Protein–RNA interactions for Protein: Q9UP95

SLC12A4, Solute carrier family 12 member 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,085 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC12A4Q9UP95 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SLC12A4Q9UP95 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SLC12A4Q9UP95 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SLC12A4Q9UP95 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SLC12A4Q9UP95 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SLC12A4Q9UP95 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SLC12A4Q9UP95 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SLC12A4Q9UP95 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SLC12A4Q9UP95 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SLC12A4Q9UP95 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SLC12A4Q9UP95 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SLC12A4Q9UP95 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SLC12A4Q9UP95 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SLC12A4Q9UP95 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SLC12A4Q9UP95 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SLC12A4Q9UP95 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SLC12A4Q9UP95 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SLC12A4Q9UP95 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SLC12A4Q9UP95 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SLC12A4Q9UP95 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SLC12A4Q9UP95 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SLC12A4Q9UP95 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
SLC12A4Q9UP95 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SLC12A4Q9UP95 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SLC12A4Q9UP95 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SLC12A4Q9UP95 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SLC12A4Q9UP95 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SLC12A4Q9UP95 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
SLC12A4Q9UP95 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SLC12A4Q9UP95 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SLC12A4Q9UP95 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SLC12A4Q9UP95 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SLC12A4Q9UP95 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SLC12A4Q9UP95 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SLC12A4Q9UP95 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SLC12A4Q9UP95 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SLC12A4Q9UP95 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SLC12A4Q9UP95 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SLC12A4Q9UP95 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SLC12A4Q9UP95 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SLC12A4Q9UP95 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SLC12A4Q9UP95 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SLC12A4Q9UP95 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SLC12A4Q9UP95 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SLC12A4Q9UP95 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
SLC12A4Q9UP95 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
SLC12A4Q9UP95 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
SLC12A4Q9UP95 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
SLC12A4Q9UP95 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
SLC12A4Q9UP95 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SLC12A4Q9UP95 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SLC12A4Q9UP95 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SLC12A4Q9UP95 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SLC12A4Q9UP95 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SLC12A4Q9UP95 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SLC12A4Q9UP95 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SLC12A4Q9UP95 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SLC12A4Q9UP95 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SLC12A4Q9UP95 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SLC12A4Q9UP95 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SLC12A4Q9UP95 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SLC12A4Q9UP95 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SLC12A4Q9UP95 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SLC12A4Q9UP95 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SLC12A4Q9UP95 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SLC12A4Q9UP95 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SLC12A4Q9UP95 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SLC12A4Q9UP95 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SLC12A4Q9UP95 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SLC12A4Q9UP95 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SLC12A4Q9UP95 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SLC12A4Q9UP95 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SLC12A4Q9UP95 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SLC12A4Q9UP95 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SLC12A4Q9UP95 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SLC12A4Q9UP95 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SLC12A4Q9UP95 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SLC12A4Q9UP95 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SLC12A4Q9UP95 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SLC12A4Q9UP95 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SLC12A4Q9UP95 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SLC12A4Q9UP95 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SLC12A4Q9UP95 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SLC12A4Q9UP95 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SLC12A4Q9UP95 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SLC12A4Q9UP95 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SLC12A4Q9UP95 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SLC12A4Q9UP95 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SLC12A4Q9UP95 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SLC12A4Q9UP95 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SLC12A4Q9UP95 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SLC12A4Q9UP95 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SLC12A4Q9UP95 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SLC12A4Q9UP95 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SLC12A4Q9UP95 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SLC12A4Q9UP95 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SLC12A4Q9UP95 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SLC12A4Q9UP95 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SLC12A4Q9UP95 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SLC12A4Q9UP95 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.7 ms