PSMA3P25788 KCNK4-TEX40-201ENST00000539086 2733 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
PSMA3P25788 C1orf43-206ENST00000368521 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
PSMA3P25788 CACNB3-201ENST00000301050 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
PSMA3P25788 MAGED4B-207ENST00000485287 2618 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
PSMA3P25788 EP400-203ENST00000333577 3092 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
PSMA3P25788 LSS-202ENST00000397728 4936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
PSMA3P25788 TP73-213ENST00000604479 1623 ntTSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
PSMA3P25788 MYADML2-201ENST00000409745 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
PSMA3P25788 HOXB4-201ENST00000332503 3757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
PSMA3P25788 ATG4B-205ENST00000404914 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
PSMA3P25788 GPR161-202ENST00000367835 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
PSMA3P25788 PPP4R3A-205ENST00000554684 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
PSMA3P25788 RTN4RL1-201ENST00000331238 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
PSMA3P25788 FBN3-205ENST00000600128 9362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
PSMA3P25788 UBA6-AS1-201ENST00000498917 1445 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
PSMA3P25788 TUBGCP2-203ENST00000368563 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 77.8 ms