Protein–RNA interactions for Protein: P17861

XBP1, X-box-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XBP1P17861 LINC02298-201ENST00000546968 965 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
XBP1P17861 ELOF1-206ENST00000590700 585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
XBP1P17861 AC025048.6-201ENST00000634326 1161 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
XBP1P17861 CICP24-201ENST00000605464 2705 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
XBP1P17861 ADPRHL1-201ENST00000356501 1877 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
XBP1P17861 LRCH1-202ENST00000389797 3314 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
XBP1P17861 AC099063.4-201ENST00000641099 1602 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
XBP1P17861 LMBRD1-202ENST00000370577 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
XBP1P17861 FAM110C-201ENST00000327669 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
XBP1P17861 HTR7-201ENST00000277874 3028 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
XBP1P17861 RER1-203ENST00000378513 3000 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
XBP1P17861 PARP10-201ENST00000313028 3497 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
XBP1P17861 KIF3C-201ENST00000264712 5344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
XBP1P17861 SPEG-201ENST00000312358 10782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
XBP1P17861 SRPK1-204ENST00000373825 4592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
XBP1P17861 AGPAT1-201ENST00000336984 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
XBP1P17861 KIF22-208ENST00000569382 2020 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
XBP1P17861 PPP4R4-201ENST00000304338 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
XBP1P17861 RTN4IP1-201ENST00000369063 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
XBP1P17861 SRPRA-206ENST00000532259 2453 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
XBP1P17861 TEN1-CDK3-202ENST00000569284 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
XBP1P17861 ZFP90-209ENST00000570495 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
XBP1P17861 PGPEP1-201ENST00000252813 1409 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
XBP1P17861 MED16-207ENST00000589119 2772 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
XBP1P17861 CPSF7-202ENST00000394888 3650 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
XBP1P17861 RNFT2-203ENST00000392549 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
XBP1P17861 GRIK5-204ENST00000593562 3308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
XBP1P17861 AC104836.1-202ENST00000636805 6041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
XBP1P17861 APP-208ENST00000439274 2517 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
XBP1P17861 CTD-2194D22.4-201ENST00000514569 1635 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
XBP1P17861 RPH3AL-202ENST00000331302 2606 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
XBP1P17861 HVCN1-202ENST00000356742 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
XBP1P17861 ST3GAL3-209ENST00000361400 2195 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
XBP1P17861 OGDH-204ENST00000443864 1744 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
XBP1P17861 GTF2H1-203ENST00000453096 2707 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
XBP1P17861 FIBP-201ENST00000338369 1261 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
XBP1P17861 IFT20-202ENST00000357896 974 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
XBP1P17861 KRTAP10-2-201ENST00000391621 1149 ntAPPRIS P1 BASIC17.48■□□□□ 0.39
XBP1P17861 LINC00351-201ENST00000424926 911 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
XBP1P17861 ACTG1P3-201ENST00000431775 1114 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
XBP1P17861 AL929472.3-201ENST00000433474 700 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
XBP1P17861 AC093879.1-201ENST00000508959 1176 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
XBP1P17861 AC012640.1-201ENST00000509915 688 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
XBP1P17861 AP003068.1-201ENST00000528887 544 ntTSL 4 BASIC17.48■□□□□ 0.39
XBP1P17861 AC105339.1-202ENST00000559535 1283 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
XBP1P17861 AC004233.1-201ENST00000570515 608 ntTSL 4 BASIC17.48■□□□□ 0.39
XBP1P17861 TUBB6-213ENST00000591909 1017 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
XBP1P17861 SHISA9-201ENST00000423335 4043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
XBP1P17861 TIGD4-201ENST00000304337 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
XBP1P17861 PUDP-202ENST00000412827 1376 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
XBP1P17861 FMNL1-206ENST00000587489 2487 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
XBP1P17861 DDX17-202ENST00000396821 4791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
XBP1P17861 NTMT1-204ENST00000372486 1487 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
XBP1P17861 CATSPER2P1-203ENST00000429276 1466 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
XBP1P17861 EXOG-201ENST00000287675 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
XBP1P17861 ZNF789-201ENST00000331410 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
XBP1P17861 AC055811.4-201ENST00000624039 1754 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
XBP1P17861 GPM6A-210ENST00000506894 2614 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
XBP1P17861 PDRG1-201ENST00000202017 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
XBP1P17861 TPCN1-214ENST00000550785 5345 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
XBP1P17861 ALAS2-201ENST00000330807 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
XBP1P17861 RTKN-202ENST00000272430 2142 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
XBP1P17861 ARAP1-203ENST00000393605 4778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
XBP1P17861 WNT16-201ENST00000222462 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
XBP1P17861 C17orf80-203ENST00000359042 3645 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
XBP1P17861 SS18L2-201ENST00000011691 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
XBP1P17861 KRTAP19-3-201ENST00000334063 522 ntAPPRIS P1 BASIC17.47■□□□□ 0.39
XBP1P17861 VAPA-201ENST00000340541 1227 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
XBP1P17861 SFT2D1-201ENST00000361731 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
XBP1P17861 NDUFC1-201ENST00000394223 598 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
XBP1P17861 HCST-202ENST00000437550 445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
XBP1P17861 CR769775.1-201ENST00000443347 931 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
XBP1P17861 ENOSF1-209ENST00000580982 1397 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
XBP1P17861 EGOT-201ENST00000414938 1464 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
XBP1P17861 UBR2-201ENST00000372899 7857 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
XBP1P17861 UBR2-202ENST00000372901 7857 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
XBP1P17861 USP37-202ENST00000338465 1771 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
XBP1P17861 JADE2-203ENST00000395003 6465 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
XBP1P17861 PTPN13-203ENST00000427191 8487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
XBP1P17861 MARVELD1-201ENST00000285605 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
XBP1P17861 COPS7B-224ENST00000620578 2500 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
XBP1P17861 CELF4-223ENST00000603232 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
XBP1P17861 H6PD-203ENST00000602477 5590 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
XBP1P17861 PIK3CG-201ENST00000359195 5377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
XBP1P17861 NR1H3-211ENST00000441012 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
XBP1P17861 ELP6-201ENST00000296149 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
XBP1P17861 ANKMY1-207ENST00000403283 2874 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
XBP1P17861 PIDD1-202ENST00000411829 2886 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
XBP1P17861 NCAPH2-201ENST00000299821 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
XBP1P17861 HENMT1-202ENST00000370032 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
XBP1P17861 PPP2R5D-208ENST00000485511 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
XBP1P17861 MAP4K1-210ENST00000591517 2700 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
XBP1P17861 TMEM230-201ENST00000202834 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
XBP1P17861 AC005264.1-201ENST00000587587 2319 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
XBP1P17861 NPY-201ENST00000242152 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
XBP1P17861 C11orf52-201ENST00000278601 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
XBP1P17861 CAVIN1-201ENST00000357037 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
XBP1P17861 C9orf24-204ENST00000379127 596 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
XBP1P17861 C2orf15-202ENST00000409684 1058 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
XBP1P17861 BAATP1-201ENST00000412284 1225 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.1 ms