Protein–RNA interactions for Protein: Q9UFN0

NIPSNAP3A, Protein NipSnap homolog 3A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 247 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NIPSNAP3AQ9UFN0 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
NIPSNAP3AQ9UFN0 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
NIPSNAP3AQ9UFN0 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
NIPSNAP3AQ9UFN0 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
NIPSNAP3AQ9UFN0 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
NIPSNAP3AQ9UFN0 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
NIPSNAP3AQ9UFN0 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
NIPSNAP3AQ9UFN0 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
NIPSNAP3AQ9UFN0 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
NIPSNAP3AQ9UFN0 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
NIPSNAP3AQ9UFN0 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
NIPSNAP3AQ9UFN0 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
NIPSNAP3AQ9UFN0 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
NIPSNAP3AQ9UFN0 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
NIPSNAP3AQ9UFN0 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
NIPSNAP3AQ9UFN0 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
NIPSNAP3AQ9UFN0 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
NIPSNAP3AQ9UFN0 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
NIPSNAP3AQ9UFN0 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
NIPSNAP3AQ9UFN0 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
NIPSNAP3AQ9UFN0 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
NIPSNAP3AQ9UFN0 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
NIPSNAP3AQ9UFN0 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
NIPSNAP3AQ9UFN0 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
NIPSNAP3AQ9UFN0 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
NIPSNAP3AQ9UFN0 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
NIPSNAP3AQ9UFN0 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
NIPSNAP3AQ9UFN0 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
NIPSNAP3AQ9UFN0 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
NIPSNAP3AQ9UFN0 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
NIPSNAP3AQ9UFN0 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
NIPSNAP3AQ9UFN0 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
NIPSNAP3AQ9UFN0 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
NIPSNAP3AQ9UFN0 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
NIPSNAP3AQ9UFN0 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
NIPSNAP3AQ9UFN0 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
NIPSNAP3AQ9UFN0 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
NIPSNAP3AQ9UFN0 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
NIPSNAP3AQ9UFN0 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
NIPSNAP3AQ9UFN0 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
NIPSNAP3AQ9UFN0 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
NIPSNAP3AQ9UFN0 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
NIPSNAP3AQ9UFN0 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
NIPSNAP3AQ9UFN0 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
NIPSNAP3AQ9UFN0 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
NIPSNAP3AQ9UFN0 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
NIPSNAP3AQ9UFN0 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
NIPSNAP3AQ9UFN0 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
NIPSNAP3AQ9UFN0 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
NIPSNAP3AQ9UFN0 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
NIPSNAP3AQ9UFN0 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
NIPSNAP3AQ9UFN0 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
NIPSNAP3AQ9UFN0 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
NIPSNAP3AQ9UFN0 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
NIPSNAP3AQ9UFN0 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
NIPSNAP3AQ9UFN0 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
NIPSNAP3AQ9UFN0 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
NIPSNAP3AQ9UFN0 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
NIPSNAP3AQ9UFN0 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
NIPSNAP3AQ9UFN0 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
NIPSNAP3AQ9UFN0 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
NIPSNAP3AQ9UFN0 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
NIPSNAP3AQ9UFN0 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
NIPSNAP3AQ9UFN0 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
NIPSNAP3AQ9UFN0 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
NIPSNAP3AQ9UFN0 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
NIPSNAP3AQ9UFN0 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
NIPSNAP3AQ9UFN0 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
NIPSNAP3AQ9UFN0 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
NIPSNAP3AQ9UFN0 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
NIPSNAP3AQ9UFN0 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
NIPSNAP3AQ9UFN0 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
NIPSNAP3AQ9UFN0 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
NIPSNAP3AQ9UFN0 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
NIPSNAP3AQ9UFN0 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
NIPSNAP3AQ9UFN0 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
NIPSNAP3AQ9UFN0 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
NIPSNAP3AQ9UFN0 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
NIPSNAP3AQ9UFN0 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
NIPSNAP3AQ9UFN0 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
NIPSNAP3AQ9UFN0 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
NIPSNAP3AQ9UFN0 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
NIPSNAP3AQ9UFN0 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
NIPSNAP3AQ9UFN0 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
NIPSNAP3AQ9UFN0 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
NIPSNAP3AQ9UFN0 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
NIPSNAP3AQ9UFN0 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
NIPSNAP3AQ9UFN0 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
NIPSNAP3AQ9UFN0 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
NIPSNAP3AQ9UFN0 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
NIPSNAP3AQ9UFN0 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
NIPSNAP3AQ9UFN0 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
NIPSNAP3AQ9UFN0 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
NIPSNAP3AQ9UFN0 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
NIPSNAP3AQ9UFN0 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
NIPSNAP3AQ9UFN0 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
NIPSNAP3AQ9UFN0 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
NIPSNAP3AQ9UFN0 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
NIPSNAP3AQ9UFN0 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
NIPSNAP3AQ9UFN0 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.9 ms