Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5F1

PCDHB12, Protocadherin beta-12, humanhuman

Predictions only

Length 795 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCDHB12Q9Y5F1 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
PCDHB12Q9Y5F1 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PCDHB12Q9Y5F1 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
PCDHB12Q9Y5F1 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PCDHB12Q9Y5F1 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
PCDHB12Q9Y5F1 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PCDHB12Q9Y5F1 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
PCDHB12Q9Y5F1 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
PCDHB12Q9Y5F1 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
PCDHB12Q9Y5F1 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
PCDHB12Q9Y5F1 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC24.81■■□□□ 1.56
PCDHB12Q9Y5F1 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
PCDHB12Q9Y5F1 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
PCDHB12Q9Y5F1 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PCDHB12Q9Y5F1 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PCDHB12Q9Y5F1 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PCDHB12Q9Y5F1 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
PCDHB12Q9Y5F1 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PCDHB12Q9Y5F1 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PCDHB12Q9Y5F1 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
PCDHB12Q9Y5F1 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
PCDHB12Q9Y5F1 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PCDHB12Q9Y5F1 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PCDHB12Q9Y5F1 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PCDHB12Q9Y5F1 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
PCDHB12Q9Y5F1 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC24.8■■□□□ 1.56
PCDHB12Q9Y5F1 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
PCDHB12Q9Y5F1 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PCDHB12Q9Y5F1 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PCDHB12Q9Y5F1 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
PCDHB12Q9Y5F1 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
PCDHB12Q9Y5F1 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PCDHB12Q9Y5F1 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PCDHB12Q9Y5F1 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PCDHB12Q9Y5F1 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
PCDHB12Q9Y5F1 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PCDHB12Q9Y5F1 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PCDHB12Q9Y5F1 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PCDHB12Q9Y5F1 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PCDHB12Q9Y5F1 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
PCDHB12Q9Y5F1 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
PCDHB12Q9Y5F1 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PCDHB12Q9Y5F1 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
PCDHB12Q9Y5F1 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PCDHB12Q9Y5F1 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC24.77■■□□□ 1.56
PCDHB12Q9Y5F1 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
PCDHB12Q9Y5F1 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PCDHB12Q9Y5F1 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PCDHB12Q9Y5F1 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PCDHB12Q9Y5F1 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PCDHB12Q9Y5F1 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PCDHB12Q9Y5F1 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
PCDHB12Q9Y5F1 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
PCDHB12Q9Y5F1 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PCDHB12Q9Y5F1 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PCDHB12Q9Y5F1 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
PCDHB12Q9Y5F1 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
PCDHB12Q9Y5F1 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
PCDHB12Q9Y5F1 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
PCDHB12Q9Y5F1 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
PCDHB12Q9Y5F1 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
PCDHB12Q9Y5F1 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PCDHB12Q9Y5F1 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
PCDHB12Q9Y5F1 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
PCDHB12Q9Y5F1 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
PCDHB12Q9Y5F1 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
PCDHB12Q9Y5F1 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PCDHB12Q9Y5F1 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
PCDHB12Q9Y5F1 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PCDHB12Q9Y5F1 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
PCDHB12Q9Y5F1 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
PCDHB12Q9Y5F1 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
PCDHB12Q9Y5F1 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PCDHB12Q9Y5F1 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PCDHB12Q9Y5F1 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PCDHB12Q9Y5F1 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PCDHB12Q9Y5F1 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PCDHB12Q9Y5F1 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PCDHB12Q9Y5F1 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PCDHB12Q9Y5F1 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PCDHB12Q9Y5F1 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
PCDHB12Q9Y5F1 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
PCDHB12Q9Y5F1 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PCDHB12Q9Y5F1 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
PCDHB12Q9Y5F1 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
PCDHB12Q9Y5F1 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PCDHB12Q9Y5F1 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PCDHB12Q9Y5F1 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
PCDHB12Q9Y5F1 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
PCDHB12Q9Y5F1 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
PCDHB12Q9Y5F1 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
PCDHB12Q9Y5F1 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
PCDHB12Q9Y5F1 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
PCDHB12Q9Y5F1 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
PCDHB12Q9Y5F1 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
PCDHB12Q9Y5F1 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PCDHB12Q9Y5F1 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
PCDHB12Q9Y5F1 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
PCDHB12Q9Y5F1 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
PCDHB12Q9Y5F1 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.8 ms