Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y366

IFT52, Intraflagellar transport protein 52 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFT52Q9Y366 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
IFT52Q9Y366 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
IFT52Q9Y366 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
IFT52Q9Y366 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
IFT52Q9Y366 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
IFT52Q9Y366 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
IFT52Q9Y366 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
IFT52Q9Y366 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
IFT52Q9Y366 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
IFT52Q9Y366 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
IFT52Q9Y366 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
IFT52Q9Y366 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
IFT52Q9Y366 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
IFT52Q9Y366 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
IFT52Q9Y366 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
IFT52Q9Y366 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
IFT52Q9Y366 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
IFT52Q9Y366 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
IFT52Q9Y366 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
IFT52Q9Y366 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
IFT52Q9Y366 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.02
IFT52Q9Y366 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
IFT52Q9Y366 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
IFT52Q9Y366 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
IFT52Q9Y366 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
IFT52Q9Y366 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
IFT52Q9Y366 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
IFT52Q9Y366 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
IFT52Q9Y366 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
IFT52Q9Y366 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
IFT52Q9Y366 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
IFT52Q9Y366 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
IFT52Q9Y366 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
IFT52Q9Y366 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
IFT52Q9Y366 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
IFT52Q9Y366 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
IFT52Q9Y366 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
IFT52Q9Y366 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
IFT52Q9Y366 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
IFT52Q9Y366 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
IFT52Q9Y366 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
IFT52Q9Y366 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
IFT52Q9Y366 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
IFT52Q9Y366 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
IFT52Q9Y366 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
IFT52Q9Y366 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
IFT52Q9Y366 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
IFT52Q9Y366 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
IFT52Q9Y366 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
IFT52Q9Y366 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
IFT52Q9Y366 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
IFT52Q9Y366 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
IFT52Q9Y366 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
IFT52Q9Y366 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
IFT52Q9Y366 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
IFT52Q9Y366 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
IFT52Q9Y366 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
IFT52Q9Y366 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
IFT52Q9Y366 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
IFT52Q9Y366 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
IFT52Q9Y366 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
IFT52Q9Y366 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
IFT52Q9Y366 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
IFT52Q9Y366 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
IFT52Q9Y366 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
IFT52Q9Y366 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
IFT52Q9Y366 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
IFT52Q9Y366 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
IFT52Q9Y366 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
IFT52Q9Y366 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
IFT52Q9Y366 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
IFT52Q9Y366 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
IFT52Q9Y366 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
IFT52Q9Y366 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
IFT52Q9Y366 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
IFT52Q9Y366 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
IFT52Q9Y366 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
IFT52Q9Y366 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
IFT52Q9Y366 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
IFT52Q9Y366 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
IFT52Q9Y366 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
IFT52Q9Y366 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
IFT52Q9Y366 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC21.33■■□□□ 1
IFT52Q9Y366 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
IFT52Q9Y366 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
IFT52Q9Y366 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
IFT52Q9Y366 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
IFT52Q9Y366 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
IFT52Q9Y366 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
IFT52Q9Y366 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
IFT52Q9Y366 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
IFT52Q9Y366 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
IFT52Q9Y366 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
IFT52Q9Y366 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
IFT52Q9Y366 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
IFT52Q9Y366 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC21.32■■□□□ 1
IFT52Q9Y366 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
IFT52Q9Y366 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
IFT52Q9Y366 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
IFT52Q9Y366 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.4 ms