Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHD2

TBK1, Serine/threonine-protein kinase TBK1, humanhuman

Predictions only

Length 729 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TBK1Q9UHD2 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
TBK1Q9UHD2 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TBK1Q9UHD2 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TBK1Q9UHD2 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.31
TBK1Q9UHD2 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TBK1Q9UHD2 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TBK1Q9UHD2 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TBK1Q9UHD2 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TBK1Q9UHD2 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TBK1Q9UHD2 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TBK1Q9UHD2 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TBK1Q9UHD2 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TBK1Q9UHD2 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TBK1Q9UHD2 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TBK1Q9UHD2 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TBK1Q9UHD2 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TBK1Q9UHD2 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TBK1Q9UHD2 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
TBK1Q9UHD2 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TBK1Q9UHD2 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
TBK1Q9UHD2 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TBK1Q9UHD2 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TBK1Q9UHD2 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TBK1Q9UHD2 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TBK1Q9UHD2 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TBK1Q9UHD2 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TBK1Q9UHD2 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TBK1Q9UHD2 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TBK1Q9UHD2 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TBK1Q9UHD2 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TBK1Q9UHD2 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TBK1Q9UHD2 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TBK1Q9UHD2 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TBK1Q9UHD2 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TBK1Q9UHD2 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TBK1Q9UHD2 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TBK1Q9UHD2 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TBK1Q9UHD2 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TBK1Q9UHD2 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TBK1Q9UHD2 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TBK1Q9UHD2 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TBK1Q9UHD2 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TBK1Q9UHD2 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TBK1Q9UHD2 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TBK1Q9UHD2 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TBK1Q9UHD2 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TBK1Q9UHD2 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TBK1Q9UHD2 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TBK1Q9UHD2 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TBK1Q9UHD2 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TBK1Q9UHD2 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
TBK1Q9UHD2 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TBK1Q9UHD2 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TBK1Q9UHD2 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TBK1Q9UHD2 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TBK1Q9UHD2 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TBK1Q9UHD2 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TBK1Q9UHD2 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TBK1Q9UHD2 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TBK1Q9UHD2 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TBK1Q9UHD2 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TBK1Q9UHD2 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TBK1Q9UHD2 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TBK1Q9UHD2 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TBK1Q9UHD2 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TBK1Q9UHD2 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TBK1Q9UHD2 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TBK1Q9UHD2 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TBK1Q9UHD2 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TBK1Q9UHD2 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
TBK1Q9UHD2 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TBK1Q9UHD2 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TBK1Q9UHD2 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TBK1Q9UHD2 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TBK1Q9UHD2 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TBK1Q9UHD2 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TBK1Q9UHD2 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TBK1Q9UHD2 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TBK1Q9UHD2 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TBK1Q9UHD2 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TBK1Q9UHD2 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TBK1Q9UHD2 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TBK1Q9UHD2 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TBK1Q9UHD2 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
TBK1Q9UHD2 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TBK1Q9UHD2 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TBK1Q9UHD2 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
TBK1Q9UHD2 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TBK1Q9UHD2 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TBK1Q9UHD2 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TBK1Q9UHD2 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TBK1Q9UHD2 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TBK1Q9UHD2 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TBK1Q9UHD2 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TBK1Q9UHD2 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TBK1Q9UHD2 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TBK1Q9UHD2 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TBK1Q9UHD2 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TBK1Q9UHD2 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TBK1Q9UHD2 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.7 ms