Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJD0

RIMS3, Regulating synaptic membrane exocytosis protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 308 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIMS3Q9UJD0 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
RIMS3Q9UJD0 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
RIMS3Q9UJD0 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
RIMS3Q9UJD0 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
RIMS3Q9UJD0 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
RIMS3Q9UJD0 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
RIMS3Q9UJD0 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
RIMS3Q9UJD0 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
RIMS3Q9UJD0 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
RIMS3Q9UJD0 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
RIMS3Q9UJD0 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
RIMS3Q9UJD0 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
RIMS3Q9UJD0 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
RIMS3Q9UJD0 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
RIMS3Q9UJD0 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
RIMS3Q9UJD0 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC21.78■■□□□ 1.08
RIMS3Q9UJD0 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
RIMS3Q9UJD0 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
RIMS3Q9UJD0 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
RIMS3Q9UJD0 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
RIMS3Q9UJD0 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
RIMS3Q9UJD0 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
RIMS3Q9UJD0 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
RIMS3Q9UJD0 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
RIMS3Q9UJD0 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
RIMS3Q9UJD0 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
RIMS3Q9UJD0 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
RIMS3Q9UJD0 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
RIMS3Q9UJD0 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
RIMS3Q9UJD0 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
RIMS3Q9UJD0 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
RIMS3Q9UJD0 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
RIMS3Q9UJD0 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
RIMS3Q9UJD0 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
RIMS3Q9UJD0 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
RIMS3Q9UJD0 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
RIMS3Q9UJD0 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
RIMS3Q9UJD0 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
RIMS3Q9UJD0 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
RIMS3Q9UJD0 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
RIMS3Q9UJD0 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
RIMS3Q9UJD0 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
RIMS3Q9UJD0 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
RIMS3Q9UJD0 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
RIMS3Q9UJD0 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
RIMS3Q9UJD0 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
RIMS3Q9UJD0 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
RIMS3Q9UJD0 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
RIMS3Q9UJD0 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
RIMS3Q9UJD0 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
RIMS3Q9UJD0 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
RIMS3Q9UJD0 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
RIMS3Q9UJD0 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
RIMS3Q9UJD0 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
RIMS3Q9UJD0 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
RIMS3Q9UJD0 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
RIMS3Q9UJD0 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
RIMS3Q9UJD0 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
RIMS3Q9UJD0 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
RIMS3Q9UJD0 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
RIMS3Q9UJD0 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
RIMS3Q9UJD0 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
RIMS3Q9UJD0 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
RIMS3Q9UJD0 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
RIMS3Q9UJD0 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
RIMS3Q9UJD0 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
RIMS3Q9UJD0 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
RIMS3Q9UJD0 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
RIMS3Q9UJD0 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
RIMS3Q9UJD0 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
RIMS3Q9UJD0 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
RIMS3Q9UJD0 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
RIMS3Q9UJD0 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
RIMS3Q9UJD0 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
RIMS3Q9UJD0 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
RIMS3Q9UJD0 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
RIMS3Q9UJD0 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
RIMS3Q9UJD0 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
RIMS3Q9UJD0 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
RIMS3Q9UJD0 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
RIMS3Q9UJD0 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
RIMS3Q9UJD0 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
RIMS3Q9UJD0 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
RIMS3Q9UJD0 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
RIMS3Q9UJD0 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
RIMS3Q9UJD0 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
RIMS3Q9UJD0 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
RIMS3Q9UJD0 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
RIMS3Q9UJD0 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
RIMS3Q9UJD0 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
RIMS3Q9UJD0 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
RIMS3Q9UJD0 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
RIMS3Q9UJD0 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
RIMS3Q9UJD0 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
RIMS3Q9UJD0 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
RIMS3Q9UJD0 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
RIMS3Q9UJD0 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
RIMS3Q9UJD0 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
RIMS3Q9UJD0 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
RIMS3Q9UJD0 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.4 ms