Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0W2

HMG20B, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily E member 1-related, humanhuman

Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMG20BQ9P0W2 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC28.11■■■□□ 2.09
HMG20BQ9P0W2 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
HMG20BQ9P0W2 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
HMG20BQ9P0W2 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
HMG20BQ9P0W2 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC28.1■■■□□ 2.09
HMG20BQ9P0W2 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
HMG20BQ9P0W2 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
HMG20BQ9P0W2 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
HMG20BQ9P0W2 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
HMG20BQ9P0W2 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
HMG20BQ9P0W2 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
HMG20BQ9P0W2 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
HMG20BQ9P0W2 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
HMG20BQ9P0W2 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
HMG20BQ9P0W2 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
HMG20BQ9P0W2 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
HMG20BQ9P0W2 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.09■■■□□ 2.09
HMG20BQ9P0W2 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
HMG20BQ9P0W2 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
HMG20BQ9P0W2 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
HMG20BQ9P0W2 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
HMG20BQ9P0W2 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
HMG20BQ9P0W2 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
HMG20BQ9P0W2 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC28.08■■■□□ 2.09
HMG20BQ9P0W2 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
HMG20BQ9P0W2 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
HMG20BQ9P0W2 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
HMG20BQ9P0W2 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
HMG20BQ9P0W2 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
HMG20BQ9P0W2 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
HMG20BQ9P0W2 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
HMG20BQ9P0W2 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
HMG20BQ9P0W2 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC28.07■■■□□ 2.08
HMG20BQ9P0W2 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
HMG20BQ9P0W2 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
HMG20BQ9P0W2 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
HMG20BQ9P0W2 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
HMG20BQ9P0W2 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
HMG20BQ9P0W2 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
HMG20BQ9P0W2 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
HMG20BQ9P0W2 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
HMG20BQ9P0W2 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
HMG20BQ9P0W2 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
HMG20BQ9P0W2 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
HMG20BQ9P0W2 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
HMG20BQ9P0W2 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
HMG20BQ9P0W2 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
HMG20BQ9P0W2 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
HMG20BQ9P0W2 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
HMG20BQ9P0W2 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
HMG20BQ9P0W2 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
HMG20BQ9P0W2 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC28.05■■■□□ 2.08
HMG20BQ9P0W2 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC28.05■■■□□ 2.08
HMG20BQ9P0W2 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
HMG20BQ9P0W2 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
HMG20BQ9P0W2 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
HMG20BQ9P0W2 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
HMG20BQ9P0W2 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
HMG20BQ9P0W2 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
HMG20BQ9P0W2 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
HMG20BQ9P0W2 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
HMG20BQ9P0W2 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
HMG20BQ9P0W2 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
HMG20BQ9P0W2 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
HMG20BQ9P0W2 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
HMG20BQ9P0W2 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
HMG20BQ9P0W2 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
HMG20BQ9P0W2 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
HMG20BQ9P0W2 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
HMG20BQ9P0W2 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
HMG20BQ9P0W2 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC28.03■■■□□ 2.08
HMG20BQ9P0W2 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
HMG20BQ9P0W2 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
HMG20BQ9P0W2 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
HMG20BQ9P0W2 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
HMG20BQ9P0W2 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
HMG20BQ9P0W2 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
HMG20BQ9P0W2 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
HMG20BQ9P0W2 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
HMG20BQ9P0W2 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
HMG20BQ9P0W2 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
HMG20BQ9P0W2 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
HMG20BQ9P0W2 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
HMG20BQ9P0W2 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
HMG20BQ9P0W2 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
HMG20BQ9P0W2 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
HMG20BQ9P0W2 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
HMG20BQ9P0W2 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
HMG20BQ9P0W2 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
HMG20BQ9P0W2 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
HMG20BQ9P0W2 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC28■■■□□ 2.07
HMG20BQ9P0W2 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
HMG20BQ9P0W2 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
HMG20BQ9P0W2 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
HMG20BQ9P0W2 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
HMG20BQ9P0W2 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
HMG20BQ9P0W2 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
HMG20BQ9P0W2 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
HMG20BQ9P0W2 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
HMG20BQ9P0W2 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.3 ms