Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULQ0

STRIP2, Striatin-interacting protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 834 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STRIP2Q9ULQ0 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
STRIP2Q9ULQ0 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
STRIP2Q9ULQ0 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
STRIP2Q9ULQ0 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
STRIP2Q9ULQ0 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
STRIP2Q9ULQ0 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
STRIP2Q9ULQ0 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
STRIP2Q9ULQ0 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
STRIP2Q9ULQ0 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
STRIP2Q9ULQ0 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
STRIP2Q9ULQ0 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
STRIP2Q9ULQ0 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
STRIP2Q9ULQ0 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
STRIP2Q9ULQ0 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
STRIP2Q9ULQ0 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.49
STRIP2Q9ULQ0 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
STRIP2Q9ULQ0 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
STRIP2Q9ULQ0 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
STRIP2Q9ULQ0 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
STRIP2Q9ULQ0 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
STRIP2Q9ULQ0 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC24.38■■□□□ 1.49
STRIP2Q9ULQ0 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
STRIP2Q9ULQ0 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
STRIP2Q9ULQ0 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
STRIP2Q9ULQ0 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
STRIP2Q9ULQ0 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
STRIP2Q9ULQ0 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
STRIP2Q9ULQ0 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
STRIP2Q9ULQ0 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
STRIP2Q9ULQ0 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
STRIP2Q9ULQ0 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
STRIP2Q9ULQ0 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
STRIP2Q9ULQ0 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
STRIP2Q9ULQ0 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
STRIP2Q9ULQ0 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
STRIP2Q9ULQ0 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
STRIP2Q9ULQ0 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
STRIP2Q9ULQ0 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
STRIP2Q9ULQ0 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
STRIP2Q9ULQ0 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
STRIP2Q9ULQ0 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC24.36■■□□□ 1.49
STRIP2Q9ULQ0 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
STRIP2Q9ULQ0 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
STRIP2Q9ULQ0 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
STRIP2Q9ULQ0 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
STRIP2Q9ULQ0 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
STRIP2Q9ULQ0 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
STRIP2Q9ULQ0 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
STRIP2Q9ULQ0 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
STRIP2Q9ULQ0 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
STRIP2Q9ULQ0 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
STRIP2Q9ULQ0 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
STRIP2Q9ULQ0 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
STRIP2Q9ULQ0 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
STRIP2Q9ULQ0 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
STRIP2Q9ULQ0 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
STRIP2Q9ULQ0 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
STRIP2Q9ULQ0 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
STRIP2Q9ULQ0 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
STRIP2Q9ULQ0 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
STRIP2Q9ULQ0 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
STRIP2Q9ULQ0 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
STRIP2Q9ULQ0 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC24.33■■□□□ 1.49
STRIP2Q9ULQ0 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
STRIP2Q9ULQ0 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
STRIP2Q9ULQ0 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
STRIP2Q9ULQ0 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
STRIP2Q9ULQ0 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
STRIP2Q9ULQ0 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
STRIP2Q9ULQ0 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
STRIP2Q9ULQ0 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
STRIP2Q9ULQ0 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
STRIP2Q9ULQ0 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
STRIP2Q9ULQ0 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
STRIP2Q9ULQ0 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
STRIP2Q9ULQ0 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
STRIP2Q9ULQ0 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
STRIP2Q9ULQ0 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC24.31■■□□□ 1.48
STRIP2Q9ULQ0 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
STRIP2Q9ULQ0 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
STRIP2Q9ULQ0 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
STRIP2Q9ULQ0 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
STRIP2Q9ULQ0 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
STRIP2Q9ULQ0 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
STRIP2Q9ULQ0 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
STRIP2Q9ULQ0 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
STRIP2Q9ULQ0 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
STRIP2Q9ULQ0 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
STRIP2Q9ULQ0 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
STRIP2Q9ULQ0 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
STRIP2Q9ULQ0 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
STRIP2Q9ULQ0 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
STRIP2Q9ULQ0 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
STRIP2Q9ULQ0 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
STRIP2Q9ULQ0 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
STRIP2Q9ULQ0 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
STRIP2Q9ULQ0 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
STRIP2Q9ULQ0 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
STRIP2Q9ULQ0 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
STRIP2Q9ULQ0 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.9 ms