Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULU4

ZMYND8, Protein kinase C-binding protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,186 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZMYND8Q9ULU4 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
ZMYND8Q9ULU4 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
ZMYND8Q9ULU4 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
ZMYND8Q9ULU4 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
ZMYND8Q9ULU4 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
ZMYND8Q9ULU4 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
ZMYND8Q9ULU4 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
ZMYND8Q9ULU4 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
ZMYND8Q9ULU4 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
ZMYND8Q9ULU4 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
ZMYND8Q9ULU4 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
ZMYND8Q9ULU4 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
ZMYND8Q9ULU4 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
ZMYND8Q9ULU4 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
ZMYND8Q9ULU4 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
ZMYND8Q9ULU4 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
ZMYND8Q9ULU4 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
ZMYND8Q9ULU4 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.71
ZMYND8Q9ULU4 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
ZMYND8Q9ULU4 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
ZMYND8Q9ULU4 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
ZMYND8Q9ULU4 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.7
ZMYND8Q9ULU4 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
ZMYND8Q9ULU4 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
ZMYND8Q9ULU4 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
ZMYND8Q9ULU4 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
ZMYND8Q9ULU4 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
ZMYND8Q9ULU4 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
ZMYND8Q9ULU4 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
ZMYND8Q9ULU4 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
ZMYND8Q9ULU4 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
ZMYND8Q9ULU4 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
ZMYND8Q9ULU4 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
ZMYND8Q9ULU4 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
ZMYND8Q9ULU4 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
ZMYND8Q9ULU4 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
ZMYND8Q9ULU4 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
ZMYND8Q9ULU4 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
ZMYND8Q9ULU4 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
ZMYND8Q9ULU4 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC25.68■■□□□ 1.7
ZMYND8Q9ULU4 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
ZMYND8Q9ULU4 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
ZMYND8Q9ULU4 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
ZMYND8Q9ULU4 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
ZMYND8Q9ULU4 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
ZMYND8Q9ULU4 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
ZMYND8Q9ULU4 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
ZMYND8Q9ULU4 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
ZMYND8Q9ULU4 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC25.68■■□□□ 1.7
ZMYND8Q9ULU4 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
ZMYND8Q9ULU4 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
ZMYND8Q9ULU4 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
ZMYND8Q9ULU4 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
ZMYND8Q9ULU4 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
ZMYND8Q9ULU4 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
ZMYND8Q9ULU4 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC25.67■■□□□ 1.7
ZMYND8Q9ULU4 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
ZMYND8Q9ULU4 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
ZMYND8Q9ULU4 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
ZMYND8Q9ULU4 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
ZMYND8Q9ULU4 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
ZMYND8Q9ULU4 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
ZMYND8Q9ULU4 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
ZMYND8Q9ULU4 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
ZMYND8Q9ULU4 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
ZMYND8Q9ULU4 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
ZMYND8Q9ULU4 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
ZMYND8Q9ULU4 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
ZMYND8Q9ULU4 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
ZMYND8Q9ULU4 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
ZMYND8Q9ULU4 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
ZMYND8Q9ULU4 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
ZMYND8Q9ULU4 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
ZMYND8Q9ULU4 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
ZMYND8Q9ULU4 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
ZMYND8Q9ULU4 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
ZMYND8Q9ULU4 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
ZMYND8Q9ULU4 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
ZMYND8Q9ULU4 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.69
ZMYND8Q9ULU4 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
ZMYND8Q9ULU4 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
ZMYND8Q9ULU4 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
ZMYND8Q9ULU4 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
ZMYND8Q9ULU4 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
ZMYND8Q9ULU4 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
ZMYND8Q9ULU4 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
ZMYND8Q9ULU4 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC25.63■■□□□ 1.69
ZMYND8Q9ULU4 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
ZMYND8Q9ULU4 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
ZMYND8Q9ULU4 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
ZMYND8Q9ULU4 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC25.62■■□□□ 1.69
ZMYND8Q9ULU4 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
ZMYND8Q9ULU4 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
ZMYND8Q9ULU4 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC25.62■■□□□ 1.69
ZMYND8Q9ULU4 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
ZMYND8Q9ULU4 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
ZMYND8Q9ULU4 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
ZMYND8Q9ULU4 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
ZMYND8Q9ULU4 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
ZMYND8Q9ULU4 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.6 ms