Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKQ2

ADAM28, Disintegrin and metalloproteinase domain-containing protein 28, humanhuman

Predictions only

Length 775 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ADAM28Q9UKQ2 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
ADAM28Q9UKQ2 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
ADAM28Q9UKQ2 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
ADAM28Q9UKQ2 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
ADAM28Q9UKQ2 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC24.69■■□□□ 1.54
ADAM28Q9UKQ2 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
ADAM28Q9UKQ2 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
ADAM28Q9UKQ2 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
ADAM28Q9UKQ2 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
ADAM28Q9UKQ2 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
ADAM28Q9UKQ2 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
ADAM28Q9UKQ2 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
ADAM28Q9UKQ2 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
ADAM28Q9UKQ2 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
ADAM28Q9UKQ2 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
ADAM28Q9UKQ2 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
ADAM28Q9UKQ2 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
ADAM28Q9UKQ2 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
ADAM28Q9UKQ2 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
ADAM28Q9UKQ2 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
ADAM28Q9UKQ2 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
ADAM28Q9UKQ2 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
ADAM28Q9UKQ2 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
ADAM28Q9UKQ2 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
ADAM28Q9UKQ2 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
ADAM28Q9UKQ2 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
ADAM28Q9UKQ2 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
ADAM28Q9UKQ2 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
ADAM28Q9UKQ2 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
ADAM28Q9UKQ2 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
ADAM28Q9UKQ2 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
ADAM28Q9UKQ2 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
ADAM28Q9UKQ2 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
ADAM28Q9UKQ2 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
ADAM28Q9UKQ2 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
ADAM28Q9UKQ2 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
ADAM28Q9UKQ2 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
ADAM28Q9UKQ2 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
ADAM28Q9UKQ2 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
ADAM28Q9UKQ2 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
ADAM28Q9UKQ2 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
ADAM28Q9UKQ2 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
ADAM28Q9UKQ2 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
ADAM28Q9UKQ2 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
ADAM28Q9UKQ2 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
ADAM28Q9UKQ2 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
ADAM28Q9UKQ2 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC24.64■■□□□ 1.53
ADAM28Q9UKQ2 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
ADAM28Q9UKQ2 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
ADAM28Q9UKQ2 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
ADAM28Q9UKQ2 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
ADAM28Q9UKQ2 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
ADAM28Q9UKQ2 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
ADAM28Q9UKQ2 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
ADAM28Q9UKQ2 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
ADAM28Q9UKQ2 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
ADAM28Q9UKQ2 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
ADAM28Q9UKQ2 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
ADAM28Q9UKQ2 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
ADAM28Q9UKQ2 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
ADAM28Q9UKQ2 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
ADAM28Q9UKQ2 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
ADAM28Q9UKQ2 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
ADAM28Q9UKQ2 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
ADAM28Q9UKQ2 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
ADAM28Q9UKQ2 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
ADAM28Q9UKQ2 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
ADAM28Q9UKQ2 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
ADAM28Q9UKQ2 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
ADAM28Q9UKQ2 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
ADAM28Q9UKQ2 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
ADAM28Q9UKQ2 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
ADAM28Q9UKQ2 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
ADAM28Q9UKQ2 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
ADAM28Q9UKQ2 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
ADAM28Q9UKQ2 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
ADAM28Q9UKQ2 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
ADAM28Q9UKQ2 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
ADAM28Q9UKQ2 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
ADAM28Q9UKQ2 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
ADAM28Q9UKQ2 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
ADAM28Q9UKQ2 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
ADAM28Q9UKQ2 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
ADAM28Q9UKQ2 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
ADAM28Q9UKQ2 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC24.59■■□□□ 1.53
ADAM28Q9UKQ2 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
ADAM28Q9UKQ2 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
ADAM28Q9UKQ2 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
ADAM28Q9UKQ2 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
ADAM28Q9UKQ2 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
ADAM28Q9UKQ2 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
ADAM28Q9UKQ2 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
ADAM28Q9UKQ2 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
ADAM28Q9UKQ2 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
ADAM28Q9UKQ2 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
ADAM28Q9UKQ2 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
ADAM28Q9UKQ2 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
ADAM28Q9UKQ2 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC24.58■■□□□ 1.52
ADAM28Q9UKQ2 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
ADAM28Q9UKQ2 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16 ms