Protein–RNA interactions for Protein: A6NCF5

KLHL33, Kelch-like protein 33, humanhuman

Predictions only

Length 533 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL33A6NCF5 DNM1P41-201ENST00000623634 3350 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
KLHL33A6NCF5 HPCAL1-202ENST00000381765 1904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
KLHL33A6NCF5 ZNF747-202ENST00000395094 3504 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
KLHL33A6NCF5 LINC01116-202ENST00000339037 838 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
KLHL33A6NCF5 FAM104B-202ENST00000358460 1179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
KLHL33A6NCF5 TEX30-203ENST00000376022 828 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
KLHL33A6NCF5 FKBP1B-201ENST00000380986 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
KLHL33A6NCF5 AL645937.2-201ENST00000396808 931 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
KLHL33A6NCF5 TEN1-201ENST00000397640 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
KLHL33A6NCF5 ITIH1-202ENST00000405128 1122 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
KLHL33A6NCF5 AC073133.1-201ENST00000426187 432 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
KLHL33A6NCF5 STMN1-204ENST00000426559 948 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
KLHL33A6NCF5 AC114730.3-201ENST00000435195 584 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
KLHL33A6NCF5 RN7SL692P-201ENST00000464677 288 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
KLHL33A6NCF5 ARHGEF26-AS1-201ENST00000467912 628 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
KLHL33A6NCF5 SELENOT-203ENST00000477889 944 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
KLHL33A6NCF5 TIMM8B-201ENST00000504148 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
KLHL33A6NCF5 AC005225.4-201ENST00000557330 545 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
KLHL33A6NCF5 AL596325.1-201ENST00000563991 1082 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
KLHL33A6NCF5 AC015819.2-201ENST00000618730 555 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
KLHL33A6NCF5 FGD2-201ENST00000274963 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
KLHL33A6NCF5 NR1H3-221ENST00000481889 1704 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
KLHL33A6NCF5 TMBIM7P-203ENST00000641617 1718 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
KLHL33A6NCF5 SPTSSB-201ENST00000359175 3103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
KLHL33A6NCF5 NRSN2-210ENST00000621012 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
KLHL33A6NCF5 RGS9-210ENST00000635833 2308 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
KLHL33A6NCF5 TLE4-204ENST00000376537 2793 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
KLHL33A6NCF5 BICDL1-201ENST00000397558 3055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
KLHL33A6NCF5 CHL1-202ENST00000397491 5235 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
KLHL33A6NCF5 STYXL1-203ENST00000359697 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
KLHL33A6NCF5 C21orf33-201ENST00000291577 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
KLHL33A6NCF5 RHNO1-202ENST00000461997 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
KLHL33A6NCF5 SELPLG-203ENST00000550948 2256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
KLHL33A6NCF5 AL928654.2-201ENST00000551271 2279 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
KLHL33A6NCF5 TFIP11-201ENST00000405938 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
KLHL33A6NCF5 CRCP-203ENST00000395326 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
KLHL33A6NCF5 MSH2-201ENST00000233146 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
KLHL33A6NCF5 ARRB1-202ENST00000420843 3336 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
KLHL33A6NCF5 ZNF354B-201ENST00000322434 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
KLHL33A6NCF5 OSBPL7-211ENST00000613735 2836 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
KLHL33A6NCF5 HSD17B4-201ENST00000256216 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
KLHL33A6NCF5 DCST2-202ENST00000368424 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
KLHL33A6NCF5 GP6-202ENST00000333884 2210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
KLHL33A6NCF5 SGK2-206ENST00000423407 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
KLHL33A6NCF5 ROPN1-203ENST00000459660 1909 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
KLHL33A6NCF5 IL25-201ENST00000329715 1315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
KLHL33A6NCF5 SNHG20-204ENST00000566583 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
KLHL33A6NCF5 DDX56-201ENST00000258772 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
KLHL33A6NCF5 M6PR-202ENST00000536844 2305 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
KLHL33A6NCF5 AP001972.5-201ENST00000624624 2338 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
KLHL33A6NCF5 FBXO34-201ENST00000313833 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
KLHL33A6NCF5 SPATA21-201ENST00000335496 2015 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
KLHL33A6NCF5 KIAA2026-202ENST00000399933 6988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
KLHL33A6NCF5 RTEL1-205ENST00000370018 4955 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
KLHL33A6NCF5 NDUFB7-201ENST00000215565 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
KLHL33A6NCF5 PGBD2-201ENST00000329291 2136 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
KLHL33A6NCF5 LCK-206ENST00000373564 2137 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
KLHL33A6NCF5 GRAP-202ENST00000395635 834 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
KLHL33A6NCF5 PDE1C-205ENST00000396191 2952 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
KLHL33A6NCF5 DGCR5-201ENST00000399539 862 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
KLHL33A6NCF5 C1QBPP1-201ENST00000400117 770 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
KLHL33A6NCF5 RPUSD3-204ENST00000424438 1005 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
KLHL33A6NCF5 LINC01784-201ENST00000438401 378 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
KLHL33A6NCF5 AC140481.1-201ENST00000448777 706 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
KLHL33A6NCF5 AC078785.1-203ENST00000467342 573 ntTSL 4 BASIC15.21■□□□□ 0.03
KLHL33A6NCF5 AC106886.2-201ENST00000483578 883 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
KLHL33A6NCF5 AC026774.1-201ENST00000503652 691 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
KLHL33A6NCF5 SERF1A-205ENST00000507348 663 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
KLHL33A6NCF5 AC006064.3-201ENST00000537921 477 ntTSL 4 BASIC15.21■□□□□ 0.03
KLHL33A6NCF5 ETV4-203ENST00000538265 2147 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
KLHL33A6NCF5 LINC01089-209ENST00000542933 1220 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
KLHL33A6NCF5 RPL36-203ENST00000577222 874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
KLHL33A6NCF5 AC111170.2-201ENST00000585369 768 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
KLHL33A6NCF5 CKMT1A-208ENST00000626814 1073 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
KLHL33A6NCF5 OTP-201ENST00000306422 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
KLHL33A6NCF5 TJAP1-204ENST00000372449 2695 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
KLHL33A6NCF5 TJAP1-205ENST00000372452 2665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
KLHL33A6NCF5 ANO9-201ENST00000332826 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
KLHL33A6NCF5 BET1L-201ENST00000325147 2916 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
KLHL33A6NCF5 PTPN11-201ENST00000351677 6101 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
KLHL33A6NCF5 PRLHR-201ENST00000239032 5446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
KLHL33A6NCF5 GAS2L3-201ENST00000266754 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
KLHL33A6NCF5 EGLN1-201ENST00000366641 7097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
KLHL33A6NCF5 SLC35F2-204ENST00000525815 3170 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
KLHL33A6NCF5 CALR-201ENST00000316448 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
KLHL33A6NCF5 CTSB-219ENST00000530640 1389 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
KLHL33A6NCF5 AC090616.6-203ENST00000579186 1945 ntBASIC15.21■□□□□ 0.02
KLHL33A6NCF5 BEAN1-201ENST00000299694 2160 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
KLHL33A6NCF5 HARS-205ENST00000457527 1896 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
KLHL33A6NCF5 CELF2-206ENST00000608830 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
KLHL33A6NCF5 HEY1-201ENST00000337919 2296 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
KLHL33A6NCF5 GRIN2C-201ENST00000293190 4261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
KLHL33A6NCF5 DCUN1D4-203ENST00000451288 4269 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
KLHL33A6NCF5 MBD1-224ENST00000591416 4905 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
KLHL33A6NCF5 TOR4A-201ENST00000357503 4148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
KLHL33A6NCF5 B3GNT4-202ENST00000535274 2938 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
KLHL33A6NCF5 STRA6-203ENST00000416286 2750 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
KLHL33A6NCF5 TTBK1-201ENST00000259750 6932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
KLHL33A6NCF5 GGT5-202ENST00000327365 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
KLHL33A6NCF5 KRT8P22-201ENST00000562317 1415 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.1 ms