Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPR3

SMG5, Protein SMG5, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,016 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMG5Q9UPR3 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SMG5Q9UPR3 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SMG5Q9UPR3 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SMG5Q9UPR3 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SMG5Q9UPR3 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SMG5Q9UPR3 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SMG5Q9UPR3 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
SMG5Q9UPR3 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SMG5Q9UPR3 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SMG5Q9UPR3 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SMG5Q9UPR3 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SMG5Q9UPR3 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SMG5Q9UPR3 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
SMG5Q9UPR3 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SMG5Q9UPR3 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SMG5Q9UPR3 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SMG5Q9UPR3 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SMG5Q9UPR3 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SMG5Q9UPR3 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SMG5Q9UPR3 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SMG5Q9UPR3 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SMG5Q9UPR3 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SMG5Q9UPR3 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
SMG5Q9UPR3 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SMG5Q9UPR3 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SMG5Q9UPR3 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SMG5Q9UPR3 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SMG5Q9UPR3 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
SMG5Q9UPR3 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
SMG5Q9UPR3 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SMG5Q9UPR3 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SMG5Q9UPR3 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SMG5Q9UPR3 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SMG5Q9UPR3 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SMG5Q9UPR3 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SMG5Q9UPR3 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SMG5Q9UPR3 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SMG5Q9UPR3 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SMG5Q9UPR3 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SMG5Q9UPR3 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SMG5Q9UPR3 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SMG5Q9UPR3 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SMG5Q9UPR3 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SMG5Q9UPR3 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SMG5Q9UPR3 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SMG5Q9UPR3 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SMG5Q9UPR3 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SMG5Q9UPR3 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC24■■□□□ 1.43
SMG5Q9UPR3 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SMG5Q9UPR3 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
SMG5Q9UPR3 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SMG5Q9UPR3 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SMG5Q9UPR3 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SMG5Q9UPR3 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
SMG5Q9UPR3 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SMG5Q9UPR3 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SMG5Q9UPR3 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SMG5Q9UPR3 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SMG5Q9UPR3 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SMG5Q9UPR3 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SMG5Q9UPR3 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SMG5Q9UPR3 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SMG5Q9UPR3 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SMG5Q9UPR3 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SMG5Q9UPR3 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
SMG5Q9UPR3 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SMG5Q9UPR3 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SMG5Q9UPR3 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SMG5Q9UPR3 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SMG5Q9UPR3 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SMG5Q9UPR3 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SMG5Q9UPR3 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SMG5Q9UPR3 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SMG5Q9UPR3 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SMG5Q9UPR3 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SMG5Q9UPR3 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SMG5Q9UPR3 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SMG5Q9UPR3 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SMG5Q9UPR3 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SMG5Q9UPR3 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SMG5Q9UPR3 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SMG5Q9UPR3 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SMG5Q9UPR3 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SMG5Q9UPR3 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SMG5Q9UPR3 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SMG5Q9UPR3 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SMG5Q9UPR3 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SMG5Q9UPR3 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SMG5Q9UPR3 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
SMG5Q9UPR3 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
SMG5Q9UPR3 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
SMG5Q9UPR3 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SMG5Q9UPR3 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SMG5Q9UPR3 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.43
SMG5Q9UPR3 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
SMG5Q9UPR3 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
SMG5Q9UPR3 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SMG5Q9UPR3 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
SMG5Q9UPR3 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
SMG5Q9UPR3 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.3 ms