Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6N6

LAMC3, Laminin subunit gamma-3, humanhuman

Predictions only

Length 1,575 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMC3Q9Y6N6 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC40.44■■■■■ 4.06
LAMC3Q9Y6N6 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC40.43■■■■■ 4.06
LAMC3Q9Y6N6 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC40.42■■■■■ 4.06
LAMC3Q9Y6N6 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.42■■■■■ 4.06
LAMC3Q9Y6N6 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC40.42■■■■■ 4.06
LAMC3Q9Y6N6 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC40.42■■■■■ 4.06
LAMC3Q9Y6N6 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC40.42■■■■■ 4.06
LAMC3Q9Y6N6 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC40.42■■■■■ 4.06
LAMC3Q9Y6N6 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.42■■■■■ 4.06
LAMC3Q9Y6N6 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC40.42■■■■■ 4.06
LAMC3Q9Y6N6 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC40.42■■■■■ 4.06
LAMC3Q9Y6N6 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC40.42■■■■■ 4.06
LAMC3Q9Y6N6 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC40.41■■■■■ 4.06
LAMC3Q9Y6N6 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC40.41■■■■■ 4.06
LAMC3Q9Y6N6 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC40.41■■■■■ 4.06
LAMC3Q9Y6N6 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.41■■■■■ 4.06
LAMC3Q9Y6N6 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC40.4■■■■■ 4.06
LAMC3Q9Y6N6 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC40.4■■■■■ 4.06
LAMC3Q9Y6N6 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC40.4■■■■■ 4.06
LAMC3Q9Y6N6 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC40.4■■■■■ 4.06
LAMC3Q9Y6N6 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.39■■■■■ 4.06
LAMC3Q9Y6N6 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC40.38■■■■■ 4.05
LAMC3Q9Y6N6 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC40.38■■■■■ 4.05
LAMC3Q9Y6N6 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC40.38■■■■■ 4.05
LAMC3Q9Y6N6 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.37■■■■■ 4.05
LAMC3Q9Y6N6 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC40.37■■■■■ 4.05
LAMC3Q9Y6N6 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC40.37■■■■■ 4.05
LAMC3Q9Y6N6 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.37■■■■■ 4.05
LAMC3Q9Y6N6 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.37■■■■■ 4.05
LAMC3Q9Y6N6 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC40.37■■■■■ 4.05
LAMC3Q9Y6N6 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC40.36■■■■■ 4.05
LAMC3Q9Y6N6 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40.36■■■■■ 4.05
LAMC3Q9Y6N6 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC40.35■■■■■ 4.05
LAMC3Q9Y6N6 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC40.35■■■■■ 4.05
LAMC3Q9Y6N6 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC40.35■■■■■ 4.05
LAMC3Q9Y6N6 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.35■■■■■ 4.05
LAMC3Q9Y6N6 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.35■■■■■ 4.05
LAMC3Q9Y6N6 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC40.34■■■■■ 4.05
LAMC3Q9Y6N6 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC40.34■■■■■ 4.05
LAMC3Q9Y6N6 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC40.34■■■■■ 4.05
LAMC3Q9Y6N6 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC40.34■■■■■ 4.05
LAMC3Q9Y6N6 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.33■■■■■ 4.05
LAMC3Q9Y6N6 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC40.33■■■■■ 4.05
LAMC3Q9Y6N6 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC40.33■■■■■ 4.05
LAMC3Q9Y6N6 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC40.33■■■■■ 4.05
LAMC3Q9Y6N6 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC40.32■■■■■ 4.05
LAMC3Q9Y6N6 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.32■■■■■ 4.05
LAMC3Q9Y6N6 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.32■■■■■ 4.05
LAMC3Q9Y6N6 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC40.32■■■■■ 4.05
LAMC3Q9Y6N6 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC40.32■■■■■ 4.05
LAMC3Q9Y6N6 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.32■■■■■ 4.05
LAMC3Q9Y6N6 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC40.32■■■■■ 4.05
LAMC3Q9Y6N6 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC40.32■■■■■ 4.05
LAMC3Q9Y6N6 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.32■■■■■ 4.04
LAMC3Q9Y6N6 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC40.31■■■■■ 4.04
LAMC3Q9Y6N6 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.31■■■■■ 4.04
LAMC3Q9Y6N6 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC40.31■■■■■ 4.04
LAMC3Q9Y6N6 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.31■■■■■ 4.04
LAMC3Q9Y6N6 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.31■■■■■ 4.04
LAMC3Q9Y6N6 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.31■■■■■ 4.04
LAMC3Q9Y6N6 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC40.31■■■■■ 4.04
LAMC3Q9Y6N6 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC40.31■■■■■ 4.04
LAMC3Q9Y6N6 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC40.31■■■■■ 4.04
LAMC3Q9Y6N6 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC40.3■■■■■ 4.04
LAMC3Q9Y6N6 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.3■■■■■ 4.04
LAMC3Q9Y6N6 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC40.29■■■■■ 4.04
LAMC3Q9Y6N6 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC40.29■■■■■ 4.04
LAMC3Q9Y6N6 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC40.29■■■■■ 4.04
LAMC3Q9Y6N6 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.28■■■■■ 4.04
LAMC3Q9Y6N6 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC40.28■■■■■ 4.04
LAMC3Q9Y6N6 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC40.28■■■■■ 4.04
LAMC3Q9Y6N6 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC40.27■■■■■ 4.04
LAMC3Q9Y6N6 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC40.27■■■■■ 4.04
LAMC3Q9Y6N6 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.27■■■■■ 4.04
LAMC3Q9Y6N6 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC40.27■■■■■ 4.04
LAMC3Q9Y6N6 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC40.27■■■■■ 4.04
LAMC3Q9Y6N6 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC40.27■■■■■ 4.04
LAMC3Q9Y6N6 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC40.26■■■■■ 4.04
LAMC3Q9Y6N6 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC40.25■■■■■ 4.03
LAMC3Q9Y6N6 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC40.25■■■■■ 4.03
LAMC3Q9Y6N6 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC40.24■■■■■ 4.03
LAMC3Q9Y6N6 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC40.24■■■■■ 4.03
LAMC3Q9Y6N6 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.24■■■■■ 4.03
LAMC3Q9Y6N6 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC40.24■■■■■ 4.03
LAMC3Q9Y6N6 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC40.23■■■■■ 4.03
LAMC3Q9Y6N6 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC40.23■■■■■ 4.03
LAMC3Q9Y6N6 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC40.23■■■■■ 4.03
LAMC3Q9Y6N6 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC40.23■■■■■ 4.03
LAMC3Q9Y6N6 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC40.23■■■■■ 4.03
LAMC3Q9Y6N6 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.23■■■■■ 4.03
LAMC3Q9Y6N6 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.23■■■■■ 4.03
LAMC3Q9Y6N6 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC40.23■■■■■ 4.03
LAMC3Q9Y6N6 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC40.23■■■■■ 4.03
LAMC3Q9Y6N6 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.22■■■■■ 4.03
LAMC3Q9Y6N6 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.22■■■■■ 4.03
LAMC3Q9Y6N6 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC40.22■■■■■ 4.03
LAMC3Q9Y6N6 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.21■■■■■ 4.03
LAMC3Q9Y6N6 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC40.21■■■■■ 4.03
LAMC3Q9Y6N6 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.21■■■■■ 4.03
LAMC3Q9Y6N6 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC40.21■■■■■ 4.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.8 ms