Protein–RNA interactions for Protein: P19474

TRIM21, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM21, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM21P19474 UGT1A2P-201ENST00000454886 866 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
TRIM21P19474 SERBP1P5-201ENST00000510079 1181 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
TRIM21P19474 PTHLH-206ENST00000538310 854 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
TRIM21P19474 AC026471.2-201ENST00000569782 655 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
TRIM21P19474 RN7SL204P-201ENST00000582831 262 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
TRIM21P19474 AP001033.1-201ENST00000584509 466 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
TRIM21P19474 YTHDF3-AS1-201ENST00000603538 718 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
TRIM21P19474 AC010507.1-202ENST00000633286 381 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
TRIM21P19474 PRF1-203ENST00000638674 1080 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
TRIM21P19474 PHTF1-202ENST00000369598 3000 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
TRIM21P19474 SYT9-201ENST00000318881 3955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TRIM21P19474 LPAR5-201ENST00000329858 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TRIM21P19474 RET-201ENST00000340058 4149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TRIM21P19474 HECW1-203ENST00000453890 5169 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
TRIM21P19474 CDH23-201ENST00000224721 11139 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
TRIM21P19474 CDH23-214ENST00000622827 11122 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
TRIM21P19474 FXN-201ENST00000377270 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TRIM21P19474 RERG-209ENST00000546331 1383 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
TRIM21P19474 LTA-214ENST00000454783 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
TRIM21P19474 ALDOA-228ENST00000627059 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
TRIM21P19474 UBTF-204ENST00000436088 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
TRIM21P19474 UBE3A-224ENST00000635914 9352 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
TRIM21P19474 CACTIN-203ENST00000429344 3612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TRIM21P19474 FLII-201ENST00000327031 4338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TRIM21P19474 ASTN2-206ENST00000361477 4001 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
TRIM21P19474 POU2F2-207ENST00000529067 2657 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TRIM21P19474 GAS2L2-203ENST00000618498 2655 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TRIM21P19474 KIF3C-201ENST00000264712 5344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TRIM21P19474 TDRD10-201ENST00000368480 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
TRIM21P19474 CLN3-201ENST00000333496 1608 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
TRIM21P19474 KIF7-201ENST00000394412 4551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
TRIM21P19474 UVSSA-208ENST00000511563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
TRIM21P19474 PITPNM2-201ENST00000280562 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
TRIM21P19474 LINC01301-205ENST00000531654 1347 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
TRIM21P19474 GREM1-202ENST00000560830 2648 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
TRIM21P19474 CHRNA7-217ENST00000636603 2012 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
TRIM21P19474 GJD2-201ENST00000290374 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TRIM21P19474 SLC26A11-202ENST00000411502 2872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
TRIM21P19474 NFIC-201ENST00000341919 1573 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TRIM21P19474 ACSL3-202ENST00000392066 3147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
TRIM21P19474 AGER-204ENST00000375067 1250 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TRIM21P19474 CCL25-203ENST00000390669 924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TRIM21P19474 VAMP1-202ENST00000396308 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
TRIM21P19474 AL161638.1-201ENST00000420354 481 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
TRIM21P19474 AL353779.1-201ENST00000434793 351 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
TRIM21P19474 POLR2B-205ENST00000441246 3839 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
TRIM21P19474 METTL21A-209ENST00000448823 869 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
TRIM21P19474 PRKAG2-AS1-202ENST00000467458 1064 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TRIM21P19474 POLD4-211ENST00000539074 714 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
TRIM21P19474 PPHLN1-221ENST00000552761 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TRIM21P19474 COX11-202ENST00000571584 1108 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
TRIM21P19474 LINC01115-203ENST00000606068 577 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
TRIM21P19474 TRIM3-215ENST00000639856 2137 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
TRIM21P19474 TBXAS1-208ENST00000448866 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TRIM21P19474 SLC26A10-201ENST00000320442 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TRIM21P19474 TP73-209ENST00000603362 1668 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
TRIM21P19474 AL121723.1-201ENST00000445194 1519 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
TRIM21P19474 ZC3HAV1-204ENST00000471652 3182 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TRIM21P19474 SLC1A7-206ENST00000620347 2873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TRIM21P19474 SLIT1-201ENST00000266058 7925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TRIM21P19474 MICAL1-201ENST00000358577 3142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TRIM21P19474 ATXN10-202ENST00000381061 3135 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
TRIM21P19474 TUBB4B-201ENST00000340384 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TRIM21P19474 IL9R-202ENST00000369423 2032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TRIM21P19474 NRAS-201ENST00000369535 4449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TRIM21P19474 ALG1-204ENST00000588623 2671 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TRIM21P19474 AKAP12-204ENST00000402676 8432 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TRIM21P19474 RUNX3-201ENST00000308873 3861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TRIM21P19474 DDX50-206ENST00000610822 2510 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TRIM21P19474 URAHP-202ENST00000409873 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TRIM21P19474 KLK8-211ENST00000600767 1324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TRIM21P19474 FCHSD2-204ENST00000409418 3154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TRIM21P19474 GPC3-202ENST00000394299 2379 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TRIM21P19474 MAGEA9-201ENST00000243314 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TRIM21P19474 OXA1L-203ENST00000412791 1440 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TRIM21P19474 SF1-209ENST00000433274 2317 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TRIM21P19474 ARHGEF5-201ENST00000056217 5544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TRIM21P19474 MORN4-202ENST00000370635 419 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TRIM21P19474 LINC00659-201ENST00000412500 540 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TRIM21P19474 RAB34-206ENST00000415040 1293 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TRIM21P19474 AL161785.3-201ENST00000435157 395 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TRIM21P19474 RPL13AP25-201ENST00000484130 612 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
TRIM21P19474 C11orf98-202ENST00000525675 405 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TRIM21P19474 AC079296.1-201ENST00000531592 560 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TRIM21P19474 LINC02387-201ENST00000541749 868 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TRIM21P19474 COMMD4-217ENST00000567195 677 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TRIM21P19474 NOP16-209ENST00000618911 1087 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TRIM21P19474 KIAA0319-203ENST00000535378 6896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TRIM21P19474 TEX28-203ENST00000617225 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TRIM21P19474 PCNX1-202ENST00000439984 6988 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TRIM21P19474 CUX2-201ENST00000261726 6844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TRIM21P19474 PTPN9-206ENST00000618819 7813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TRIM21P19474 ADAM15-201ENST00000271836 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TRIM21P19474 DSE-202ENST00000359564 4037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TRIM21P19474 GLI2-203ENST00000361492 6768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TRIM21P19474 EIF3J-AS1-201ENST00000313807 2863 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TRIM21P19474 CENPO-202ENST00000380834 4386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TRIM21P19474 NUP50-201ENST00000347635 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TRIM21P19474 KNDC1-201ENST00000304613 6793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TRIM21P19474 TMCO3-202ENST00000434316 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.2 ms