Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHJ3

SFMBT1, Scm-like with four MBT domains protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 866 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFMBT1Q9UHJ3 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SFMBT1Q9UHJ3 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SFMBT1Q9UHJ3 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
SFMBT1Q9UHJ3 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SFMBT1Q9UHJ3 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SFMBT1Q9UHJ3 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SFMBT1Q9UHJ3 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SFMBT1Q9UHJ3 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SFMBT1Q9UHJ3 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SFMBT1Q9UHJ3 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SFMBT1Q9UHJ3 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SFMBT1Q9UHJ3 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SFMBT1Q9UHJ3 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SFMBT1Q9UHJ3 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SFMBT1Q9UHJ3 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SFMBT1Q9UHJ3 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SFMBT1Q9UHJ3 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SFMBT1Q9UHJ3 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SFMBT1Q9UHJ3 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SFMBT1Q9UHJ3 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SFMBT1Q9UHJ3 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SFMBT1Q9UHJ3 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SFMBT1Q9UHJ3 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SFMBT1Q9UHJ3 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SFMBT1Q9UHJ3 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
SFMBT1Q9UHJ3 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
SFMBT1Q9UHJ3 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
SFMBT1Q9UHJ3 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SFMBT1Q9UHJ3 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SFMBT1Q9UHJ3 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
SFMBT1Q9UHJ3 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
SFMBT1Q9UHJ3 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
SFMBT1Q9UHJ3 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SFMBT1Q9UHJ3 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SFMBT1Q9UHJ3 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SFMBT1Q9UHJ3 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
SFMBT1Q9UHJ3 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SFMBT1Q9UHJ3 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SFMBT1Q9UHJ3 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SFMBT1Q9UHJ3 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SFMBT1Q9UHJ3 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SFMBT1Q9UHJ3 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SFMBT1Q9UHJ3 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SFMBT1Q9UHJ3 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SFMBT1Q9UHJ3 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SFMBT1Q9UHJ3 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SFMBT1Q9UHJ3 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SFMBT1Q9UHJ3 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SFMBT1Q9UHJ3 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SFMBT1Q9UHJ3 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SFMBT1Q9UHJ3 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SFMBT1Q9UHJ3 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SFMBT1Q9UHJ3 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SFMBT1Q9UHJ3 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SFMBT1Q9UHJ3 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SFMBT1Q9UHJ3 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SFMBT1Q9UHJ3 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SFMBT1Q9UHJ3 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SFMBT1Q9UHJ3 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SFMBT1Q9UHJ3 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SFMBT1Q9UHJ3 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SFMBT1Q9UHJ3 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SFMBT1Q9UHJ3 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SFMBT1Q9UHJ3 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
SFMBT1Q9UHJ3 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SFMBT1Q9UHJ3 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SFMBT1Q9UHJ3 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SFMBT1Q9UHJ3 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SFMBT1Q9UHJ3 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SFMBT1Q9UHJ3 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SFMBT1Q9UHJ3 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SFMBT1Q9UHJ3 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SFMBT1Q9UHJ3 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SFMBT1Q9UHJ3 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SFMBT1Q9UHJ3 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SFMBT1Q9UHJ3 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SFMBT1Q9UHJ3 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SFMBT1Q9UHJ3 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
SFMBT1Q9UHJ3 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
SFMBT1Q9UHJ3 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
SFMBT1Q9UHJ3 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
SFMBT1Q9UHJ3 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SFMBT1Q9UHJ3 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SFMBT1Q9UHJ3 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SFMBT1Q9UHJ3 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.43
SFMBT1Q9UHJ3 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SFMBT1Q9UHJ3 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SFMBT1Q9UHJ3 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
SFMBT1Q9UHJ3 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
SFMBT1Q9UHJ3 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SFMBT1Q9UHJ3 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SFMBT1Q9UHJ3 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SFMBT1Q9UHJ3 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SFMBT1Q9UHJ3 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SFMBT1Q9UHJ3 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SFMBT1Q9UHJ3 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SFMBT1Q9UHJ3 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SFMBT1Q9UHJ3 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SFMBT1Q9UHJ3 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SFMBT1Q9UHJ3 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.5 ms