Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULM2

ZNF490, Zinc finger protein 490, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 529 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF490Q9ULM2 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ZNF490Q9ULM2 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ZNF490Q9ULM2 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ZNF490Q9ULM2 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ZNF490Q9ULM2 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ZNF490Q9ULM2 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
ZNF490Q9ULM2 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ZNF490Q9ULM2 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ZNF490Q9ULM2 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ZNF490Q9ULM2 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ZNF490Q9ULM2 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ZNF490Q9ULM2 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ZNF490Q9ULM2 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ZNF490Q9ULM2 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ZNF490Q9ULM2 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ZNF490Q9ULM2 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ZNF490Q9ULM2 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
ZNF490Q9ULM2 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ZNF490Q9ULM2 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ZNF490Q9ULM2 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ZNF490Q9ULM2 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ZNF490Q9ULM2 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
ZNF490Q9ULM2 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ZNF490Q9ULM2 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ZNF490Q9ULM2 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ZNF490Q9ULM2 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ZNF490Q9ULM2 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ZNF490Q9ULM2 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
ZNF490Q9ULM2 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ZNF490Q9ULM2 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ZNF490Q9ULM2 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ZNF490Q9ULM2 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ZNF490Q9ULM2 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ZNF490Q9ULM2 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ZNF490Q9ULM2 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ZNF490Q9ULM2 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ZNF490Q9ULM2 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ZNF490Q9ULM2 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ZNF490Q9ULM2 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ZNF490Q9ULM2 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ZNF490Q9ULM2 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ZNF490Q9ULM2 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ZNF490Q9ULM2 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ZNF490Q9ULM2 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ZNF490Q9ULM2 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
ZNF490Q9ULM2 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ZNF490Q9ULM2 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ZNF490Q9ULM2 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ZNF490Q9ULM2 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ZNF490Q9ULM2 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ZNF490Q9ULM2 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ZNF490Q9ULM2 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ZNF490Q9ULM2 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ZNF490Q9ULM2 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ZNF490Q9ULM2 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ZNF490Q9ULM2 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ZNF490Q9ULM2 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ZNF490Q9ULM2 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ZNF490Q9ULM2 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ZNF490Q9ULM2 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ZNF490Q9ULM2 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ZNF490Q9ULM2 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ZNF490Q9ULM2 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ZNF490Q9ULM2 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ZNF490Q9ULM2 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ZNF490Q9ULM2 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ZNF490Q9ULM2 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ZNF490Q9ULM2 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ZNF490Q9ULM2 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ZNF490Q9ULM2 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ZNF490Q9ULM2 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ZNF490Q9ULM2 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ZNF490Q9ULM2 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ZNF490Q9ULM2 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ZNF490Q9ULM2 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ZNF490Q9ULM2 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ZNF490Q9ULM2 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ZNF490Q9ULM2 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ZNF490Q9ULM2 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ZNF490Q9ULM2 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ZNF490Q9ULM2 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
ZNF490Q9ULM2 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ZNF490Q9ULM2 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ZNF490Q9ULM2 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ZNF490Q9ULM2 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ZNF490Q9ULM2 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ZNF490Q9ULM2 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.15
ZNF490Q9ULM2 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ZNF490Q9ULM2 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ZNF490Q9ULM2 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ZNF490Q9ULM2 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ZNF490Q9ULM2 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ZNF490Q9ULM2 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ZNF490Q9ULM2 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
ZNF490Q9ULM2 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ZNF490Q9ULM2 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ZNF490Q9ULM2 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ZNF490Q9ULM2 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ZNF490Q9ULM2 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ZNF490Q9ULM2 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 212.4 ms