Protein–RNA interactions for Protein: P16234

PDGFRA, Platelet-derived growth factor receptor alpha, humanhuman

Predictions only

Length 1,089 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDGFRAP16234 ZNF777-201ENST00000247930 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PDGFRAP16234 LRRC59-203ENST00000576448 1531 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
PDGFRAP16234 TP53INP2-201ENST00000374809 4018 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PDGFRAP16234 GINS3-203ENST00000426538 1728 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PDGFRAP16234 SEPT8-212ENST00000458488 1726 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PDGFRAP16234 OR2I1P-209ENST00000641730 5365 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
PDGFRAP16234 CELF4-223ENST00000603232 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PDGFRAP16234 PXYLP1-201ENST00000286353 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PDGFRAP16234 CNOT9-208ENST00000542068 3259 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PDGFRAP16234 LDLRAD4-205ENST00000585931 2118 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PDGFRAP16234 CPD-201ENST00000225719 9394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PDGFRAP16234 SEC24D-202ENST00000419654 2786 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PDGFRAP16234 E2F6-212ENST00000546212 3191 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PDGFRAP16234 AKT1S1-205ENST00000391833 3640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PDGFRAP16234 E2F6-202ENST00000381525 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PDGFRAP16234 SAFB-205ENST00000588852 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PDGFRAP16234 RAB1A-203ENST00000409784 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PDGFRAP16234 FUNDC2-201ENST00000369498 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PDGFRAP16234 TUBB4B-201ENST00000340384 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PDGFRAP16234 ASPH-202ENST00000379449 1603 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PDGFRAP16234 EPB41L3-202ENST00000342933 4270 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PDGFRAP16234 MIF4GD-208ENST00000579297 1419 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PDGFRAP16234 COL25A1-201ENST00000399126 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PDGFRAP16234 ETNPPL-201ENST00000296486 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PDGFRAP16234 PIK3CD-206ENST00000536656 5483 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PDGFRAP16234 PIK3CD-208ENST00000628140 5483 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PDGFRAP16234 RSPO1-204ENST00000615459 2331 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PDGFRAP16234 ALG5-201ENST00000239891 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PDGFRAP16234 B9D1-201ENST00000261499 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PDGFRAP16234 MGST3-203ENST00000367885 680 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PDGFRAP16234 SSR4-204ENST00000370087 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PDGFRAP16234 PFDN6-202ENST00000374607 598 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PDGFRAP16234 PFDN6-203ENST00000374610 521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PDGFRAP16234 B9D1-203ENST00000395615 805 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PDGFRAP16234 AC099754.1-201ENST00000435884 454 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PDGFRAP16234 SFRP4-201ENST00000436072 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PDGFRAP16234 TMEM14B-212ENST00000475942 992 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PDGFRAP16234 AC022137.2-201ENST00000503482 481 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
PDGFRAP16234 TDH-203ENST00000531764 1110 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
PDGFRAP16234 PUDP-206ENST00000540122 825 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PDGFRAP16234 AP000808.2-201ENST00000542410 569 ntTSL 4 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PDGFRAP16234 DUX4L47-201ENST00000566374 394 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
PDGFRAP16234 AC008735.3-201ENST00000596646 500 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
PDGFRAP16234 OR2I1P-210ENST00000642037 4691 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
PDGFRAP16234 RALGDS-202ENST00000372050 3634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PDGFRAP16234 EEF1AKMT3-201ENST00000300209 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PDGFRAP16234 PA2G4-201ENST00000303305 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PDGFRAP16234 NACC2-201ENST00000277554 6899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PDGFRAP16234 AIFM2-204ENST00000613322 3247 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PDGFRAP16234 MLST8-201ENST00000301724 1735 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PDGFRAP16234 AC068418.2-201ENST00000577309 3703 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
PDGFRAP16234 COCH-203ENST00000460581 2688 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PDGFRAP16234 MED16-203ENST00000325464 2922 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PDGFRAP16234 AC079336.5-201ENST00000581360 2480 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PDGFRAP16234 KRTAP10-7-201ENST00000609664 1578 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PDGFRAP16234 UBE4B-201ENST00000253251 4772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PDGFRAP16234 HEY1-202ENST00000354724 2293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PDGFRAP16234 DDX49-201ENST00000247003 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PDGFRAP16234 HM13-201ENST00000335574 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PDGFRAP16234 KCNT1-211ENST00000491806 3678 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PDGFRAP16234 AC018442.1-201ENST00000421439 2061 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
PDGFRAP16234 MTA1-203ENST00000406191 2770 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PDGFRAP16234 SLC7A4-201ENST00000382932 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PDGFRAP16234 DCAKD-201ENST00000310604 2122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PDGFRAP16234 AC023090.2-201ENST00000625182 2110 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
PDGFRAP16234 BCS1L-205ENST00000412366 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PDGFRAP16234 DAB2IP-201ENST00000259371 5469 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PDGFRAP16234 RTN4IP1-201ENST00000369063 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PDGFRAP16234 PLXDC1-201ENST00000315392 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PDGFRAP16234 ZMYND15-201ENST00000269289 2448 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PDGFRAP16234 NCAPH2-201ENST00000299821 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PDGFRAP16234 UBTF-204ENST00000436088 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PDGFRAP16234 RPL39L-201ENST00000296277 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PDGFRAP16234 GK-202ENST00000378941 458 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PDGFRAP16234 IFI27L1-201ENST00000393115 674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PDGFRAP16234 ACTBP8-201ENST00000403258 1108 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
PDGFRAP16234 TPM1-207ENST00000403994 1049 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PDGFRAP16234 ACTG1P3-201ENST00000431775 1114 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
PDGFRAP16234 PRSS42-202ENST00000447340 1280 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PDGFRAP16234 HYAL1-208ENST00000457214 1084 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PDGFRAP16234 AC093879.1-201ENST00000508959 1176 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PDGFRAP16234 SPDYE16-201ENST00000515340 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PDGFRAP16234 C12orf10-204ENST00000548632 988 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PDGFRAP16234 EEF1AKMT3-204ENST00000551420 836 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PDGFRAP16234 GCHFR-206ENST00000561160 572 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PDGFRAP16234 MIR5189-201ENST00000577370 114 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
PDGFRAP16234 RPS15-202ENST00000585665 467 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PDGFRAP16234 AC011489.1-202ENST00000586556 618 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PDGFRAP16234 AC068473.4-201ENST00000587527 585 ntTSL 4 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PDGFRAP16234 CCL4L2-214ENST00000617416 1258 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PDGFRAP16234 RABGAP1L-201ENST00000251507 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PDGFRAP16234 KRT8P35-201ENST00000483942 1338 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
PDGFRAP16234 BCL11A-203ENST00000358510 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PDGFRAP16234 HENMT1-202ENST00000370032 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PDGFRAP16234 TRPV4-201ENST00000261740 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PDGFRAP16234 PLIN1-201ENST00000300055 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PDGFRAP16234 BRINP1-202ENST00000373964 1641 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PDGFRAP16234 CECR7-202ENST00000441006 2726 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PDGFRAP16234 PWP2-201ENST00000291576 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PDGFRAP16234 CDH24-202ENST00000397359 3552 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.6 ms