Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3E1

HDGFL3, Hepatoma-derived growth factor-related protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 203 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDGFL3Q9Y3E1 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
HDGFL3Q9Y3E1 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
HDGFL3Q9Y3E1 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
HDGFL3Q9Y3E1 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
HDGFL3Q9Y3E1 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
HDGFL3Q9Y3E1 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
HDGFL3Q9Y3E1 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
HDGFL3Q9Y3E1 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC20.67■□□□□ 0.9
HDGFL3Q9Y3E1 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC20.67■□□□□ 0.9
HDGFL3Q9Y3E1 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
HDGFL3Q9Y3E1 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
HDGFL3Q9Y3E1 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
HDGFL3Q9Y3E1 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
HDGFL3Q9Y3E1 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
HDGFL3Q9Y3E1 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC20.66■□□□□ 0.9
HDGFL3Q9Y3E1 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC20.66■□□□□ 0.9
HDGFL3Q9Y3E1 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
HDGFL3Q9Y3E1 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
HDGFL3Q9Y3E1 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
HDGFL3Q9Y3E1 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
HDGFL3Q9Y3E1 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
HDGFL3Q9Y3E1 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
HDGFL3Q9Y3E1 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
HDGFL3Q9Y3E1 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
HDGFL3Q9Y3E1 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
HDGFL3Q9Y3E1 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
HDGFL3Q9Y3E1 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
HDGFL3Q9Y3E1 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC20.65■□□□□ 0.9
HDGFL3Q9Y3E1 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
HDGFL3Q9Y3E1 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
HDGFL3Q9Y3E1 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.9
HDGFL3Q9Y3E1 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
HDGFL3Q9Y3E1 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.9
HDGFL3Q9Y3E1 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
HDGFL3Q9Y3E1 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
HDGFL3Q9Y3E1 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
HDGFL3Q9Y3E1 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
HDGFL3Q9Y3E1 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
HDGFL3Q9Y3E1 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
HDGFL3Q9Y3E1 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
HDGFL3Q9Y3E1 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
HDGFL3Q9Y3E1 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
HDGFL3Q9Y3E1 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
HDGFL3Q9Y3E1 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
HDGFL3Q9Y3E1 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
HDGFL3Q9Y3E1 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
HDGFL3Q9Y3E1 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
HDGFL3Q9Y3E1 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
HDGFL3Q9Y3E1 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
HDGFL3Q9Y3E1 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
HDGFL3Q9Y3E1 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
HDGFL3Q9Y3E1 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
HDGFL3Q9Y3E1 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
HDGFL3Q9Y3E1 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
HDGFL3Q9Y3E1 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
HDGFL3Q9Y3E1 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
HDGFL3Q9Y3E1 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
HDGFL3Q9Y3E1 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
HDGFL3Q9Y3E1 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
HDGFL3Q9Y3E1 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
HDGFL3Q9Y3E1 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
HDGFL3Q9Y3E1 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
HDGFL3Q9Y3E1 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
HDGFL3Q9Y3E1 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
HDGFL3Q9Y3E1 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
HDGFL3Q9Y3E1 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
HDGFL3Q9Y3E1 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
HDGFL3Q9Y3E1 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
HDGFL3Q9Y3E1 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
HDGFL3Q9Y3E1 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
HDGFL3Q9Y3E1 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
HDGFL3Q9Y3E1 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
HDGFL3Q9Y3E1 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
HDGFL3Q9Y3E1 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
HDGFL3Q9Y3E1 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
HDGFL3Q9Y3E1 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
HDGFL3Q9Y3E1 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
HDGFL3Q9Y3E1 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
HDGFL3Q9Y3E1 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC20.6■□□□□ 0.89
HDGFL3Q9Y3E1 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
HDGFL3Q9Y3E1 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
HDGFL3Q9Y3E1 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
HDGFL3Q9Y3E1 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
HDGFL3Q9Y3E1 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
HDGFL3Q9Y3E1 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
HDGFL3Q9Y3E1 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
HDGFL3Q9Y3E1 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
HDGFL3Q9Y3E1 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
HDGFL3Q9Y3E1 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
HDGFL3Q9Y3E1 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
HDGFL3Q9Y3E1 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
HDGFL3Q9Y3E1 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
HDGFL3Q9Y3E1 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
HDGFL3Q9Y3E1 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
HDGFL3Q9Y3E1 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
HDGFL3Q9Y3E1 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
HDGFL3Q9Y3E1 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
HDGFL3Q9Y3E1 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
HDGFL3Q9Y3E1 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
HDGFL3Q9Y3E1 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.6 ms