Protein–RNA interactions for Protein: Q9UQE7

SMC3, Structural maintenance of chromosomes protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,217 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMC3Q9UQE7 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
SMC3Q9UQE7 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
SMC3Q9UQE7 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
SMC3Q9UQE7 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
SMC3Q9UQE7 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
SMC3Q9UQE7 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
SMC3Q9UQE7 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
SMC3Q9UQE7 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
SMC3Q9UQE7 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
SMC3Q9UQE7 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
SMC3Q9UQE7 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
SMC3Q9UQE7 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
SMC3Q9UQE7 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
SMC3Q9UQE7 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
SMC3Q9UQE7 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
SMC3Q9UQE7 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
SMC3Q9UQE7 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
SMC3Q9UQE7 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
SMC3Q9UQE7 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
SMC3Q9UQE7 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
SMC3Q9UQE7 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC26.92■■□□□ 1.9
SMC3Q9UQE7 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
SMC3Q9UQE7 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
SMC3Q9UQE7 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
SMC3Q9UQE7 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
SMC3Q9UQE7 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
SMC3Q9UQE7 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
SMC3Q9UQE7 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
SMC3Q9UQE7 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
SMC3Q9UQE7 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
SMC3Q9UQE7 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
SMC3Q9UQE7 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
SMC3Q9UQE7 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
SMC3Q9UQE7 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
SMC3Q9UQE7 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
SMC3Q9UQE7 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
SMC3Q9UQE7 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
SMC3Q9UQE7 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
SMC3Q9UQE7 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC26.9■■□□□ 1.9
SMC3Q9UQE7 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
SMC3Q9UQE7 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
SMC3Q9UQE7 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
SMC3Q9UQE7 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
SMC3Q9UQE7 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
SMC3Q9UQE7 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
SMC3Q9UQE7 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
SMC3Q9UQE7 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
SMC3Q9UQE7 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
SMC3Q9UQE7 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC26.89■■□□□ 1.9
SMC3Q9UQE7 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
SMC3Q9UQE7 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
SMC3Q9UQE7 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC26.89■■□□□ 1.9
SMC3Q9UQE7 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
SMC3Q9UQE7 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
SMC3Q9UQE7 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
SMC3Q9UQE7 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
SMC3Q9UQE7 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
SMC3Q9UQE7 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
SMC3Q9UQE7 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
SMC3Q9UQE7 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC26.88■■□□□ 1.89
SMC3Q9UQE7 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
SMC3Q9UQE7 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
SMC3Q9UQE7 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
SMC3Q9UQE7 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
SMC3Q9UQE7 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
SMC3Q9UQE7 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
SMC3Q9UQE7 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC26.88■■□□□ 1.89
SMC3Q9UQE7 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
SMC3Q9UQE7 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
SMC3Q9UQE7 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
SMC3Q9UQE7 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
SMC3Q9UQE7 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
SMC3Q9UQE7 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
SMC3Q9UQE7 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
SMC3Q9UQE7 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
SMC3Q9UQE7 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
SMC3Q9UQE7 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
SMC3Q9UQE7 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
SMC3Q9UQE7 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
SMC3Q9UQE7 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
SMC3Q9UQE7 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
SMC3Q9UQE7 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
SMC3Q9UQE7 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
SMC3Q9UQE7 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
SMC3Q9UQE7 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
SMC3Q9UQE7 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
SMC3Q9UQE7 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC26.85■■□□□ 1.89
SMC3Q9UQE7 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
SMC3Q9UQE7 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
SMC3Q9UQE7 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
SMC3Q9UQE7 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
SMC3Q9UQE7 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
SMC3Q9UQE7 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
SMC3Q9UQE7 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
SMC3Q9UQE7 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
SMC3Q9UQE7 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
SMC3Q9UQE7 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
SMC3Q9UQE7 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
SMC3Q9UQE7 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
SMC3Q9UQE7 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.3 ms