Protein–RNA interactions for Protein: Q9UM00

TMCO1, Calcium load-activated calcium channel, humanhuman

Predictions only

Length 188 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMCO1Q9UM00 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TMCO1Q9UM00 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TMCO1Q9UM00 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
TMCO1Q9UM00 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TMCO1Q9UM00 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TMCO1Q9UM00 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TMCO1Q9UM00 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TMCO1Q9UM00 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TMCO1Q9UM00 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TMCO1Q9UM00 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TMCO1Q9UM00 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TMCO1Q9UM00 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TMCO1Q9UM00 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TMCO1Q9UM00 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TMCO1Q9UM00 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TMCO1Q9UM00 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TMCO1Q9UM00 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TMCO1Q9UM00 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TMCO1Q9UM00 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TMCO1Q9UM00 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TMCO1Q9UM00 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TMCO1Q9UM00 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
TMCO1Q9UM00 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
TMCO1Q9UM00 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TMCO1Q9UM00 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TMCO1Q9UM00 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TMCO1Q9UM00 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TMCO1Q9UM00 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TMCO1Q9UM00 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TMCO1Q9UM00 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TMCO1Q9UM00 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
TMCO1Q9UM00 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TMCO1Q9UM00 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TMCO1Q9UM00 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
TMCO1Q9UM00 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TMCO1Q9UM00 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TMCO1Q9UM00 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TMCO1Q9UM00 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TMCO1Q9UM00 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TMCO1Q9UM00 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TMCO1Q9UM00 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TMCO1Q9UM00 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TMCO1Q9UM00 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TMCO1Q9UM00 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TMCO1Q9UM00 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TMCO1Q9UM00 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TMCO1Q9UM00 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TMCO1Q9UM00 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TMCO1Q9UM00 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TMCO1Q9UM00 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TMCO1Q9UM00 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TMCO1Q9UM00 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TMCO1Q9UM00 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TMCO1Q9UM00 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TMCO1Q9UM00 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TMCO1Q9UM00 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TMCO1Q9UM00 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TMCO1Q9UM00 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TMCO1Q9UM00 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TMCO1Q9UM00 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TMCO1Q9UM00 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TMCO1Q9UM00 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TMCO1Q9UM00 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TMCO1Q9UM00 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TMCO1Q9UM00 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TMCO1Q9UM00 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TMCO1Q9UM00 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TMCO1Q9UM00 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TMCO1Q9UM00 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TMCO1Q9UM00 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
TMCO1Q9UM00 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.19
TMCO1Q9UM00 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TMCO1Q9UM00 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TMCO1Q9UM00 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TMCO1Q9UM00 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TMCO1Q9UM00 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TMCO1Q9UM00 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TMCO1Q9UM00 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TMCO1Q9UM00 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TMCO1Q9UM00 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TMCO1Q9UM00 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TMCO1Q9UM00 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
TMCO1Q9UM00 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TMCO1Q9UM00 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TMCO1Q9UM00 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TMCO1Q9UM00 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TMCO1Q9UM00 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TMCO1Q9UM00 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TMCO1Q9UM00 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TMCO1Q9UM00 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TMCO1Q9UM00 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
TMCO1Q9UM00 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TMCO1Q9UM00 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TMCO1Q9UM00 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TMCO1Q9UM00 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TMCO1Q9UM00 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TMCO1Q9UM00 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TMCO1Q9UM00 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TMCO1Q9UM00 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TMCO1Q9UM00 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.2 ms