Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0W5

SCHIP1, Schwannomin-interacting protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 487 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCHIP1Q9P0W5 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SCHIP1Q9P0W5 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SCHIP1Q9P0W5 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SCHIP1Q9P0W5 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SCHIP1Q9P0W5 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SCHIP1Q9P0W5 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SCHIP1Q9P0W5 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SCHIP1Q9P0W5 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SCHIP1Q9P0W5 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SCHIP1Q9P0W5 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SCHIP1Q9P0W5 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SCHIP1Q9P0W5 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SCHIP1Q9P0W5 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SCHIP1Q9P0W5 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SCHIP1Q9P0W5 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SCHIP1Q9P0W5 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
SCHIP1Q9P0W5 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SCHIP1Q9P0W5 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SCHIP1Q9P0W5 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SCHIP1Q9P0W5 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SCHIP1Q9P0W5 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SCHIP1Q9P0W5 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SCHIP1Q9P0W5 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SCHIP1Q9P0W5 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SCHIP1Q9P0W5 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SCHIP1Q9P0W5 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SCHIP1Q9P0W5 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SCHIP1Q9P0W5 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SCHIP1Q9P0W5 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SCHIP1Q9P0W5 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SCHIP1Q9P0W5 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SCHIP1Q9P0W5 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SCHIP1Q9P0W5 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SCHIP1Q9P0W5 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SCHIP1Q9P0W5 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SCHIP1Q9P0W5 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SCHIP1Q9P0W5 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SCHIP1Q9P0W5 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SCHIP1Q9P0W5 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SCHIP1Q9P0W5 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SCHIP1Q9P0W5 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SCHIP1Q9P0W5 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SCHIP1Q9P0W5 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SCHIP1Q9P0W5 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SCHIP1Q9P0W5 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SCHIP1Q9P0W5 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
SCHIP1Q9P0W5 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
SCHIP1Q9P0W5 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
SCHIP1Q9P0W5 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SCHIP1Q9P0W5 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SCHIP1Q9P0W5 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SCHIP1Q9P0W5 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
SCHIP1Q9P0W5 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SCHIP1Q9P0W5 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SCHIP1Q9P0W5 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SCHIP1Q9P0W5 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
SCHIP1Q9P0W5 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SCHIP1Q9P0W5 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SCHIP1Q9P0W5 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
SCHIP1Q9P0W5 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SCHIP1Q9P0W5 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SCHIP1Q9P0W5 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SCHIP1Q9P0W5 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SCHIP1Q9P0W5 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SCHIP1Q9P0W5 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SCHIP1Q9P0W5 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
SCHIP1Q9P0W5 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SCHIP1Q9P0W5 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SCHIP1Q9P0W5 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SCHIP1Q9P0W5 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SCHIP1Q9P0W5 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SCHIP1Q9P0W5 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SCHIP1Q9P0W5 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SCHIP1Q9P0W5 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SCHIP1Q9P0W5 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SCHIP1Q9P0W5 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SCHIP1Q9P0W5 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SCHIP1Q9P0W5 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SCHIP1Q9P0W5 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SCHIP1Q9P0W5 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SCHIP1Q9P0W5 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SCHIP1Q9P0W5 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SCHIP1Q9P0W5 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SCHIP1Q9P0W5 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SCHIP1Q9P0W5 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SCHIP1Q9P0W5 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SCHIP1Q9P0W5 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SCHIP1Q9P0W5 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SCHIP1Q9P0W5 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SCHIP1Q9P0W5 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SCHIP1Q9P0W5 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SCHIP1Q9P0W5 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SCHIP1Q9P0W5 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SCHIP1Q9P0W5 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SCHIP1Q9P0W5 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SCHIP1Q9P0W5 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
SCHIP1Q9P0W5 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
SCHIP1Q9P0W5 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SCHIP1Q9P0W5 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SCHIP1Q9P0W5 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.5 ms