Protein–RNA interactions for Protein: P13994

CCDC130, Coiled-coil domain-containing protein 130, humanhuman

Predictions only

Length 396 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC130P13994 GPR17-202ENST00000393018 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CCDC130P13994 DBI-203ENST00000393103 599 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CCDC130P13994 STX1A-203ENST00000395155 783 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CCDC130P13994 MIR1202-201ENST00000408529 83 ntBASIC16■□□□□ 0.15
CCDC130P13994 HLA-V-201ENST00000429037 534 ntBASIC16■□□□□ 0.15
CCDC130P13994 ADAMTSL1-210ENST00000431052 824 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CCDC130P13994 C14orf178-202ENST00000439131 632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CCDC130P13994 FHIT-208ENST00000492590 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CCDC130P13994 LLPH-AS1-201ENST00000510317 623 ntTSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
CCDC130P13994 AHRR-211ENST00000515206 462 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CCDC130P13994 AC005865.1-202ENST00000543036 641 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CCDC130P13994 AC090502.1-201ENST00000549905 748 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CCDC130P13994 AC090502.1-204ENST00000551210 469 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CCDC130P13994 AL603764.1-201ENST00000636452 321 ntBASIC16■□□□□ 0.15
CCDC130P13994 MAP3K10-201ENST00000253055 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CCDC130P13994 MMP25-201ENST00000336577 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CCDC130P13994 MIF4GD-208ENST00000579297 1419 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CCDC130P13994 TNR-201ENST00000263525 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CCDC130P13994 NUCKS1-201ENST00000367142 6496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CCDC130P13994 HSPA1B-201ENST00000375650 2521 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
CCDC130P13994 ATG10-203ENST00000458350 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CCDC130P13994 B3GNTL1-211ENST00000576599 1787 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CCDC130P13994 AC067930.6-201ENST00000623257 4947 ntBASIC16■□□□□ 0.15
CCDC130P13994 PAQR8-202ENST00000442253 4738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CCDC130P13994 LINC02273-201ENST00000499452 1592 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CCDC130P13994 ME2-201ENST00000321341 9415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CCDC130P13994 RPTOR-203ENST00000570891 2286 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCDC130P13994 ADAMTS13-201ENST00000355699 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCDC130P13994 PPM1B-204ENST00000378551 3877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCDC130P13994 KRT77-201ENST00000341809 3305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCDC130P13994 CKMT2-201ENST00000254035 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCDC130P13994 AL354989.2-201ENST00000435838 1540 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
CCDC130P13994 ZNF367-201ENST00000375256 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCDC130P13994 SLC36A1-207ENST00000520701 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCDC130P13994 PIGT-246ENST00000639499 2021 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCDC130P13994 ACSS2-202ENST00000360596 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCDC130P13994 POM121-203ENST00000434423 3750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCDC130P13994 ZNF286A-218ENST00000583566 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCDC130P13994 GPR84-201ENST00000267015 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCDC130P13994 PITPNM2-208ENST00000542749 6660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCDC130P13994 CBLN4-201ENST00000064571 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCDC130P13994 DTNB-228ENST00000496972 2328 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCDC130P13994 CHN2-201ENST00000222792 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCDC130P13994 POFUT2-214ENST00000615172 2472 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCDC130P13994 AJ011931.1-201ENST00000618749 2492 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
CCDC130P13994 PRTFDC1-203ENST00000376378 747 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCDC130P13994 PHACTR1-202ENST00000379329 707 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCDC130P13994 C1QTNF6-203ENST00000434784 975 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCDC130P13994 DGCR5-204ENST00000440005 1299 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCDC130P13994 CSF2RBP1-201ENST00000447905 391 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
CCDC130P13994 UEVLD-212ENST00000541984 755 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCDC130P13994 DIO3OS-203ENST00000554441 1068 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCDC130P13994 AL355102.5-201ENST00000554769 572 ntTSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCDC130P13994 CX3CL1-203ENST00000564948 563 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCDC130P13994 NAA38-206ENST00000576384 424 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCDC130P13994 SMIM24-203ENST00000587847 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCDC130P13994 AC006453.4-201ENST00000636949 1252 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
CCDC130P13994 PLAGL1-208ENST00000437412 2640 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCDC130P13994 RNF25-201ENST00000295704 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCDC130P13994 MFSD14B-201ENST00000375344 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCDC130P13994 SLC34A1-201ENST00000324417 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCDC130P13994 PAF1-201ENST00000221265 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCDC130P13994 TBC1D3G-201ENST00000569055 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCDC130P13994 TBC1D3H-201ENST00000610350 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCDC130P13994 TBC1D3L-202ENST00000617678 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCDC130P13994 LRRC57-202ENST00000397130 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCDC130P13994 RHOBTB2-206ENST00000522948 4959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCDC130P13994 TLX1NB-202ENST00000445873 1862 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCDC130P13994 ELFN1-201ENST00000424383 3845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCDC130P13994 MPP1-204ENST00000393531 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCDC130P13994 SFTA3-204ENST00000518529 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCDC130P13994 GPM6A-210ENST00000506894 2614 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCDC130P13994 MED16-207ENST00000589119 2772 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCDC130P13994 PTPN5-204ENST00000396170 3871 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCDC130P13994 FGFR1OP2-201ENST00000229395 2924 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCDC130P13994 SLC6A13-203ENST00000445055 1950 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCDC130P13994 PACSIN2-201ENST00000263246 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCDC130P13994 ZMYND15-201ENST00000269289 2448 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCDC130P13994 ICAM2-201ENST00000412356 1334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCDC130P13994 GOLGA2P7-202ENST00000400817 2850 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCDC130P13994 KLHL26-201ENST00000300976 4407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCDC130P13994 RER1-203ENST00000378513 3000 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCDC130P13994 GRB2-201ENST00000316615 3181 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCDC130P13994 PXN-201ENST00000228307 3785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCDC130P13994 MAEL-202ENST00000367872 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCDC130P13994 PNPLA3-203ENST00000423180 2222 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCDC130P13994 ACHE-202ENST00000302913 2956 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCDC130P13994 LGALS2-201ENST00000215886 591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCDC130P13994 TSPO-202ENST00000337554 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCDC130P13994 TPO-203ENST00000346956 2923 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCDC130P13994 CRELD1-203ENST00000397170 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCDC130P13994 AL445430.1-201ENST00000419796 699 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCDC130P13994 SGK2-207ENST00000426287 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCDC130P13994 GINS3-203ENST00000426538 1728 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCDC130P13994 ZNF589-204ENST00000440261 917 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCDC130P13994 AL049698.1-202ENST00000441716 757 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCDC130P13994 STAG3L5P-205ENST00000473757 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCDC130P13994 AC109479.1-201ENST00000519603 624 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCDC130P13994 AP002992.1-201ENST00000527519 491 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCDC130P13994 IFI27L1-210ENST00000556381 804 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.9 ms