Protein–RNA interactions for Protein: P23469

PTPRE, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase epsilon, humanhuman

Predictions only

Length 700 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPREP23469 CICP23-201ENST00000605013 2741 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
PTPREP23469 ZNF586-201ENST00000391702 2265 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
PTPREP23469 AC013726.1-201ENST00000563747 2285 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
PTPREP23469 C8orf74-201ENST00000304519 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
PTPREP23469 TPM3P8-201ENST00000330554 643 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
PTPREP23469 ZNF248-202ENST00000374648 1286 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
PTPREP23469 NDUFC1-201ENST00000394223 598 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
PTPREP23469 ZSCAN32-204ENST00000422427 1267 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
PTPREP23469 NUS1P3-201ENST00000423502 862 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
PTPREP23469 DHDDS-206ENST00000427245 868 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
PTPREP23469 SPATA3-204ENST00000433428 856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
PTPREP23469 LINC01762-204ENST00000434879 436 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
PTPREP23469 CNN2P10-201ENST00000443067 918 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
PTPREP23469 BX322559.1-201ENST00000456613 319 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
PTPREP23469 YIF1A-210ENST00000496746 667 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
PTPREP23469 SPATA24-205ENST00000509959 641 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
PTPREP23469 AC005597.1-201ENST00000588092 420 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
PTPREP23469 AC025181.2-201ENST00000606994 802 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
PTPREP23469 AL645728.2-202ENST00000641679 227 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
PTPREP23469 HLF-201ENST00000226067 5547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
PTPREP23469 SMPDL3A-201ENST00000368440 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
PTPREP23469 RASGRF1-202ENST00000419573 6294 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
PTPREP23469 BRCC3-201ENST00000330045 2496 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
PTPREP23469 LY9-204ENST00000368039 1364 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
PTPREP23469 MAPK14-204ENST00000468133 1376 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
PTPREP23469 HSFX2-201ENST00000598963 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
PTPREP23469 DCBLD1-202ENST00000338728 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
PTPREP23469 HDAC5-201ENST00000225983 5326 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
PTPREP23469 PXN-201ENST00000228307 3785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
PTPREP23469 WASHC2C-202ENST00000359860 4471 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
PTPREP23469 AL354989.2-201ENST00000435838 1540 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
PTPREP23469 RGPD5-202ENST00000272454 2907 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
PTPREP23469 NMNAT3-203ENST00000413939 1711 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
PTPREP23469 WRAP53-210ENST00000534050 1736 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
PTPREP23469 PRRT2-207ENST00000572820 2403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
PTPREP23469 CNOT8-201ENST00000285896 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
PTPREP23469 ITGB2-207ENST00000397854 2592 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
PTPREP23469 HARS-205ENST00000457527 1896 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
PTPREP23469 FBN1-205ENST00000560355 4109 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
PTPREP23469 SERPINA3-203ENST00000467132 2660 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
PTPREP23469 SLC12A5-201ENST00000243964 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
PTPREP23469 EIF3G-201ENST00000253108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
PTPREP23469 NOL4L-202ENST00000326071 701 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
PTPREP23469 CTNNBIP1-202ENST00000377258 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
PTPREP23469 C9orf24-203ENST00000379126 496 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
PTPREP23469 CRYAA-202ENST00000398132 826 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
PTPREP23469 AC104457.1-201ENST00000401024 814 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
PTPREP23469 MIR663B-201ENST00000408361 115 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
PTPREP23469 LINC01840-201ENST00000421870 571 ntTSL 4 BASIC17.61■□□□□ 0.41
PTPREP23469 AC016723.1-201ENST00000430546 633 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
PTPREP23469 AC005077.2-201ENST00000449786 690 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
PTPREP23469 NPHP3-AS1-201ENST00000489343 2957 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
PTPREP23469 AC113383.1-201ENST00000514696 582 ntTSL 4 BASIC17.61■□□□□ 0.41
PTPREP23469 AC013391.2-201ENST00000559041 501 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
PTPREP23469 IGHV3OR16-8-201ENST00000565407 349 ntAPPRIS P1 BASIC17.61■□□□□ 0.41
PTPREP23469 AC136428.1-201ENST00000569103 349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
PTPREP23469 ZSCAN32-210ENST00000573830 668 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
PTPREP23469 AC020914.3-201ENST00000594712 304 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
PTPREP23469 HPSE2-205ENST00000614306 447 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
PTPREP23469 FP236240.1-204ENST00000624932 712 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
PTPREP23469 RETN-203ENST00000629642 400 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
PTPREP23469 PRSS30P-206ENST00000641773 873 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
PTPREP23469 KCNG4-202ENST00000568181 2199 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
PTPREP23469 PDE8B-201ENST00000264917 5956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
PTPREP23469 LRCH1-202ENST00000389797 3314 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
PTPREP23469 PUS7-202ENST00000469408 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
PTPREP23469 AL513477.1-201ENST00000602865 2407 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
PTPREP23469 AC018735.1-201ENST00000437208 1502 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
PTPREP23469 SGCE-205ENST00000437425 1508 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
PTPREP23469 SPATA33-210ENST00000611218 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
PTPREP23469 CDH20-203ENST00000538374 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
PTPREP23469 CYP2E1-201ENST00000252945 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
PTPREP23469 RIMS1-210ENST00000491071 5047 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
PTPREP23469 RER1-203ENST00000378513 3000 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
PTPREP23469 CAMK2D-207ENST00000505990 1802 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
PTPREP23469 MAX-204ENST00000358402 1973 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PTPREP23469 FBXO21-208ENST00000622495 6040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PTPREP23469 GABARAPL1-218ENST00000546017 2294 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
PTPREP23469 NEDD1-213ENST00000557644 2367 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PTPREP23469 DIO3OS-208ENST00000556120 2473 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PTPREP23469 AJ011931.1-201ENST00000618749 2492 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
PTPREP23469 NRG1-202ENST00000356819 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PTPREP23469 TMEM97-201ENST00000226230 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PTPREP23469 NTRK3-203ENST00000357724 2980 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
PTPREP23469 WNT16-201ENST00000222462 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PTPREP23469 CIDEC-201ENST00000336832 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PTPREP23469 DBNDD2-201ENST00000357275 1036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
PTPREP23469 CSAG1-202ENST00000370287 875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PTPREP23469 C15orf48-202ENST00000396650 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PTPREP23469 CRYAA-203ENST00000398133 600 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
PTPREP23469 CIDEC-203ENST00000423850 1036 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
PTPREP23469 FGF13-204ENST00000436198 1165 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
PTPREP23469 AL139420.1-201ENST00000439394 653 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
PTPREP23469 AC139149.1-202ENST00000442532 783 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
PTPREP23469 CIDEC-206ENST00000455015 1123 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PTPREP23469 AC004522.2-201ENST00000456499 680 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
PTPREP23469 FBXL8-208ENST00000521920 574 ntTSL 4 BASIC17.6■□□□□ 0.41
PTPREP23469 IFITM3-202ENST00000526811 543 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
PTPREP23469 AC010326.4-201ENST00000604665 891 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
PTPREP23469 CCL5-202ENST00000605140 1244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.8 ms