Protein–RNA interactions for Protein: C9J2C7

NT5C1B-RDH14, NT5C1B-RDH14 readthrough (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 533 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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NT5C1B-RDH14C9J2C7 RAP2C-201ENST00000342983 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
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NT5C1B-RDH14C9J2C7 TMEM263-201ENST00000280756 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NT5C1B-RDH14C9J2C7 CD27-201ENST00000266557 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
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