Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6R4

MAP3K4, Mitogen-activated protein kinase kinase kinase 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,608 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MAP3K4Q9Y6R4 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC35.82■■■■□ 3.32
MAP3K4Q9Y6R4 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC35.82■■■■□ 3.32
MAP3K4Q9Y6R4 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC35.81■■■■□ 3.32
MAP3K4Q9Y6R4 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.81■■■■□ 3.32
MAP3K4Q9Y6R4 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.81■■■■□ 3.32
MAP3K4Q9Y6R4 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC35.81■■■■□ 3.32
MAP3K4Q9Y6R4 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC35.81■■■■□ 3.32
MAP3K4Q9Y6R4 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC35.81■■■■□ 3.32
MAP3K4Q9Y6R4 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC35.81■■■■□ 3.32
MAP3K4Q9Y6R4 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.81■■■■□ 3.32
MAP3K4Q9Y6R4 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.8■■■■□ 3.32
MAP3K4Q9Y6R4 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC35.8■■■■□ 3.32
MAP3K4Q9Y6R4 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC35.8■■■■□ 3.32
MAP3K4Q9Y6R4 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC35.8■■■■□ 3.32
MAP3K4Q9Y6R4 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC35.8■■■■□ 3.32
MAP3K4Q9Y6R4 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.79■■■■□ 3.32
MAP3K4Q9Y6R4 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.79■■■■□ 3.32
MAP3K4Q9Y6R4 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC35.79■■■■□ 3.32
MAP3K4Q9Y6R4 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.79■■■■□ 3.32
MAP3K4Q9Y6R4 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC35.79■■■■□ 3.32
MAP3K4Q9Y6R4 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC35.79■■■■□ 3.32
MAP3K4Q9Y6R4 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.78■■■■□ 3.32
MAP3K4Q9Y6R4 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC35.78■■■■□ 3.32
MAP3K4Q9Y6R4 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC35.77■■■■□ 3.32
MAP3K4Q9Y6R4 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC35.77■■■■□ 3.32
MAP3K4Q9Y6R4 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC35.77■■■■□ 3.32
MAP3K4Q9Y6R4 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.76■■■■□ 3.32
MAP3K4Q9Y6R4 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC35.76■■■■□ 3.32
MAP3K4Q9Y6R4 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC35.76■■■■□ 3.32
MAP3K4Q9Y6R4 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.76■■■■□ 3.31
MAP3K4Q9Y6R4 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.75■■■■□ 3.31
MAP3K4Q9Y6R4 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC35.75■■■■□ 3.31
MAP3K4Q9Y6R4 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC35.75■■■■□ 3.31
MAP3K4Q9Y6R4 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.75■■■■□ 3.31
MAP3K4Q9Y6R4 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC35.75■■■■□ 3.31
MAP3K4Q9Y6R4 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC35.75■■■■□ 3.31
MAP3K4Q9Y6R4 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.74■■■■□ 3.31
MAP3K4Q9Y6R4 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC35.74■■■■□ 3.31
MAP3K4Q9Y6R4 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.74■■■■□ 3.31
MAP3K4Q9Y6R4 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.74■■■■□ 3.31
MAP3K4Q9Y6R4 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.74■■■■□ 3.31
MAP3K4Q9Y6R4 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.74■■■■□ 3.31
MAP3K4Q9Y6R4 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC35.74■■■■□ 3.31
MAP3K4Q9Y6R4 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.74■■■■□ 3.31
MAP3K4Q9Y6R4 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.73■■■■□ 3.31
MAP3K4Q9Y6R4 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.73■■■■□ 3.31
MAP3K4Q9Y6R4 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.73■■■■□ 3.31
MAP3K4Q9Y6R4 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.73■■■■□ 3.31
MAP3K4Q9Y6R4 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC35.73■■■■□ 3.31
MAP3K4Q9Y6R4 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC35.73■■■■□ 3.31
MAP3K4Q9Y6R4 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC35.73■■■■□ 3.31
MAP3K4Q9Y6R4 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC35.73■■■■□ 3.31
MAP3K4Q9Y6R4 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC35.73■■■■□ 3.31
MAP3K4Q9Y6R4 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC35.73■■■■□ 3.31
MAP3K4Q9Y6R4 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC35.72■■■■□ 3.31
MAP3K4Q9Y6R4 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC35.72■■■■□ 3.31
MAP3K4Q9Y6R4 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.72■■■■□ 3.31
MAP3K4Q9Y6R4 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.72■■■■□ 3.31
MAP3K4Q9Y6R4 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC35.71■■■■□ 3.31
MAP3K4Q9Y6R4 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC35.71■■■■□ 3.31
MAP3K4Q9Y6R4 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC35.71■■■■□ 3.31
MAP3K4Q9Y6R4 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC35.71■■■■□ 3.31
MAP3K4Q9Y6R4 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC35.71■■■■□ 3.31
MAP3K4Q9Y6R4 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC35.71■■■■□ 3.31
MAP3K4Q9Y6R4 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC35.71■■■■□ 3.31
MAP3K4Q9Y6R4 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC35.71■■■■□ 3.31
MAP3K4Q9Y6R4 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC35.7■■■■□ 3.31
MAP3K4Q9Y6R4 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC35.7■■■■□ 3.31
MAP3K4Q9Y6R4 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC35.7■■■■□ 3.31
MAP3K4Q9Y6R4 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.7■■■■□ 3.31
MAP3K4Q9Y6R4 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.7■■■■□ 3.3
MAP3K4Q9Y6R4 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.69■■■■□ 3.3
MAP3K4Q9Y6R4 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC35.69■■■■□ 3.3
MAP3K4Q9Y6R4 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC35.69■■■■□ 3.3
MAP3K4Q9Y6R4 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC35.69■■■■□ 3.3
MAP3K4Q9Y6R4 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.69■■■■□ 3.3
MAP3K4Q9Y6R4 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC35.68■■■■□ 3.3
MAP3K4Q9Y6R4 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.68■■■■□ 3.3
MAP3K4Q9Y6R4 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.68■■■■□ 3.3
MAP3K4Q9Y6R4 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.68■■■■□ 3.3
MAP3K4Q9Y6R4 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC35.68■■■■□ 3.3
MAP3K4Q9Y6R4 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.67■■■■□ 3.3
MAP3K4Q9Y6R4 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.67■■■■□ 3.3
MAP3K4Q9Y6R4 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.67■■■■□ 3.3
MAP3K4Q9Y6R4 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC35.67■■■■□ 3.3
MAP3K4Q9Y6R4 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC35.67■■■■□ 3.3
MAP3K4Q9Y6R4 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.67■■■■□ 3.3
MAP3K4Q9Y6R4 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC35.66■■■■□ 3.3
MAP3K4Q9Y6R4 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC35.66■■■■□ 3.3
MAP3K4Q9Y6R4 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC35.66■■■■□ 3.3
MAP3K4Q9Y6R4 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.66■■■■□ 3.3
MAP3K4Q9Y6R4 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC35.66■■■■□ 3.3
MAP3K4Q9Y6R4 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC35.65■■■■□ 3.3
MAP3K4Q9Y6R4 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC35.65■■■■□ 3.3
MAP3K4Q9Y6R4 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC35.65■■■■□ 3.3
MAP3K4Q9Y6R4 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.65■■■■□ 3.3
MAP3K4Q9Y6R4 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC35.65■■■■□ 3.3
MAP3K4Q9Y6R4 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC35.65■■■■□ 3.3
MAP3K4Q9Y6R4 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC35.65■■■■□ 3.3
MAP3K4Q9Y6R4 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.64■■■■□ 3.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.1 ms