Protein–RNA interactions for Protein: Q9UH03

SEPT3, Neuronal-specific septin-3, humanhuman

Predictions only

Length 358 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEPT3Q9UH03 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SEPT3Q9UH03 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SEPT3Q9UH03 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SEPT3Q9UH03 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SEPT3Q9UH03 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SEPT3Q9UH03 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SEPT3Q9UH03 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SEPT3Q9UH03 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SEPT3Q9UH03 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SEPT3Q9UH03 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SEPT3Q9UH03 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
SEPT3Q9UH03 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
SEPT3Q9UH03 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SEPT3Q9UH03 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SEPT3Q9UH03 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SEPT3Q9UH03 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SEPT3Q9UH03 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SEPT3Q9UH03 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SEPT3Q9UH03 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SEPT3Q9UH03 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SEPT3Q9UH03 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SEPT3Q9UH03 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SEPT3Q9UH03 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SEPT3Q9UH03 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SEPT3Q9UH03 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SEPT3Q9UH03 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SEPT3Q9UH03 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
SEPT3Q9UH03 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
SEPT3Q9UH03 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SEPT3Q9UH03 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
SEPT3Q9UH03 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SEPT3Q9UH03 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SEPT3Q9UH03 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SEPT3Q9UH03 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SEPT3Q9UH03 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SEPT3Q9UH03 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SEPT3Q9UH03 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SEPT3Q9UH03 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SEPT3Q9UH03 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SEPT3Q9UH03 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SEPT3Q9UH03 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SEPT3Q9UH03 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SEPT3Q9UH03 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SEPT3Q9UH03 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SEPT3Q9UH03 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SEPT3Q9UH03 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SEPT3Q9UH03 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SEPT3Q9UH03 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SEPT3Q9UH03 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SEPT3Q9UH03 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SEPT3Q9UH03 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SEPT3Q9UH03 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SEPT3Q9UH03 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SEPT3Q9UH03 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SEPT3Q9UH03 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SEPT3Q9UH03 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SEPT3Q9UH03 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SEPT3Q9UH03 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SEPT3Q9UH03 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SEPT3Q9UH03 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SEPT3Q9UH03 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SEPT3Q9UH03 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SEPT3Q9UH03 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SEPT3Q9UH03 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SEPT3Q9UH03 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SEPT3Q9UH03 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SEPT3Q9UH03 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
SEPT3Q9UH03 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SEPT3Q9UH03 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SEPT3Q9UH03 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SEPT3Q9UH03 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SEPT3Q9UH03 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SEPT3Q9UH03 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SEPT3Q9UH03 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SEPT3Q9UH03 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SEPT3Q9UH03 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SEPT3Q9UH03 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SEPT3Q9UH03 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SEPT3Q9UH03 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SEPT3Q9UH03 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SEPT3Q9UH03 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SEPT3Q9UH03 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SEPT3Q9UH03 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SEPT3Q9UH03 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SEPT3Q9UH03 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SEPT3Q9UH03 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SEPT3Q9UH03 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SEPT3Q9UH03 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SEPT3Q9UH03 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SEPT3Q9UH03 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SEPT3Q9UH03 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SEPT3Q9UH03 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SEPT3Q9UH03 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SEPT3Q9UH03 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SEPT3Q9UH03 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SEPT3Q9UH03 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SEPT3Q9UH03 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SEPT3Q9UH03 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
SEPT3Q9UH03 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
SEPT3Q9UH03 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.1 ms