Protein–RNA interactions for Protein: P0C7W6

CCDC172, Coiled-coil domain-containing protein 172, humanhuman

Predictions only

Length 258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC172P0C7W6 LMBRD1-202ENST00000370577 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCDC172P0C7W6 IGDCC3-201ENST00000327987 4479 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCDC172P0C7W6 ARFIP1-204ENST00000429148 1599 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCDC172P0C7W6 AC079447.1-201ENST00000424491 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCDC172P0C7W6 LINC02395-201ENST00000546821 3157 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCDC172P0C7W6 UVSSA-208ENST00000511563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCDC172P0C7W6 FAM174A-201ENST00000312637 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCDC172P0C7W6 FECH-202ENST00000382873 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCDC172P0C7W6 PHLDB2-203ENST00000412622 5996 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCDC172P0C7W6 SRSF8-201ENST00000587424 4028 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCDC172P0C7W6 JTB-201ENST00000271843 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCDC172P0C7W6 TSPAN4-201ENST00000346501 882 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCDC172P0C7W6 AL645937.2-201ENST00000396808 931 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
CCDC172P0C7W6 RHOG-203ENST00000396979 1289 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCDC172P0C7W6 AL161785.2-201ENST00000427080 966 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCDC172P0C7W6 MCF2L-AS1-201ENST00000446789 712 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCDC172P0C7W6 RCHY1-210ENST00000513257 759 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCDC172P0C7W6 RHOG-204ENST00000533217 886 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCDC172P0C7W6 LITAF-218ENST00000576036 603 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCDC172P0C7W6 RDM1-220ENST00000616596 1032 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCDC172P0C7W6 RDM1-228ENST00000620284 1177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCDC172P0C7W6 AL158212.4-201ENST00000624062 1286 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
CCDC172P0C7W6 AL590132.1-202ENST00000638983 4184 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCDC172P0C7W6 ZMYM3-204ENST00000373982 1867 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCDC172P0C7W6 ATE1-203ENST00000369043 4900 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCDC172P0C7W6 SYNRG-217ENST00000612223 8229 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCDC172P0C7W6 TDRD10-201ENST00000368480 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCDC172P0C7W6 TIMP2-201ENST00000262768 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCDC172P0C7W6 AATBC-201ENST00000400385 4598 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCDC172P0C7W6 AL360270.3-201ENST00000609118 1348 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
CCDC172P0C7W6 SNX19-201ENST00000265909 6535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCDC172P0C7W6 UCKL1-AS1-201ENST00000623569 3602 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
CCDC172P0C7W6 NOX4-207ENST00000525196 1555 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCDC172P0C7W6 HM13-201ENST00000335574 1809 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCDC172P0C7W6 PLXNC1-202ENST00000545312 1813 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCDC172P0C7W6 PLEKHD1-201ENST00000322564 4865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCDC172P0C7W6 HELZ2-204ENST00000467148 8064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCDC172P0C7W6 NR1H3-203ENST00000405853 1480 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCDC172P0C7W6 ZSWIM8-AS1-201ENST00000456638 1460 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCDC172P0C7W6 KRT20-201ENST00000167588 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCDC172P0C7W6 A1CF-202ENST00000373993 1997 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCDC172P0C7W6 WWC2-201ENST00000403733 8826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCDC172P0C7W6 ZC3H4-201ENST00000253048 6119 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCDC172P0C7W6 KIF6-203ENST00000394362 2394 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCDC172P0C7W6 SLC16A1-207ENST00000538576 4374 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCDC172P0C7W6 CGB7-203ENST00000597853 3386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCDC172P0C7W6 ZNF557-201ENST00000252840 2268 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCDC172P0C7W6 ATXN7-201ENST00000295900 7224 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCDC172P0C7W6 AC012414.7-201ENST00000621235 1507 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCDC172P0C7W6 AFDN-203ENST00000366806 5962 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCDC172P0C7W6 NXPH1-201ENST00000405863 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCDC172P0C7W6 SEZ6-203ENST00000360295 4306 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCDC172P0C7W6 LIMK2-204ENST00000406516 2657 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCDC172P0C7W6 FLYWCH2-201ENST00000293981 915 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCDC172P0C7W6 ATP1A1-AS1-202ENST00000369492 1011 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCDC172P0C7W6 MPV17-203ENST00000380044 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCDC172P0C7W6 MPV17-208ENST00000405076 603 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCDC172P0C7W6 TSSK5P-201ENST00000423978 907 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
CCDC172P0C7W6 METTL21A-209ENST00000448823 869 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCDC172P0C7W6 BX322559.1-201ENST00000456613 319 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCDC172P0C7W6 AC114956.2-201ENST00000512498 572 ntTSL 4 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCDC172P0C7W6 AC018558.2-201ENST00000566562 480 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCDC172P0C7W6 AC036164.1-201ENST00000570544 333 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
CCDC172P0C7W6 AC004408.1-201ENST00000579256 573 ntTSL 4 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCDC172P0C7W6 AC012615.6-204ENST00000587741 477 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCDC172P0C7W6 GPX4-206ENST00000588919 803 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCDC172P0C7W6 AC243964.2-202ENST00000591312 752 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCDC172P0C7W6 TCP10-210ENST00000617120 2182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCDC172P0C7W6 UBE2D4-201ENST00000222402 3974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCDC172P0C7W6 PPP4R4-201ENST00000304338 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCDC172P0C7W6 LDLR-202ENST00000455727 2333 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCDC172P0C7W6 MSI1-201ENST00000257552 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCDC172P0C7W6 WDR27-201ENST00000423258 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCDC172P0C7W6 HDHD3-201ENST00000238379 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCDC172P0C7W6 AC041040.2-201ENST00000622926 2899 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
CCDC172P0C7W6 PALD1-201ENST00000263563 4555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCDC172P0C7W6 AL356585.2-201ENST00000625078 2396 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
CCDC172P0C7W6 GHRLOS-201ENST00000439539 1708 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCDC172P0C7W6 PDP1-203ENST00000517764 2140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCDC172P0C7W6 PVR-203ENST00000403059 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCDC172P0C7W6 FAM230B-201ENST00000415376 1859 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCDC172P0C7W6 AC008079.1-201ENST00000434390 1859 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCDC172P0C7W6 GPSM3-207ENST00000375043 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCDC172P0C7W6 TRAK1-208ENST00000484786 2008 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CCDC172P0C7W6 SPOCK3-201ENST00000357154 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CCDC172P0C7W6 MPDU1-201ENST00000250124 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CCDC172P0C7W6 SAPCD2-201ENST00000409687 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CCDC172P0C7W6 ARVCF-203ENST00000406259 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CCDC172P0C7W6 SIDT1-201ENST00000264852 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CCDC172P0C7W6 PPM1B-205ENST00000409432 3025 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CCDC172P0C7W6 ZNF398-205ENST00000491174 2232 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CCDC172P0C7W6 AGAP4-208ENST00000618171 2387 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CCDC172P0C7W6 SOX7-201ENST00000304501 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CCDC172P0C7W6 ABCC6-208ENST00000622290 4941 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CCDC172P0C7W6 SLC52A3-205ENST00000632431 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CCDC172P0C7W6 MRPL58-201ENST00000301585 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CCDC172P0C7W6 LINC00313-201ENST00000332440 579 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CCDC172P0C7W6 FAM19A3-202ENST00000369630 1282 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CCDC172P0C7W6 AGER-204ENST00000375067 1250 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CCDC172P0C7W6 EFHD1-202ENST00000409613 1156 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.6 ms