Protein–RNA interactions for Protein: Q9UGJ1

TUBGCP4, Gamma-tubulin complex component 4, humanhuman

Predictions only

Length 667 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBGCP4Q9UGJ1 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
TUBGCP4Q9UGJ1 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
TUBGCP4Q9UGJ1 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC24.85■■□□□ 1.57
TUBGCP4Q9UGJ1 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
TUBGCP4Q9UGJ1 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
TUBGCP4Q9UGJ1 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
TUBGCP4Q9UGJ1 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
TUBGCP4Q9UGJ1 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
TUBGCP4Q9UGJ1 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
TUBGCP4Q9UGJ1 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
TUBGCP4Q9UGJ1 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
TUBGCP4Q9UGJ1 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
TUBGCP4Q9UGJ1 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
TUBGCP4Q9UGJ1 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
TUBGCP4Q9UGJ1 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
TUBGCP4Q9UGJ1 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
TUBGCP4Q9UGJ1 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
TUBGCP4Q9UGJ1 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
TUBGCP4Q9UGJ1 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
TUBGCP4Q9UGJ1 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
TUBGCP4Q9UGJ1 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
TUBGCP4Q9UGJ1 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
TUBGCP4Q9UGJ1 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
TUBGCP4Q9UGJ1 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
TUBGCP4Q9UGJ1 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
TUBGCP4Q9UGJ1 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
TUBGCP4Q9UGJ1 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
TUBGCP4Q9UGJ1 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
TUBGCP4Q9UGJ1 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
TUBGCP4Q9UGJ1 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
TUBGCP4Q9UGJ1 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
TUBGCP4Q9UGJ1 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
TUBGCP4Q9UGJ1 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC24.83■■□□□ 1.56
TUBGCP4Q9UGJ1 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
TUBGCP4Q9UGJ1 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
TUBGCP4Q9UGJ1 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
TUBGCP4Q9UGJ1 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
TUBGCP4Q9UGJ1 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
TUBGCP4Q9UGJ1 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
TUBGCP4Q9UGJ1 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
TUBGCP4Q9UGJ1 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
TUBGCP4Q9UGJ1 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
TUBGCP4Q9UGJ1 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
TUBGCP4Q9UGJ1 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
TUBGCP4Q9UGJ1 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
TUBGCP4Q9UGJ1 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
TUBGCP4Q9UGJ1 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
TUBGCP4Q9UGJ1 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
TUBGCP4Q9UGJ1 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
TUBGCP4Q9UGJ1 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
TUBGCP4Q9UGJ1 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
TUBGCP4Q9UGJ1 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
TUBGCP4Q9UGJ1 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
TUBGCP4Q9UGJ1 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
TUBGCP4Q9UGJ1 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
TUBGCP4Q9UGJ1 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
TUBGCP4Q9UGJ1 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
TUBGCP4Q9UGJ1 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
TUBGCP4Q9UGJ1 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
TUBGCP4Q9UGJ1 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
TUBGCP4Q9UGJ1 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
TUBGCP4Q9UGJ1 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
TUBGCP4Q9UGJ1 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
TUBGCP4Q9UGJ1 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
TUBGCP4Q9UGJ1 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
TUBGCP4Q9UGJ1 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
TUBGCP4Q9UGJ1 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
TUBGCP4Q9UGJ1 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
TUBGCP4Q9UGJ1 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
TUBGCP4Q9UGJ1 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
TUBGCP4Q9UGJ1 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
TUBGCP4Q9UGJ1 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
TUBGCP4Q9UGJ1 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
TUBGCP4Q9UGJ1 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
TUBGCP4Q9UGJ1 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
TUBGCP4Q9UGJ1 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
TUBGCP4Q9UGJ1 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
TUBGCP4Q9UGJ1 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
TUBGCP4Q9UGJ1 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
TUBGCP4Q9UGJ1 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
TUBGCP4Q9UGJ1 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
TUBGCP4Q9UGJ1 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
TUBGCP4Q9UGJ1 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
TUBGCP4Q9UGJ1 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
TUBGCP4Q9UGJ1 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
TUBGCP4Q9UGJ1 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
TUBGCP4Q9UGJ1 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
TUBGCP4Q9UGJ1 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
TUBGCP4Q9UGJ1 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
TUBGCP4Q9UGJ1 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
TUBGCP4Q9UGJ1 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
TUBGCP4Q9UGJ1 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
TUBGCP4Q9UGJ1 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
TUBGCP4Q9UGJ1 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
TUBGCP4Q9UGJ1 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
TUBGCP4Q9UGJ1 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
TUBGCP4Q9UGJ1 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC24.74■■□□□ 1.55
TUBGCP4Q9UGJ1 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
TUBGCP4Q9UGJ1 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
TUBGCP4Q9UGJ1 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.2 ms